Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NanogQ80Z64 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NanogQ80Z64 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NanogQ80Z64 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NanogQ80Z64 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NanogQ80Z64 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NanogQ80Z64 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NanogQ80Z64 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NanogQ80Z64 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NanogQ80Z64 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NanogQ80Z64 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NanogQ80Z64 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NanogQ80Z64 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NanogQ80Z64 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NanogQ80Z64 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NanogQ80Z64 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NanogQ80Z64 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NanogQ80Z64 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NanogQ80Z64 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NanogQ80Z64 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NanogQ80Z64 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NanogQ80Z64 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NanogQ80Z64 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NanogQ80Z64 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NanogQ80Z64 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NanogQ80Z64 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NanogQ80Z64 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NanogQ80Z64 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NanogQ80Z64 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NanogQ80Z64 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NanogQ80Z64 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NanogQ80Z64 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NanogQ80Z64 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NanogQ80Z64 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NanogQ80Z64 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NanogQ80Z64 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NanogQ80Z64 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NanogQ80Z64 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NanogQ80Z64 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NanogQ80Z64 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NanogQ80Z64 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NanogQ80Z64 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NanogQ80Z64 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NanogQ80Z64 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NanogQ80Z64 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NanogQ80Z64 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NanogQ80Z64 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NanogQ80Z64 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NanogQ80Z64 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NanogQ80Z64 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NanogQ80Z64 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NanogQ80Z64 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NanogQ80Z64 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NanogQ80Z64 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NanogQ80Z64 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NanogQ80Z64 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NanogQ80Z64 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NanogQ80Z64 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NanogQ80Z64 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NanogQ80Z64 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NanogQ80Z64 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NanogQ80Z64 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NanogQ80Z64 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NanogQ80Z64 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NanogQ80Z64 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NanogQ80Z64 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NanogQ80Z64 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NanogQ80Z64 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NanogQ80Z64 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NanogQ80Z64 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NanogQ80Z64 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NanogQ80Z64 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NanogQ80Z64 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NanogQ80Z64 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NanogQ80Z64 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NanogQ80Z64 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NanogQ80Z64 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NanogQ80Z64 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NanogQ80Z64 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NanogQ80Z64 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NanogQ80Z64 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NanogQ80Z64 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NanogQ80Z64 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NanogQ80Z64 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NanogQ80Z64 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NanogQ80Z64 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
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