RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000112552.1

Uhrf2-202, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Uhrf2, Length 1,464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa62.08■■■■■ 7.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 NischQ80TM9 1593 aa61.4■■■■■ 7.42
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Abcc9P70170 1546 aa59.45■■■■■ 7.11
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Abcc8B2RUS7 1588 aa59.31■■■■■ 7.09
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 ScribQ80U72 1612 aa57.07■■■■■ 6.73
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 NacadQ5SWP3 1504 aa55.25■■■■■ 6.44
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Kdm5dQ62240 1548 aa55.24■■■■■ 6.43
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Dcaf1Q80TR8 1506 aa54.57■■■■■ 6.33
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Sycp2Q9CUU3 1500 aa54.18■■■■■ 6.26
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa53.55■■■■■ 6.16
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 BicraF8VPZ9 1578 aa53.42■■■■■ 6.14
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Rhox8Q6VSS7 320 aa53.32■■■■■ 6.13
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Baz1aO88379 1555 aa52.79■■■■■ 6.04
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ccdc180J3QNE4 1664 aa52.72■■■■■ 6.03
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Crybg2B7ZCC2 1516 aa52.49■■■■■ 5.99
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP52.01■■■■■ 5.92
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP51.81■■■■■ 5.88
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa51.63■■■■■ 5.86
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP51.38■■■■■ 5.82
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP51.32■■■■■ 5.81
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Smarca2Q6DIC0 1577 aa51.28■■■■■ 5.8
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP51.08■■■■■ 5.77
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa51.08■■■■■ 5.77
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa50.77■■■■■ 5.72
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ercc6F8VPZ5 1481 aa50.74■■■■■ 5.71
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Rtl1Q7M732 1744 aa50.63■■■■■ 5.7
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa50.53■■■■■ 5.68
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Wdr62Q3U3T8 1523 aa50.3■■■■■ 5.64
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Frmpd1A2AKB4 1549 aa50.24■■■■■ 5.63
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Fam135aQ6NS59 1506 aa50.21■■■■■ 5.63
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 CftrP26361 1476 aa49.92■■■■■ 5.58
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa49.88■■■■■ 5.58
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP49.87■■■■■ 5.57
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Synj1Q8CHC4 1574 aa49.87■■■■■ 5.57
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa49.84■■■■■ 5.57
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP49.82■■■■■ 5.57
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Unc13aQ4KUS2 1712 aa49.6■■■■■ 5.53
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Baz1bQ9Z277 1479 aa49.49■■■■■ 5.51
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ubl4bQ9CQ84 188 aa49.43■■■■■ 5.5
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Trim41Q5NCC3 630 aa49.06■■■■■ 5.44
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP49.03■■■■■ 5.44
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Mrc2Q64449 1479 aa49.02■■■■■ 5.44
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP48.62■■■■■ 5.37
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Kif15Q6P9L6 1387 aa48.54■■■■■ 5.36
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Cux2P70298 1426 aa48.45■■■■■ 5.35
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Lamc3Q9R0B6 1581 aa48.4■■■■■ 5.34
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Golga3P55937 1487 aa48.19■■■■■ 5.31
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Top2bQ64511 1612 aa48.12■■■■■ 5.29
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Kif21aQ9QXL2 1672 aa48.03■■■■■ 5.28
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Cngb1E1AZ71 1325 aa48.02■■■■■ 5.28
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa47.97■■■■■ 5.27
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 TnnQ80Z71 1560 aa47.94■■■■■ 5.27
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP47.91■■■■■ 5.26
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Cep164Q5DU05 1446 aa47.77■■■■■ 5.24
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ccdc18Q640L5 1455 aa47.63■■■■■ 5.22
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Il27Q8K3I6 234 aa47.59■■■■■ 5.21
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Fmn1Q05860 1466 aa47.58■■■■■ 5.21
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Camsap1A2AHC3 1581 aa47.58■■■■■ 5.21
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP47.31■■■■■ 5.16
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Plb1Q3TTY0 1478 aa47.25■■■■■ 5.15
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Crocc2F6XLV1 1638 aa47.21■■■■■ 5.15
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP47.14■■■■■ 5.14
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa47.01■■■■■ 5.12
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Grin2bQ01097 1482 aa46.95■■■■■ 5.11
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Duox2A2AQ99 1517 aa46.93■■■■■ 5.1
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Ift140E9PY46 1464 aa46.8■■■■■ 5.08
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Chic1Q8CBW7 227 aa46.72■■■■■ 5.07
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Rusc2Q80U22 1514 aa46.6■■■■■ 5.05
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Samd9lQ69Z37 1561 aa46.6■■■■■ 5.05
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Efcab5A0JP43 1406 aa46.58■■■■■ 5.05
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Disp1Q3TDN0 1521 aa46.56■■■■■ 5.04
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Shroom2A2ALU4 1481 aa46.5■■■■■ 5.03
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 NrkQ9R0G8 1455 aa46.46■■■■■ 5.03
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Dnajc5P60904 198 aa46.38■■■■■ 5.01
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP46.32■■■■■ 5
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Setd1bQ8CFT2 1985 aa46.31■■■■■ 5
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 PtprkP35822 1457 aa46.3■■■■■ 5
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Rad54l2Q99NG0 1466 aa46.3■■■■■ 5
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Shroom4Q1W617 1475 aa46.29■■■■■ 5
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa46.2■■■■■ 4.99
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Magi3Q9EQJ9 1476 aa46.15■■■■■ 4.98
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Grin2aP35436 1464 aa46.12■■■■■ 4.97
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 SynmQ70IV5 1561 aa45.97■■■■■ 4.95
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.94
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Pla2r1Q62028 1487 aa45.91■■■■■ 4.94
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 HrcG5E8J6 738 aa45.87■■■■■ 4.93
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Col17a1Q07563 1470 aa45.83■■■■■ 4.93
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Gpatch8A2A6A1 1505 aa45.82■■■■■ 4.93
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Zeb1Q64318 1117 aa45.81■■■■■ 4.92
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Npm2Q80W85 207 aa45.74■■■■■ 4.91
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Fgd6Q69ZL1 1399 aa45.69■■■■■ 4.9
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa45.67■■■■■ 4.9
Uhrf2-202ENSMUST00000112552 Gab3Q8BSM5 595 aa45.59■■■■■ 4.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.9 ms