Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Rexo1Q7TT28 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Rexo1Q7TT28 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29,21■■■□□ 2,27
Rexo1Q7TT28 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Rexo1Q7TT28 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
Rexo1Q7TT28 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Rexo1Q7TT28 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Rexo1Q7TT28 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Rexo1Q7TT28 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Rexo1Q7TT28 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Rexo1Q7TT28 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Rexo1Q7TT28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Rexo1Q7TT28 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Rexo1Q7TT28 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Rexo1Q7TT28 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Rexo1Q7TT28 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Rexo1Q7TT28 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Rexo1Q7TT28 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Rexo1Q7TT28 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Rexo1Q7TT28 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Rexo1Q7TT28 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Rexo1Q7TT28 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Rexo1Q7TT28 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Rexo1Q7TT28 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Rexo1Q7TT28 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Rexo1Q7TT28 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Rexo1Q7TT28 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Rexo1Q7TT28 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Rexo1Q7TT28 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Rexo1Q7TT28 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Rexo1Q7TT28 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Rexo1Q7TT28 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Rexo1Q7TT28 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Rexo1Q7TT28 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Rexo1Q7TT28 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Rexo1Q7TT28 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Rexo1Q7TT28 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Rexo1Q7TT28 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Rexo1Q7TT28 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Rexo1Q7TT28 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Rexo1Q7TT28 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Rexo1Q7TT28 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Rexo1Q7TT28 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Rexo1Q7TT28 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Rexo1Q7TT28 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Rexo1Q7TT28 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Rexo1Q7TT28 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Rexo1Q7TT28 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Rexo1Q7TT28 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Rexo1Q7TT28 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Rexo1Q7TT28 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rexo1Q7TT28 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rexo1Q7TT28 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Rexo1Q7TT28 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Rexo1Q7TT28 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Rexo1Q7TT28 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Rexo1Q7TT28 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Rexo1Q7TT28 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Rexo1Q7TT28 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Rexo1Q7TT28 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Rexo1Q7TT28 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rexo1Q7TT28 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Rexo1Q7TT28 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Rexo1Q7TT28 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Rexo1Q7TT28 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rexo1Q7TT28 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Rexo1Q7TT28 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Rexo1Q7TT28 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Rexo1Q7TT28 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Rexo1Q7TT28 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Rexo1Q7TT28 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Rexo1Q7TT28 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Rexo1Q7TT28 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Rexo1Q7TT28 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Rexo1Q7TT28 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Rexo1Q7TT28 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Rexo1Q7TT28 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Rexo1Q7TT28 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Rexo1Q7TT28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Rexo1Q7TT28 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Rexo1Q7TT28 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,39■■■□□ 2,13
Rexo1Q7TT28 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rexo1Q7TT28 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rexo1Q7TT28 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Rexo1Q7TT28 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Rexo1Q7TT28 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Rexo1Q7TT28 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Rexo1Q7TT28 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Rexo1Q7TT28 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Rexo1Q7TT28 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Rexo1Q7TT28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Rexo1Q7TT28 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Rexo1Q7TT28 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Rexo1Q7TT28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Rexo1Q7TT28 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Rexo1Q7TT28 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Rexo1Q7TT28 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Rexo1Q7TT28 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Rexo1Q7TT28 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Rexo1Q7TT28 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms