Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTC19Q6DKK2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC19Q6DKK2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC19Q6DKK2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTC19Q6DKK2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC19Q6DKK2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTC19Q6DKK2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC19Q6DKK2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC19Q6DKK2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC19Q6DKK2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC19Q6DKK2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC19Q6DKK2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TTC19Q6DKK2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TTC19Q6DKK2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTC19Q6DKK2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTC19Q6DKK2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC19Q6DKK2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTC19Q6DKK2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTC19Q6DKK2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC19Q6DKK2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC19Q6DKK2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC19Q6DKK2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTC19Q6DKK2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC19Q6DKK2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC19Q6DKK2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTC19Q6DKK2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC19Q6DKK2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTC19Q6DKK2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTC19Q6DKK2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC19Q6DKK2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTC19Q6DKK2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTC19Q6DKK2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC19Q6DKK2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC19Q6DKK2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC19Q6DKK2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTC19Q6DKK2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC19Q6DKK2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TTC19Q6DKK2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC19Q6DKK2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC19Q6DKK2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC19Q6DKK2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC19Q6DKK2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTC19Q6DKK2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC19Q6DKK2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC19Q6DKK2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC19Q6DKK2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC19Q6DKK2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC19Q6DKK2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC19Q6DKK2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC19Q6DKK2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC19Q6DKK2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC19Q6DKK2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC19Q6DKK2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC19Q6DKK2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC19Q6DKK2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC19Q6DKK2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC19Q6DKK2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC19Q6DKK2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC19Q6DKK2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTC19Q6DKK2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC19Q6DKK2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC19Q6DKK2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC19Q6DKK2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTC19Q6DKK2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC19Q6DKK2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC19Q6DKK2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC19Q6DKK2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC19Q6DKK2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC19Q6DKK2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC19Q6DKK2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC19Q6DKK2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC19Q6DKK2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC19Q6DKK2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TTC19Q6DKK2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC19Q6DKK2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC19Q6DKK2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC19Q6DKK2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC19Q6DKK2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC19Q6DKK2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC19Q6DKK2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC19Q6DKK2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC19Q6DKK2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC19Q6DKK2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC19Q6DKK2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTC19Q6DKK2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC19Q6DKK2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC19Q6DKK2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms