Protein–RNA interactions for Protein: Q562E2

Kctd19, BTB/POZ domain-containing protein KCTD19, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd19Q562E2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kctd19Q562E2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kctd19Q562E2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kctd19Q562E2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kctd19Q562E2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kctd19Q562E2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kctd19Q562E2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kctd19Q562E2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kctd19Q562E2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kctd19Q562E2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Kctd19Q562E2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kctd19Q562E2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kctd19Q562E2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Kctd19Q562E2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kctd19Q562E2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kctd19Q562E2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kctd19Q562E2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kctd19Q562E2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kctd19Q562E2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kctd19Q562E2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kctd19Q562E2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kctd19Q562E2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kctd19Q562E2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kctd19Q562E2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kctd19Q562E2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kctd19Q562E2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kctd19Q562E2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kctd19Q562E2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kctd19Q562E2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Kctd19Q562E2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kctd19Q562E2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Kctd19Q562E2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kctd19Q562E2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kctd19Q562E2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kctd19Q562E2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kctd19Q562E2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kctd19Q562E2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kctd19Q562E2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kctd19Q562E2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Kctd19Q562E2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kctd19Q562E2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kctd19Q562E2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Kctd19Q562E2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kctd19Q562E2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kctd19Q562E2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kctd19Q562E2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kctd19Q562E2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Kctd19Q562E2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kctd19Q562E2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kctd19Q562E2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kctd19Q562E2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kctd19Q562E2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kctd19Q562E2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kctd19Q562E2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kctd19Q562E2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kctd19Q562E2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kctd19Q562E2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kctd19Q562E2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Kctd19Q562E2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kctd19Q562E2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kctd19Q562E2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kctd19Q562E2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kctd19Q562E2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kctd19Q562E2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kctd19Q562E2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Kctd19Q562E2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kctd19Q562E2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kctd19Q562E2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kctd19Q562E2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kctd19Q562E2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kctd19Q562E2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kctd19Q562E2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kctd19Q562E2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kctd19Q562E2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kctd19Q562E2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kctd19Q562E2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kctd19Q562E2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Kctd19Q562E2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kctd19Q562E2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kctd19Q562E2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Kctd19Q562E2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kctd19Q562E2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kctd19Q562E2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kctd19Q562E2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kctd19Q562E2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kctd19Q562E2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kctd19Q562E2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kctd19Q562E2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kctd19Q562E2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Kctd19Q562E2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Kctd19Q562E2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kctd19Q562E2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kctd19Q562E2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kctd19Q562E2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kctd19Q562E2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kctd19Q562E2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kctd19Q562E2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kctd19Q562E2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kctd19Q562E2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kctd19Q562E2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms