Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 ETV6-202ENST00000396373 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.67e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 MIR663AHG-208ENST00000596058 665 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.747e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.267e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.44□□□□□ -0.265e-16■■■■■ 101
LARP7Q4G0J3 SNORD3D-202ENST00000630092 217 ntBASIC10.67□□□□□ -0.75e-16■■■■■ 101
LARP7Q4G0J3 SNORD3D-201ENST00000619178 218 ntBASIC10.51□□□□□ -0.735e-16■■■■■ 101
LARP7Q4G0J3 RN7SKP127-201ENST00000410443 354 ntBASIC8.01□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 98.2
LARP7Q4G0J3 UQCC1-219ENST00000491125 990 ntTSL 515.6■□□□□ 0.091e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-213ENST00000453855 1035 ntTSL 413.48□□□□□ -0.251e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-214ENST00000457259 1987 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.351e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-210ENST00000424405 758 ntTSL 512.4□□□□□ -0.421e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-201ENST00000349714 2188 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.521e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-203ENST00000374380 2133 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-209ENST00000397556 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.531e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-206ENST00000374394 2329 ntTSL 211.65□□□□□ -0.541e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-205ENST00000374385 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.711e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-202ENST00000359226 2036 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.721e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-212ENST00000443429 692 ntTSL 510.16□□□□□ -0.781e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-218ENST00000491040 1017 ntTSL 1 (best)8.58□□□□□ -1.041e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-207ENST00000397553 566 ntTSL 58.34□□□□□ -1.071e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-211ENST00000438533 736 ntTSL 37.94□□□□□ -1.141e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.271e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 26.02□□□□□ -1.451e-37■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.118e-10■■■■■ 94.3
LARP7Q4G0J3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.188e-10■■■■■ 94.3
LARP7Q4G0J3 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.318e-10■■■■■ 94.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP241-201ENST00000464584 291 ntBASIC8.92□□□□□ -0.988e-10■■■■■ 94.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.81□□□□□ -1.487e-12■■■■■ 91.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP150-201ENST00000410516 321 ntBASIC9.93□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 88.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP204-201ENST00000365481 310 ntBASIC8.56□□□□□ -1.048e-8■■■■■ 88.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP120-201ENST00000410761 341 ntBASIC9.34□□□□□ -0.914e-11■■■■■ 88.3
LARP7Q4G0J3 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC4.99□□□□□ -1.617e-37■■■■■ 84.3
LARP7Q4G0J3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-323■■■■■ 83.6
LARP7Q4G0J3 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 23.56□□□□□ -1.841e-323■■■■■ 83.6
LARP7Q4G0J3 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.33□□□□□ -2.21e-323■■■■■ 83.6
LARP7Q4G0J3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.242e-12■■■■■ 83.4
LARP7Q4G0J3 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.662e-12■■■■■ 83.4
LARP7Q4G0J3 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.472e-12■■■■■ 83.4
LARP7Q4G0J3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.61e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 NOP53-207ENST00000598681 1358 ntTSL 521.43■■□□□ 1.021e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 NOP53-204ENST00000595143 810 ntTSL 519.57■□□□□ 0.721e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 NOP53-212ENST00000600410 4185 ntTSL 218.29■□□□□ 0.521e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 NOP53-205ENST00000597985 656 ntTSL 314.71□□□□□ -0.051e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 NOP53-202ENST00000594182 303 ntTSL 314.67□□□□□ -0.061e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC12.81□□□□□ -0.361e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 NOP53-208ENST00000598959 501 ntTSL 510.27□□□□□ -0.771e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP217-201ENST00000364640 340 ntBASIC9.1□□□□□ -0.952e-10■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)20■□□□□ 0.791e-13■■■■■ 82.2
LARP7Q4G0J3 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-13■■■■■ 82.2
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-207ENST00000507660 550 ntTSL 39.8□□□□□ -0.844e-17■■■■■ 80.6
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-212ENST00000513581 683 ntTSL 29.48□□□□□ -0.894e-17■■■■■ 80.6
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-206ENST00000505028 552 ntTSL 46.7□□□□□ -1.344e-17■■■■■ 80.6
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-203ENST00000504718 573 ntTSL 46.45□□□□□ -1.384e-17■■■■■ 80.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.4□□□□□ -1.384e-11■■■■■ 79.6
LARP7Q4G0J3 VPS13B-206ENST00000496144 5625 ntTSL 58.17□□□□□ -1.14e-9■■■■■ 79.6
LARP7Q4G0J3 VPS13B-211ENST00000522802 570 ntTSL 38.03□□□□□ -1.124e-9■■■■■ 79.6
LARP7Q4G0J3 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.284e-9■■■■■ 79.6
LARP7Q4G0J3 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.334e-9■■■■■ 79.6
LARP7Q4G0J3 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 26.9□□□□□ -1.31e-37■■■■■ 79.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.671e-37■■■■■ 79.3
LARP7Q4G0J3 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.53□□□□□ -1.846e-13■■■■■ 78.1
LARP7Q4G0J3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.065e-10■■■■■ 77
LARP7Q4G0J3 SEMA6D-212ENST00000559184 545 ntTSL 48.51□□□□□ -1.055e-10■■■■■ 77
LARP7Q4G0J3 RN7SKP139-201ENST00000410411 293 ntBASIC8.34□□□□□ -1.075e-10■■■■■ 77
LARP7Q4G0J3 H2AFY-208ENST00000506218 758 ntTSL 323.55■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-211ENST00000507868 861 ntTSL 223.21■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-212ENST00000508120 536 ntTSL 322.17■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-210ENST00000506671 1905 ntTSL 517.55■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-213ENST00000508785 966 ntTSL 215.35■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-203ENST00000360597 1772 ntTSL 513.49□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-209ENST00000506532 677 ntTSL 212.92□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 LYRM4-204ENST00000463032 1487 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-219ENST00000513210 775 ntTSL 211.92□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-206ENST00000504197 498 ntTSL 211.91□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-201ENST00000356457 3730 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-201ENST00000304332 1881 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-215ENST00000510038 1314 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-218ENST00000521499 484 ntTSL 39.42□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 LYRM4-207ENST00000480566 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-225ENST00000522835 1258 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-223ENST00000522349 531 ntTSL 58.89□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-207ENST00000517847 1947 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-228ENST00000523927 556 ntTSL 47.37□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-227ENST00000523897 871 ntTSL 37.24□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 76.2
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