Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0J3

LARP7, La-related protein 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP7Q4G0J3 ETV6-202ENST00000396373 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.67e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 MIR663AHG-208ENST00000596058 665 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.747e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.267e-9■■■■■ 101.6
LARP7Q4G0J3 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.44□□□□□ -0.265e-16■■■■■ 101
LARP7Q4G0J3 SNORD3D-202ENST00000630092 217 ntBASIC10.67□□□□□ -0.75e-16■■■■■ 101
LARP7Q4G0J3 SNORD3D-201ENST00000619178 218 ntBASIC10.51□□□□□ -0.735e-16■■■■■ 101
LARP7Q4G0J3 RN7SKP127-201ENST00000410443 354 ntBASIC8.01□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 98.2
LARP7Q4G0J3 UQCC1-219ENST00000491125 990 ntTSL 515.6■□□□□ 0.091e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-213ENST00000453855 1035 ntTSL 413.48□□□□□ -0.251e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-214ENST00000457259 1987 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.351e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-210ENST00000424405 758 ntTSL 512.4□□□□□ -0.421e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-201ENST00000349714 2188 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.521e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-203ENST00000374380 2133 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-209ENST00000397556 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.531e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-206ENST00000374394 2329 ntTSL 211.65□□□□□ -0.541e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-205ENST00000374385 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.711e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-202ENST00000359226 2036 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.721e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-212ENST00000443429 692 ntTSL 510.16□□□□□ -0.781e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-218ENST00000491040 1017 ntTSL 1 (best)8.58□□□□□ -1.041e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-207ENST00000397553 566 ntTSL 58.34□□□□□ -1.071e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-211ENST00000438533 736 ntTSL 37.94□□□□□ -1.141e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.271e-26■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 26.02□□□□□ -1.451e-37■■■■■ 95.4
LARP7Q4G0J3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.118e-10■■■■■ 94.3
LARP7Q4G0J3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.188e-10■■■■■ 94.3
LARP7Q4G0J3 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.318e-10■■■■■ 94.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP241-201ENST00000464584 291 ntBASIC8.92□□□□□ -0.988e-10■■■■■ 94.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.81□□□□□ -1.487e-12■■■■■ 91.1
LARP7Q4G0J3 RN7SKP150-201ENST00000410516 321 ntBASIC9.93□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 88.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP204-201ENST00000365481 310 ntBASIC8.56□□□□□ -1.048e-8■■■■■ 88.9
LARP7Q4G0J3 RN7SKP120-201ENST00000410761 341 ntBASIC9.34□□□□□ -0.914e-11■■■■■ 88.3
LARP7Q4G0J3 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC4.99□□□□□ -1.617e-37■■■■■ 84.3
LARP7Q4G0J3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.291e-323■■■■■ 83.6
LARP7Q4G0J3 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 23.56□□□□□ -1.841e-323■■■■■ 83.6
LARP7Q4G0J3 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.33□□□□□ -2.21e-323■■■■■ 83.6
LARP7Q4G0J3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.242e-12■■■■■ 83.4
LARP7Q4G0J3 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.662e-12■■■■■ 83.4
LARP7Q4G0J3 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.472e-12■■■■■ 83.4
LARP7Q4G0J3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.61e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 NOP53-207ENST00000598681 1358 ntTSL 521.43■■□□□ 1.021e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 NOP53-204ENST00000595143 810 ntTSL 519.57■□□□□ 0.721e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 NOP53-212ENST00000600410 4185 ntTSL 218.29■□□□□ 0.521e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 NOP53-205ENST00000597985 656 ntTSL 314.71□□□□□ -0.051e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 NOP53-202ENST00000594182 303 ntTSL 314.67□□□□□ -0.061e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC12.81□□□□□ -0.361e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 NOP53-208ENST00000598959 501 ntTSL 510.27□□□□□ -0.771e-323■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 RN7SKP217-201ENST00000364640 340 ntBASIC9.1□□□□□ -0.952e-10■■■■■ 82.3
LARP7Q4G0J3 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)20■□□□□ 0.791e-13■■■■■ 82.2
LARP7Q4G0J3 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-13■■■■■ 82.2
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-207ENST00000507660 550 ntTSL 39.8□□□□□ -0.844e-17■■■■■ 80.6
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-212ENST00000513581 683 ntTSL 29.48□□□□□ -0.894e-17■■■■■ 80.6
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-206ENST00000505028 552 ntTSL 46.7□□□□□ -1.344e-17■■■■■ 80.6
LARP7Q4G0J3 THAP9-AS1-203ENST00000504718 573 ntTSL 46.45□□□□□ -1.384e-17■■■■■ 80.6
LARP7Q4G0J3 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.4□□□□□ -1.384e-11■■■■■ 79.6
LARP7Q4G0J3 VPS13B-206ENST00000496144 5625 ntTSL 58.17□□□□□ -1.14e-9■■■■■ 79.6
LARP7Q4G0J3 VPS13B-211ENST00000522802 570 ntTSL 38.03□□□□□ -1.124e-9■■■■■ 79.6
LARP7Q4G0J3 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.284e-9■■■■■ 79.6
LARP7Q4G0J3 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.334e-9■■■■■ 79.6
LARP7Q4G0J3 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 26.9□□□□□ -1.31e-37■■■■■ 79.3
LARP7Q4G0J3 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.671e-37■■■■■ 79.3
LARP7Q4G0J3 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.53□□□□□ -1.846e-13■■■■■ 78.1
LARP7Q4G0J3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.065e-10■■■■■ 77
LARP7Q4G0J3 SEMA6D-212ENST00000559184 545 ntTSL 48.51□□□□□ -1.055e-10■■■■■ 77
LARP7Q4G0J3 RN7SKP139-201ENST00000410411 293 ntBASIC8.34□□□□□ -1.075e-10■■■■■ 77
LARP7Q4G0J3 H2AFY-208ENST00000506218 758 ntTSL 323.55■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-211ENST00000507868 861 ntTSL 223.21■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-212ENST00000508120 536 ntTSL 322.17■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-210ENST00000506671 1905 ntTSL 517.55■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-213ENST00000508785 966 ntTSL 215.35■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-203ENST00000360597 1772 ntTSL 513.49□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-209ENST00000506532 677 ntTSL 212.92□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 LYRM4-204ENST00000463032 1487 ntTSL 1 (best)12.86□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-219ENST00000513210 775 ntTSL 211.92□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-206ENST00000504197 498 ntTSL 211.91□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-201ENST00000356457 3730 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-201ENST00000304332 1881 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 H2AFY-215ENST00000510038 1314 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-218ENST00000521499 484 ntTSL 39.42□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 LYRM4-207ENST00000480566 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-225ENST00000522835 1258 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-223ENST00000522349 531 ntTSL 58.89□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-207ENST00000517847 1947 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-228ENST00000523927 556 ntTSL 47.37□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 76.2
LARP7Q4G0J3 ASPH-227ENST00000523897 871 ntTSL 37.24□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 76.2
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