Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 PSMD2-212ENST00000473991 590 ntTSL 315.54■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 29.6
G3BP1Q13283 ADH5-206ENST00000507102 570 ntTSL 28.07□□□□□ -1.127e-13■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 ADH5-202ENST00000502386 545 ntTSL 57.34□□□□□ -1.237e-13■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-208ENST00000478116 641 ntTSL 221.39■■□□□ 1.014e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.914e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-211ENST00000482482 486 ntTSL 520.61■□□□□ 0.894e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.854e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.674e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.494e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-212ENST00000483615 822 ntTSL 317.48■□□□□ 0.394e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 TBRG4-217ENST00000495973 3409 ntTSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 29.5
G3BP1Q13283 SEC23A-214ENST00000557437 575 ntTSL 418.53■□□□□ 0.566e-10■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 LTB4R2-201ENST00000527924 710 ntTSL 329.99■■■□□ 2.392e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 UNG-203ENST00000446767 2016 ntTSL 1 (best)23.8■■□□□ 1.42e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.372e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 SUPT5H-210ENST00000598117 859 ntTSL 223.27■■□□□ 1.322e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.32e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.082e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.952e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 UNG-204ENST00000539287 2234 ntTSL 520.87■□□□□ 0.932e-8■■■■■ 29.4
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G3BP1Q13283 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.672e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-208ENST00000504366 3494 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HARS-211ENST00000509087 619 ntTSL 211.86□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 ADHFE1-218ENST00000523113 557 ntTSL 25.2□□□□□ -1.582e-8■■■■■ 29.4
G3BP1Q13283 HECTD1-205ENST00000554027 556 ntTSL 24.22□□□□□ -1.732e-8■■■■■ 29.3
G3BP1Q13283 SEC16A-209ENST00000472305 537 ntTSL 315.96■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 29.3
G3BP1Q13283 ALDH1A1-203ENST00000419959 806 ntTSL 58.98□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 29.2
G3BP1Q13283 RXRB-204ENST00000483281 1977 ntTSL 525.68■■□□□ 1.78e-8■■■■■ 29.2
G3BP1Q13283 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.158e-8■■■■■ 29.2
G3BP1Q13283 RXRB-203ENST00000481441 1330 ntTSL 221.28■■□□□ 18e-8■■■■■ 29.2
G3BP1Q13283 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.898e-8■■■■■ 29.2
G3BP1Q13283 PSME1-207ENST00000560420 922 ntTSL 218.15■□□□□ 0.54e-12■■■■■ 29.2
G3BP1Q13283 PSME1-204ENST00000558112 651 ntTSL 511.41□□□□□ -0.584e-12■■■■■ 29.2
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G3BP1Q13283 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.045e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.545e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC8.67□□□□□ -1.025e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.795e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 TRIM47-204ENST00000587339 1907 ntTSL 1 (best)24.43■■□□□ 1.52e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.312e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 TRIM47-206ENST00000592942 793 ntTSL 218.99■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 IQGAP2-213ENST00000512256 583 ntTSL 39.68□□□□□ -0.863e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 IQGAP2-206ENST00000504477 2039 ntTSL 57.79□□□□□ -1.163e-8■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.46e-7■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.486e-7■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 411.05□□□□□ -0.646e-7■■■■■ 28.9
G3BP1Q13283 PSMB3-210ENST00000618159 562 ntTSL 211.09□□□□□ -0.638e-10■■■■■ 28.8
G3BP1Q13283 NME1-210ENST00000512768 1056 ntTSL 1 (best)22.24■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 28.8
G3BP1Q13283 NME1-208ENST00000487481 987 ntTSL 218.6■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 28.8
G3BP1Q13283 NME1-205ENST00000465188 521 ntTSL 211.73□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 28.8
G3BP1Q13283 NME1-204ENST00000456492 510 ntTSL 25.96□□□□□ -1.461e-6■■■■■ 28.8
G3BP1Q13283 PSMD2-220ENST00000496925 723 ntTSL 212.63□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 28.8
G3BP1Q13283 LDHAP7-201ENST00000398295 965 ntBASIC11.22□□□□□ -0.616e-12■■■■■ 28.7
G3BP1Q13283 PRDX1-206ENST00000483583 530 ntTSL 227.8■■■□□ 2.042e-13■■■■■ 28.7
G3BP1Q13283 APEH-213ENST00000480772 703 ntTSL 216.12■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 28.7
G3BP1Q13283 ERBB3-216ENST00000550869 572 ntTSL 414.93□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 CTNNB1-213ENST00000482042 1366 ntTSL 28.25□□□□□ -1.091e-9■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.212e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.922e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.792e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.782e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.772e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.142e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.042e-7■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 PSME1-209ENST00000561142 865 ntTSL 516.54■□□□□ 0.241e-12■■■■■ 28.6
G3BP1Q13283 DCTN1-217ENST00000463583 569 ntTSL 422.14■■□□□ 1.131e-13■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 DCTN1-219ENST00000470351 557 ntTSL 218.88■□□□□ 0.611e-13■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 319.83■□□□□ 0.775e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.153e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 MACF1-223ENST00000496360 2080 ntTSL 217.09■□□□□ 0.333e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 ABCF1-204ENST00000468958 606 ntTSL 315.49■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 MACF1-225ENST00000497807 2689 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 PTPA-211ENST00000417504 567 ntTSL 410.01□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 MACF1-206ENST00000422234 477 ntTSL 59.47□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 MACF1-210ENST00000462496 526 ntTSL 36.13□□□□□ -1.433e-8■■■■■ 28.5
G3BP1Q13283 PRPF8-212ENST00000575116 460 ntTSL 314.75□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 28.4
G3BP1Q13283 LDHA-216ENST00000538451 1345 ntTSL 212.49□□□□□ -0.413e-16■■■■■ 28.3
G3BP1Q13283 PSMB6-204ENST00000575643 666 ntTSL 216.33■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 28.2
G3BP1Q13283 PEPD-212ENST00000593163 1045 ntTSL 222.6■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 28.2
G3BP1Q13283 PEPD-209ENST00000590755 547 ntTSL 321.16■□□□□ 0.981e-6■■■■■ 28.2
G3BP1Q13283 PEPD-213ENST00000609145 570 ntTSL 213.45□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 28.2
G3BP1Q13283 PEPD-207ENST00000590408 433 ntTSL 312.1□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 28.2
G3BP1Q13283 GCN1-206ENST00000549815 543 ntTSL 316.6■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 MORC2-202ENST00000397641 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 MORC2-201ENST00000215862 4469 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 AARS-204ENST00000566969 610 ntTSL 212.14□□□□□ -0.472e-14■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 PDCD4-211ENST00000498367 975 ntTSL 38.3□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.654e-6■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 PLIN3-205ENST00000589163 1699 ntTSL 318.27■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 28.1
G3BP1Q13283 PRKDC-210ENST00000541488 719 ntTSL 33.51□□□□□ -1.851e-7■■■■■ 28
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