Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.755e-8■■■■■ 27.2
SRSF9Q13242 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.995e-8■■■■■ 27.2
SRSF9Q13242 METTL17-217ENST00000555640 2887 ntTSL 58.71□□□□□ -1.025e-8■■■■■ 27.2
SRSF9Q13242 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.035e-8■■■■■ 27.2
SRSF9Q13242 METTL17-216ENST00000555533 1605 ntTSL 1 (best)7.84□□□□□ -1.155e-8■■■■■ 27.2
SRSF9Q13242 METTL17-224ENST00000557550 1529 ntTSL 57.22□□□□□ -1.255e-8■■■■■ 27.2
SRSF9Q13242 METTL17-211ENST00000554849 915 ntTSL 56.48□□□□□ -1.375e-8■■■■■ 27.2
SRSF9Q13242 METTL17-203ENST00000553389 952 ntTSL 25.94□□□□□ -1.465e-8■■■■■ 27.2
SRSF9Q13242 METTL17-208ENST00000554354 249 ntTSL 54.3□□□□□ -1.725e-8■■■■■ 27.2
SRSF9Q13242 AC132008.2-201ENST00000453454 956 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.184e-8■■■■■ 27.2
SRSF9Q13242 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.743e-21■■■■■ 26.9
SRSF9Q13242 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.753e-21■■■■■ 26.9
SRSF9Q13242 CTAGE5-213ENST00000555716 558 ntTSL 44.11□□□□□ -1.753e-21■■■■■ 26.9
SRSF9Q13242 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.773e-21■■■■■ 26.9
SRSF9Q13242 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.783e-21■■■■■ 26.9
SRSF9Q13242 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.783e-21■■■■■ 26.9
SRSF9Q13242 CTAGE5-211ENST00000554392 527 ntTSL 43.84□□□□□ -1.793e-21■■■■■ 26.9
SRSF9Q13242 NASP-208ENST00000470768 1036 ntTSL 39□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 37.58□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 27.26□□□□□ -1.251e-8■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 57.2□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 57.17□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 27.16□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.351e-8■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.05□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.521e-8■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 RERE-207ENST00000464972 743 ntTSL 55.1□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 26.8
SRSF9Q13242 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.551e-7■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.641e-7■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.661e-7■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.423e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.173e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.13e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -03e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-215ENST00000450019 1689 ntTSL 514.91□□□□□ -0.023e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.033e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.13e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.143e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-208ENST00000430807 733 ntTSL 313.98□□□□□ -0.173e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.173e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.223e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-206ENST00000411907 568 ntTSL 413.61□□□□□ -0.233e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.333e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 ETS2-203ENST00000432278 1033 ntTSL 511.94□□□□□ -0.53e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-211ENST00000434168 862 ntTSL 311.59□□□□□ -0.553e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 PPP1R3E-209ENST00000561437 690 ntTSL 211.55□□□□□ -0.563e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-203ENST00000399807 2241 ntTSL 511.51□□□□□ -0.573e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 410.95□□□□□ -0.663e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.683e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-216ENST00000450664 570 ntTSL 410.79□□□□□ -0.683e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.683e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.693e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 PPP1R3E-206ENST00000560913 932 ntTSL 210.65□□□□□ -0.73e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 ATP9B-222ENST00000590477 1784 ntTSL 210.55□□□□□ -0.723e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.733e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-226ENST00000490583 888 ntTSL 310.42□□□□□ -0.743e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-218ENST00000462579 649 ntTSL 410.06□□□□□ -0.83e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.823e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.833e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 PPP1R3E-203ENST00000559314 2351 ntTSL 29.83□□□□□ -0.843e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 ATP9B-219ENST00000589951 585 ntTSL 49.48□□□□□ -0.893e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 ATP9B-216ENST00000588921 1511 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.963e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-208ENST00000515130 3314 ntTSL 59□□□□□ -0.973e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -13e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC8.72□□□□□ -1.013e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-213ENST00000444651 847 ntTSL 38.67□□□□□ -1.023e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.053e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 TANGO2-224ENST00000485715 617 ntTSL 58.33□□□□□ -1.083e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 PPP1R3E-202ENST00000558058 3222 ntTSL 37.9□□□□□ -1.143e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.163e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.173e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-254ENST00000641882 1792 nt7.41□□□□□ -1.223e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 PRKAB2-202ENST00000474939 578 ntTSL 47.4□□□□□ -1.223e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.233e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-206ENST00000509826 1720 ntTSL 27.24□□□□□ -1.253e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-257ENST00000642012 1711 nt7□□□□□ -1.293e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-259ENST00000642042 2303 ntBASIC6.62□□□□□ -1.353e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-215ENST00000641146 4780 nt6.51□□□□□ -1.373e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC6.18□□□□□ -1.423e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-222ENST00000641332 2759 nt6.02□□□□□ -1.453e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 ATP9B-212ENST00000587919 509 ntTSL 35.95□□□□□ -1.463e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 PPP1R3E-204ENST00000559942 1187 ntTSL 1 (best)5.72□□□□□ -1.493e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-223ENST00000641340 2098 nt5.65□□□□□ -1.53e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC5.64□□□□□ -1.513e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-207ENST00000513559 1813 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.513e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-253ENST00000641870 2109 nt5.52□□□□□ -1.533e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.553e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-251ENST00000641843 1596 nt5.32□□□□□ -1.563e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-244ENST00000641742 1823 nt5.25□□□□□ -1.573e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-246ENST00000641748 3201 nt5.15□□□□□ -1.593e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC5.05□□□□□ -1.63e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-226ENST00000641388 778 nt5.03□□□□□ -1.63e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-247ENST00000641753 3007 nt4.68□□□□□ -1.663e-8■■■■□ 26.7
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