Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 YAT1YAR035W 2064 nt10.91□□□□□ -0.66
SEC39Q12745 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.9□□□□□ -0.66
SEC39Q12745 FRD1YEL047C 1413 nt10.9□□□□□ -0.66
SEC39Q12745 YLR235CYLR235C 399 nt10.88□□□□□ -0.67
SEC39Q12745 YCL042WYCL042W 360 nt10.88□□□□□ -0.67
SEC39Q12745 NDI1YML120C 1542 nt10.88□□□□□ -0.67
SEC39Q12745 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.86□□□□□ -0.67
SEC39Q12745 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.86□□□□□ -0.67
SEC39Q12745 YKL030WYKL030W 606 nt10.86□□□□□ -0.67
SEC39Q12745 IRC24YIR036C 792 nt10.85□□□□□ -0.67
SEC39Q12745 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.84□□□□□ -0.67
SEC39Q12745 RRD1YIL153W 1182 nt10.83□□□□□ -0.68
SEC39Q12745 SOR2YDL246C 1074 nt10.82□□□□□ -0.68
SEC39Q12745 SOR1YJR159W 1074 nt10.82□□□□□ -0.68
SEC39Q12745 PCM1YEL058W 1674 nt10.82□□□□□ -0.68
SEC39Q12745 YGR259CYGR259C 441 nt10.8□□□□□ -0.68
SEC39Q12745 PTH1YHR189W 573 nt10.8□□□□□ -0.68
SEC39Q12745 RAX1YOR301W 1308 nt10.78□□□□□ -0.68
SEC39Q12745 WSC2YNL283C 1512 nt10.78□□□□□ -0.68
SEC39Q12745 FMP52YER004W 696 nt10.76□□□□□ -0.69
SEC39Q12745 CRR1YLR213C 1269 nt10.76□□□□□ -0.69
SEC39Q12745 ERF2YLR246W 1080 nt10.75□□□□□ -0.69
SEC39Q12745 SNG1YGR197C 1644 nt10.73□□□□□ -0.69
SEC39Q12745 SPT20YOL148C 1815 nt10.7□□□□□ -0.7
SEC39Q12745 FMT1YBL013W 1206 nt10.68□□□□□ -0.7
SEC39Q12745 RIM8YGL045W 1629 nt10.67□□□□□ -0.7
SEC39Q12745 MIC10YCL057C-A 294 nt10.67□□□□□ -0.7
SEC39Q12745 HEM12YDR047W 1089 nt10.66□□□□□ -0.7
SEC39Q12745 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.65□□□□□ -0.7
SEC39Q12745 YCL074WYCL074W 927 nt10.64□□□□□ -0.71
SEC39Q12745 DUS1YML080W 1272 nt10.63□□□□□ -0.71
SEC39Q12745 YFR018CYFR018C 1092 nt10.62□□□□□ -0.71
SEC39Q12745 RRT5YFR032C 870 nt10.62□□□□□ -0.71
SEC39Q12745 SNF6YHL025W 999 nt10.61□□□□□ -0.71
SEC39Q12745 CWP1YKL096W 720 nt10.61□□□□□ -0.71
SEC39Q12745 TIM23YNR017W 669 nt10.61□□□□□ -0.71
SEC39Q12745 RPM1RPM1 483 nt10.6□□□□□ -0.71
SEC39Q12745 PAU16YKL224C 372 nt10.59□□□□□ -0.71
SEC39Q12745 MET2YNL277W 1461 nt10.56□□□□□ -0.72
SEC39Q12745 DIC1YLR348C 897 nt10.56□□□□□ -0.72
SEC39Q12745 ADH2YMR303C 1047 nt10.56□□□□□ -0.72
SEC39Q12745 RPC82YPR190C 1965 nt10.54□□□□□ -0.72
SEC39Q12745 YPR064WYPR064W 420 nt10.53□□□□□ -0.72
SEC39Q12745 YGL114WYGL114W 2178 nt10.53□□□□□ -0.72
SEC39Q12745 YLR179CYLR179C 606 nt10.52□□□□□ -0.73
SEC39Q12745 AGP1YCL025C 1902 nt10.52□□□□□ -0.73
SEC39Q12745 MAE1YKL029C 2010 nt10.51□□□□□ -0.73
SEC39Q12745 INA1YLR413W 2028 nt10.51□□□□□ -0.73
SEC39Q12745 ATF2YGR177C 1608 nt10.5□□□□□ -0.73
SEC39Q12745 SBA1YKL117W 651 nt10.49□□□□□ -0.73
SEC39Q12745 GPI16YHR188C 1833 nt10.47□□□□□ -0.73
SEC39Q12745 YIH1YCR059C 777 nt10.46□□□□□ -0.73
SEC39Q12745 TAD3YLR316C 969 nt10.45□□□□□ -0.74
SEC39Q12745 SFP1YLR403W 2052 nt10.45□□□□□ -0.74
SEC39Q12745 MUP1YGR055W 1725 nt10.44□□□□□ -0.74
SEC39Q12745 YLL053CYLL053C 459 nt10.44□□□□□ -0.74
SEC39Q12745 RNQ1YCL028W 1218 nt10.44□□□□□ -0.74
SEC39Q12745 BNA2YJR078W 1362 nt10.42□□□□□ -0.74
SEC39Q12745 YFL067WYFL067W 528 nt10.42□□□□□ -0.74
SEC39Q12745 PRE6YOL038W 765 nt10.42□□□□□ -0.74
SEC39Q12745 AHT1YHR093W 549 nt10.39□□□□□ -0.75
SEC39Q12745 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.37□□□□□ -0.75
SEC39Q12745 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.37□□□□□ -0.75
SEC39Q12745 AQY1YPR192W 918 nt10.36□□□□□ -0.75
SEC39Q12745 PEX25YPL112C 1185 nt10.35□□□□□ -0.75
SEC39Q12745 NAT4YMR069W 858 nt10.34□□□□□ -0.75
SEC39Q12745 MIC12YBR262C 321 nt10.34□□□□□ -0.75
SEC39Q12745 ACO2YJL200C 2370 nt10.31□□□□□ -0.76
SEC39Q12745 STR3YGL184C 1398 nt10.28□□□□□ -0.76
SEC39Q12745 FTR1YER145C 1215 nt10.28□□□□□ -0.76
SEC39Q12745 DDR2YOL052C-A 186 nt10.28□□□□□ -0.76
SEC39Q12745 GDH3YAL062W 1374 nt10.27□□□□□ -0.76
SEC39Q12745 TRM5YHR070W 1500 nt10.27□□□□□ -0.77
SEC39Q12745 HHO1YPL127C 777 nt10.26□□□□□ -0.77
SEC39Q12745 HOL1YNR055C 1761 nt10.25□□□□□ -0.77
SEC39Q12745 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.25□□□□□ -0.77
SEC39Q12745 NPP1YCR026C 2229 nt10.25□□□□□ -0.77
SEC39Q12745 GAL1YBR020W 1587 nt10.24□□□□□ -0.77
SEC39Q12745 YLR415CYLR415C 339 nt10.24□□□□□ -0.77
SEC39Q12745 YFL066CYFL066C 1179 nt10.23□□□□□ -0.77
SEC39Q12745 ANP1YEL036C 1503 nt10.23□□□□□ -0.77
SEC39Q12745 RTN2YDL204W 1182 nt10.22□□□□□ -0.77
SEC39Q12745 TPO4YOR273C 1980 nt10.22□□□□□ -0.77
SEC39Q12745 XDJ1YLR090W 1380 nt10.21□□□□□ -0.78
SEC39Q12745 YSP3YOR003W 1437 nt10.21□□□□□ -0.78
SEC39Q12745 BDH1YAL060W 1149 nt10.2□□□□□ -0.78
SEC39Q12745 HIF1YLL022C 1158 nt10.2□□□□□ -0.78
SEC39Q12745 YNL115CYNL115C 1935 nt10.2□□□□□ -0.78
SEC39Q12745 UGA4YDL210W 1716 nt10.19□□□□□ -0.78
SEC39Q12745 HMG2YLR450W 3138 nt10.18□□□□□ -0.78
SEC39Q12745 MSF1YPR047W 1410 nt10.18□□□□□ -0.78
SEC39Q12745 AQY2YLL052C 450 nt10.18□□□□□ -0.78
SEC39Q12745 YMR209CYMR209C 1374 nt10.16□□□□□ -0.78
SEC39Q12745 SPC25YER018C 666 nt10.15□□□□□ -0.78
SEC39Q12745 VPS75YNL246W 795 nt10.14□□□□□ -0.79
SEC39Q12745 STB1YNL309W 1263 nt10.14□□□□□ -0.79
SEC39Q12745 CCT4YDL143W 1587 nt10.14□□□□□ -0.79
SEC39Q12745 THI74YDR438W 1113 nt10.13□□□□□ -0.79
SEC39Q12745 DUT1YBR252W 444 nt10.13□□□□□ -0.79
SEC39Q12745 SWC5YBR231C 912 nt10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms