Protein–RNA interactions for Protein: Q12697

YPK9, Vacuolar cation-transporting ATPase YPK9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPK9Q12697 AQY1YPR192W 918 nt17.72■□□□□ 0.43
YPK9Q12697 SWC5YBR231C 912 nt17.7■□□□□ 0.42
YPK9Q12697 YBR220CYBR220C 1683 nt17.7■□□□□ 0.42
YPK9Q12697 SIM1YIL123W 1431 nt17.68■□□□□ 0.42
YPK9Q12697 RRT12YCR045C 1476 nt17.66■□□□□ 0.42
YPK9Q12697 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt17.66■□□□□ 0.42
YPK9Q12697 CCT4YDL143W 1587 nt17.63■□□□□ 0.41
YPK9Q12697 STB1YNL309W 1263 nt17.63■□□□□ 0.41
YPK9Q12697 GLR1YPL091W 1452 nt17.6■□□□□ 0.41
YPK9Q12697 VPS75YNL246W 795 nt17.59■□□□□ 0.41
YPK9Q12697 ATF2YGR177C 1608 nt17.56■□□□□ 0.4
YPK9Q12697 VPS60YDR486C 690 nt17.56■□□□□ 0.4
YPK9Q12697 DAT1YML113W 747 nt17.55■□□□□ 0.4
YPK9Q12697 GPI16YHR188C 1833 nt17.54■□□□□ 0.4
YPK9Q12697 ALG3YBL082C 1377 nt17.53■□□□□ 0.4
YPK9Q12697 SPC25YER018C 666 nt17.52■□□□□ 0.4
YPK9Q12697 PAU7YAR020C 168 nt17.5■□□□□ 0.39
YPK9Q12697 SSA4YER103W 1929 nt17.5■□□□□ 0.39
YPK9Q12697 DDR2YOL052C-A 186 nt17.49■□□□□ 0.39
YPK9Q12697 RBG2YGR173W 1107 nt17.44■□□□□ 0.38
YPK9Q12697 YGL034CYGL034C 366 nt17.42■□□□□ 0.38
YPK9Q12697 NDI1YML120C 1542 nt17.41■□□□□ 0.38
YPK9Q12697 SPT8YLR055C 1809 nt17.4■□□□□ 0.38
YPK9Q12697 YHL050CYHL050C 2094 nt17.39■□□□□ 0.37
YPK9Q12697 SHB17YKR043C 816 nt17.37■□□□□ 0.37
YPK9Q12697 UBA4YHR111W 1323 nt17.36■□□□□ 0.37
YPK9Q12697 CRR1YLR213C 1269 nt17.36■□□□□ 0.37
YPK9Q12697 RBG1YAL036C 1110 nt17.35■□□□□ 0.37
YPK9Q12697 ERF2YLR246W 1080 nt17.34■□□□□ 0.37
YPK9Q12697 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt17.31■□□□□ 0.36
YPK9Q12697 YSR3YKR053C 1215 nt17.3■□□□□ 0.36
YPK9Q12697 FEN2YCR028C 1539 nt17.29■□□□□ 0.36
YPK9Q12697 YFL067WYFL067W 528 nt17.28■□□□□ 0.36
YPK9Q12697 XYL2YLR070C 1071 nt17.28■□□□□ 0.36
YPK9Q12697 TIM17YJL143W 477 nt17.27■□□□□ 0.36
YPK9Q12697 MIC10YCL057C-A 294 nt17.24■□□□□ 0.35
YPK9Q12697 ANP1YEL036C 1503 nt17.24■□□□□ 0.35
YPK9Q12697 SNG1YGR197C 1644 nt17.19■□□□□ 0.34
YPK9Q12697 SGT2YOR007C 1041 nt17.13■□□□□ 0.33
YPK9Q12697 YDR010CYDR010C 333 nt17.12■□□□□ 0.33
YPK9Q12697 SHM2YLR058C 1410 nt17.11■□□□□ 0.33
YPK9Q12697 HEM12YDR047W 1089 nt17.1■□□□□ 0.33
YPK9Q12697 PHO89YBR296C 1725 nt17.07■□□□□ 0.32
YPK9Q12697 YIR016WYIR016W 798 nt17.06■□□□□ 0.32
YPK9Q12697 RAD51YER095W 1203 nt17.04■□□□□ 0.32
YPK9Q12697 XDJ1YLR090W 1380 nt17.03■□□□□ 0.32
YPK9Q12697 AIM45YPR004C 1035 nt17.02■□□□□ 0.32
YPK9Q12697 RET2YFR051C 1641 nt16.96■□□□□ 0.31
YPK9Q12697 SAM1YLR180W 1149 nt16.96■□□□□ 0.31
YPK9Q12697 NIT1YIL164C 600 nt16.93■□□□□ 0.3
YPK9Q12697 YCR087WYCR087W 516 nt16.93■□□□□ 0.3
YPK9Q12697 YLR111WYLR111W 333 nt16.86■□□□□ 0.29
YPK9Q12697 LYS4YDR234W 2082 nt16.85■□□□□ 0.29
YPK9Q12697 SDH5YOL071W 489 nt16.8■□□□□ 0.28
YPK9Q12697 COQ2YNR041C 1119 nt16.8■□□□□ 0.28
YPK9Q12697 YMR226CYMR226C 804 nt16.79■□□□□ 0.28
YPK9Q12697 RPM1RPM1 483 nt16.78■□□□□ 0.28
YPK9Q12697 BNA2YJR078W 1362 nt16.78■□□□□ 0.28
YPK9Q12697 GDH3YAL062W 1374 nt16.78■□□□□ 0.28
YPK9Q12697 SEC11YIR022W 504 nt16.77■□□□□ 0.28
YPK9Q12697 MRP20YDR405W 792 nt16.76■□□□□ 0.27
YPK9Q12697 NCP1YHR042W 2076 nt16.72■□□□□ 0.27
YPK9Q12697 YNR029CYNR029C 1290 nt16.65■□□□□ 0.26
YPK9Q12697 MIC12YBR262C 321 nt16.65■□□□□ 0.26
YPK9Q12697 AVT6YER119C 1347 nt16.64■□□□□ 0.26
YPK9Q12697 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt16.64■□□□□ 0.25
YPK9Q12697 PCH2YBR186W 1695 nt16.63■□□□□ 0.25
YPK9Q12697 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt16.63■□□□□ 0.25
YPK9Q12697 ADH7YCR105W 1086 nt16.61■□□□□ 0.25
YPK9Q12697 SFA1YDL168W 1161 nt16.6■□□□□ 0.25
YPK9Q12697 CAB5YDR196C 726 nt16.58■□□□□ 0.24
YPK9Q12697 YGR201CYGR201C 678 nt16.58■□□□□ 0.24
YPK9Q12697 STE4YOR212W 1272 nt16.55■□□□□ 0.24
YPK9Q12697 YLR349WYLR349W 507 nt16.54■□□□□ 0.24
YPK9Q12697 YLR279WYLR279W 390 nt16.54■□□□□ 0.24
YPK9Q12697 HHO1YPL127C 777 nt16.54■□□□□ 0.24
YPK9Q12697 BDF1YLR399C 2061 nt16.52■□□□□ 0.23
YPK9Q12697 BOP3YNL042W 1191 nt16.5■□□□□ 0.23
YPK9Q12697 RPL4BYDR012W 1089 nt16.47■□□□□ 0.23
YPK9Q12697 RPS14BYJL191W 417 nt16.47■□□□□ 0.23
YPK9Q12697 RPL4AYBR031W 1089 nt16.47■□□□□ 0.23
YPK9Q12697 GUT2YIL155C 1950 nt16.46■□□□□ 0.23
YPK9Q12697 PAU15YIR041W 375 nt16.46■□□□□ 0.23
YPK9Q12697 RTF1YGL244W 1677 nt16.45■□□□□ 0.22
YPK9Q12697 TAT1YBR069C 1860 nt16.43■□□□□ 0.22
YPK9Q12697 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt16.41■□□□□ 0.22
YPK9Q12697 RAX1YOR301W 1308 nt16.4■□□□□ 0.22
YPK9Q12697 DUT1YBR252W 444 nt16.4■□□□□ 0.22
YPK9Q12697 SHH4YLR164W 507 nt16.38■□□□□ 0.21
YPK9Q12697 GOR1YNL274C 1053 nt16.35■□□□□ 0.21
YPK9Q12697 YGR012WYGR012W 1182 nt16.35■□□□□ 0.21
YPK9Q12697 YCR102CYCR102C 1107 nt16.32■□□□□ 0.2
YPK9Q12697 RAD23YEL037C 1197 nt16.32■□□□□ 0.2
YPK9Q12697 PEX2YJL210W 816 nt16.3■□□□□ 0.2
YPK9Q12697 AGP1YCL025C 1902 nt16.3■□□□□ 0.2
YPK9Q12697 CLB6YGR109C 1143 nt16.28■□□□□ 0.2
YPK9Q12697 UTH1YKR042W 1098 nt16.26■□□□□ 0.19
YPK9Q12697 TOM6YOR045W 186 nt16.26■□□□□ 0.19
YPK9Q12697 GPN2YOR262W 1044 nt16.26■□□□□ 0.19
YPK9Q12697 PIB2YGL023C 1908 nt16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms