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Protein–RNA interactions for Protein: Q12455
SPE4, Spermine synthase, yeast
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SPE4
Q12455
CCA1
YER168C
1641 nt
10.95
□□□□□ -0.66
SPE4
Q12455
YLR235C
YLR235C
399 nt
10.94
□□□□□ -0.66
SPE4
Q12455
AQY1
YPR192W
918 nt
10.94
□□□□□ -0.66
SPE4
Q12455
TIM23
YNR017W
669 nt
10.92
□□□□□ -0.66
SPE4
Q12455
ANP1
YEL036C
1503 nt
10.92
□□□□□ -0.66
SPE4
Q12455
FUR4
YBR021W
1902 nt
10.9
□□□□□ -0.67
SPE4
Q12455
GLK1
YCL040W
1503 nt
10.89
□□□□□ -0.67
SPE4
Q12455
YLR179C
YLR179C
606 nt
10.89
□□□□□ -0.67
SPE4
Q12455
STB1
YNL309W
1263 nt
10.88
□□□□□ -0.67
SPE4
Q12455
BNA2
YJR078W
1362 nt
10.88
□□□□□ -0.67
SPE4
Q12455
YDR524C-B
YDR524C-B
201 nt
10.87
□□□□□ -0.67
SPE4
Q12455
SPC25
YER018C
666 nt
10.85
□□□□□ -0.67
SPE4
Q12455
FEN2
YCR028C
1539 nt
10.83
□□□□□ -0.68
SPE4
Q12455
GPI16
YHR188C
1833 nt
10.82
□□□□□ -0.68
SPE4
Q12455
MIC12
YBR262C
321 nt
10.81
□□□□□ -0.68
SPE4
Q12455
YKL030W
YKL030W
606 nt
10.79
□□□□□ -0.68
SPE4
Q12455
WSC2
YNL283C
1512 nt
10.78
□□□□□ -0.68
SPE4
Q12455
VPS60
YDR486C
690 nt
10.77
□□□□□ -0.69
SPE4
Q12455
AHT1
YHR093W
549 nt
10.76
□□□□□ -0.69
SPE4
Q12455
CCT4
YDL143W
1587 nt
10.76
□□□□□ -0.69
SPE4
Q12455
AGP1
YCL025C
1902 nt
10.74
□□□□□ -0.69
SPE4
Q12455
YIR016W
YIR016W
798 nt
10.74
□□□□□ -0.69
SPE4
Q12455
HHO1
YPL127C
777 nt
10.73
□□□□□ -0.69
SPE4
Q12455
PRP4
YPR178W
1398 nt
10.73
□□□□□ -0.69
SPE4
Q12455
YPR064W
YPR064W
420 nt
10.72
□□□□□ -0.69
SPE4
Q12455
SWC5
YBR231C
912 nt
10.72
□□□□□ -0.69
SPE4
Q12455
DUS1
YML080W
1272 nt
10.71
□□□□□ -0.69
SPE4
Q12455
ALG3
YBL082C
1377 nt
10.71
□□□□□ -0.69
SPE4
Q12455
YEL076C-A
YEL076C-A
651 nt
10.7
□□□□□ -0.7
SPE4
Q12455
YEL076C
YEL076C
651 nt
10.7
□□□□□ -0.7
SPE4
Q12455
YLR464W
YLR464W
651 nt
10.7
□□□□□ -0.7
SPE4
Q12455
ALG12
YNR030W
1656 nt
10.67
□□□□□ -0.7
SPE4
Q12455
DPS1
YLL018C
1674 nt
10.66
□□□□□ -0.7
SPE4
Q12455
YCL074W
YCL074W
927 nt
10.65
□□□□□ -0.7
SPE4
Q12455
YGR201C
YGR201C
678 nt
10.64
□□□□□ -0.71
SPE4
Q12455
TAD3
YLR316C
969 nt
10.64
□□□□□ -0.71
SPE4
Q12455
YKR005C
YKR005C
1578 nt
10.63
□□□□□ -0.71
SPE4
Q12455
BMT6
YLR063W
1098 nt
10.62
□□□□□ -0.71
SPE4
Q12455
AAC1
YMR056C
930 nt
10.62
□□□□□ -0.71
SPE4
Q12455
XDJ1
YLR090W
1380 nt
10.59
□□□□□ -0.71
SPE4
Q12455
UME6
YDR207C
2511 nt
10.59
□□□□□ -0.71
SPE4
Q12455
RTG1
YOL067C
534 nt
10.58
□□□□□ -0.72
SPE4
Q12455
YGR259C
YGR259C
441 nt
10.55
□□□□□ -0.72
SPE4
Q12455
DUT1
YBR252W
444 nt
10.54
□□□□□ -0.72
SPE4
Q12455
RDN18-1
RDN18-1
1800 nt
10.52
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
RDN18-2
RDN18-2
1800 nt
10.52
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
RDN37-1
RDN37-1
5354 nt
10.52
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
RDN37-2
RDN37-2
5354 nt
10.52
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
BDH1
YAL060W
1149 nt
10.51
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
AVT6
YER119C
1347 nt
10.51
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
MCH5
YOR306C
1566 nt
10.51
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
STR3
YGL184C
1398 nt
10.51
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
GDH3
YAL062W
1374 nt
10.51
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
GOR1
YNL274C
1053 nt
10.5
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
SNF1
YDR477W
1902 nt
10.5
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
YLR415C
YLR415C
339 nt
10.49
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
tL(GAG)G
tL(GAG)G
82 nt
10.48
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
AQY2
YLL052C
450 nt
10.46
□□□□□ -0.73
SPE4
Q12455
BIO5
YNR056C
1686 nt
10.45
□□□□□ -0.74
SPE4
Q12455
IRC24
YIR036C
792 nt
10.44
□□□□□ -0.74
SPE4
Q12455
SHM2
YLR058C
1410 nt
10.43
□□□□□ -0.74
SPE4
Q12455
HUA1
YGR268C
597 nt
10.42
□□□□□ -0.74
SPE4
Q12455
NAR1
YNL240C
1476 nt
10.41
□□□□□ -0.74
SPE4
Q12455
TIM17
YJL143W
477 nt
10.4
□□□□□ -0.74
SPE4
Q12455
YSP3
YOR003W
1437 nt
10.38
□□□□□ -0.75
SPE4
Q12455
RTN2
YDL204W
1182 nt
10.35
□□□□□ -0.75
SPE4
Q12455
NIT1
YIL164C
600 nt
10.31
□□□□□ -0.76
SPE4
Q12455
DAT1
YML113W
747 nt
10.31
□□□□□ -0.76
SPE4
Q12455
PBP1
YGR178C
2169 nt
10.3
□□□□□ -0.76
SPE4
Q12455
YNL115C
YNL115C
1935 nt
10.29
□□□□□ -0.76
SPE4
Q12455
MRPL8
YJL063C
717 nt
10.28
□□□□□ -0.76
SPE4
Q12455
ADO1
YJR105W
1023 nt
10.27
□□□□□ -0.77
SPE4
Q12455
CYT2
YKL087C
675 nt
10.27
□□□□□ -0.77
SPE4
Q12455
SGT2
YOR007C
1041 nt
10.27
□□□□□ -0.77
SPE4
Q12455
YCR102C
YCR102C
1107 nt
10.25
□□□□□ -0.77
SPE4
Q12455
PEX25
YPL112C
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□□□□□ -0.77
SPE4
Q12455
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SPE4
Q12455
PLB1
YMR008C
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10.19
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SPE4
Q12455
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YFL066C
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10.18
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SPE4
Q12455
VPS75
YNL246W
795 nt
10.17
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SPE4
Q12455
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YLR085C
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10.16
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SPE4
Q12455
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YFR018C
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□□□□□ -0.8
SPE4
Q12455
PRM5
YIL117C
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□□□□□ -0.8
SPE4
Q12455
TIR3
YIL011W
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SPE4
Q12455
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YLL022C
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SPE4
Q12455
PAU7
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SPE4
Q12455
YAT1
YAR035W
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SPE4
Q12455
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SPE4
Q12455
LSC2
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1284 nt
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□□□□□ -0.8
SPE4
Q12455
UTR1
YJR049C
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10.03
□□□□□ -0.8
SPE4
Q12455
SHH4
YLR164W
507 nt
10.02
□□□□□ -0.81
SPE4
Q12455
PRE6
YOL038W
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10.02
□□□□□ -0.81
SPE4
Q12455
GAP1
YKR039W
1809 nt
10.01
□□□□□ -0.81
SPE4
Q12455
PRO1
YDR300C
1287 nt
10
□□□□□ -0.81
SPE4
Q12455
CMP2
YML057W
1815 nt
9.98
□□□□□ -0.81
SPE4
Q12455
SAM35
YHR083W
990 nt
9.95
□□□□□ -0.82
SPE4
Q12455
SHB17
YKR043C
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9.95
□□□□□ -0.82
SPE4
Q12455
POM34
YLR018C
900 nt
9.95
□□□□□ -0.82
SPE4
Q12455
YDR010C
YDR010C
333 nt
9.94
□□□□□ -0.82
SPE4
Q12455
ATG15
YCR068W
1563 nt
9.93
□□□□□ -0.82
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