Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YFL067WYFL067W 528 nt9.89□□□□□ -0.83
TY1A-NL1Q12391 RAX1YOR301W 1308 nt9.88□□□□□ -0.83
TY1A-NL1Q12391 FUR4YBR021W 1902 nt9.88□□□□□ -0.83
TY1A-NL1Q12391 CCA1YER168C 1641 nt9.87□□□□□ -0.83
TY1A-NL1Q12391 DIC1YLR348C 897 nt9.87□□□□□ -0.83
TY1A-NL1Q12391 GAL1YBR020W 1587 nt9.86□□□□□ -0.83
TY1A-NL1Q12391 TRM5YHR070W 1500 nt9.85□□□□□ -0.83
TY1A-NL1Q12391 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.82□□□□□ -0.84
TY1A-NL1Q12391 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.82□□□□□ -0.84
TY1A-NL1Q12391 UME6YDR207C 2511 nt9.82□□□□□ -0.84
TY1A-NL1Q12391 DDR2YOL052C-A 186 nt9.81□□□□□ -0.84
TY1A-NL1Q12391 MET8YBR213W 825 nt9.8□□□□□ -0.84
TY1A-NL1Q12391 ALG12YNR030W 1656 nt9.78□□□□□ -0.84
TY1A-NL1Q12391 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.78□□□□□ -0.84
TY1A-NL1Q12391 ANP1YEL036C 1503 nt9.77□□□□□ -0.85
TY1A-NL1Q12391 BUR6YER159C 429 nt9.75□□□□□ -0.85
TY1A-NL1Q12391 AQY1YPR192W 918 nt9.75□□□□□ -0.85
TY1A-NL1Q12391 BNA2YJR078W 1362 nt9.73□□□□□ -0.85
TY1A-NL1Q12391 PRP4YPR178W 1398 nt9.73□□□□□ -0.85
TY1A-NL1Q12391 CLB6YGR109C 1143 nt9.72□□□□□ -0.85
TY1A-NL1Q12391 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.71□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 YEL076CYEL076C 651 nt9.71□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 YLR464WYLR464W 651 nt9.71□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 MIC12YBR262C 321 nt9.7□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 PTH1YHR189W 573 nt9.69□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 STB1YNL309W 1263 nt9.69□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 Q0010Q0010 387 nt9.69□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.68□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.68□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 ARA2YMR041C 1008 nt9.68□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 DPS1YLL018C 1674 nt9.67□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 MCH5YOR306C 1566 nt9.67□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 AGP1YCL025C 1902 nt9.67□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 SPC25YER018C 666 nt9.67□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 YLR235CYLR235C 399 nt9.66□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 AAC1YMR056C 930 nt9.66□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 TIM23YNR017W 669 nt9.66□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 FEN2YCR028C 1539 nt9.65□□□□□ -0.86
TY1A-NL1Q12391 YLR179CYLR179C 606 nt9.64□□□□□ -0.87
TY1A-NL1Q12391 GPI16YHR188C 1833 nt9.63□□□□□ -0.87
TY1A-NL1Q12391 WSC2YNL283C 1512 nt9.63□□□□□ -0.87
TY1A-NL1Q12391 YKR005CYKR005C 1578 nt9.63□□□□□ -0.87
TY1A-NL1Q12391 BMT6YLR063W 1098 nt9.62□□□□□ -0.87
TY1A-NL1Q12391 SPP1YPL138C 1062 nt9.62□□□□□ -0.87
TY1A-NL1Q12391 DUS1YML080W 1272 nt9.61□□□□□ -0.87
TY1A-NL1Q12391 YCL074WYCL074W 927 nt9.6□□□□□ -0.87
TY1A-NL1Q12391 BMT5YIL096C 1011 nt9.6□□□□□ -0.87
TY1A-NL1Q12391 VPS60YDR486C 690 nt9.58□□□□□ -0.88
TY1A-NL1Q12391 HHO1YPL127C 777 nt9.58□□□□□ -0.88
TY1A-NL1Q12391 YIR016WYIR016W 798 nt9.57□□□□□ -0.88
TY1A-NL1Q12391 CCT4YDL143W 1587 nt9.56□□□□□ -0.88
TY1A-NL1Q12391 SNF1YDR477W 1902 nt9.55□□□□□ -0.88
TY1A-NL1Q12391 AHT1YHR093W 549 nt9.55□□□□□ -0.88
TY1A-NL1Q12391 YLR122CYLR122C 378 nt9.55□□□□□ -0.88
TY1A-NL1Q12391 YGR259CYGR259C 441 nt9.54□□□□□ -0.88
TY1A-NL1Q12391 ALG3YBL082C 1377 nt9.53□□□□□ -0.88
TY1A-NL1Q12391 YGR201CYGR201C 678 nt9.53□□□□□ -0.88
TY1A-NL1Q12391 SWC5YBR231C 912 nt9.52□□□□□ -0.89
TY1A-NL1Q12391 NAR1YNL240C 1476 nt9.52□□□□□ -0.89
TY1A-NL1Q12391 BIO5YNR056C 1686 nt9.51□□□□□ -0.89
TY1A-NL1Q12391 XDJ1YLR090W 1380 nt9.51□□□□□ -0.89
TY1A-NL1Q12391 YKL030WYKL030W 606 nt9.51□□□□□ -0.89
TY1A-NL1Q12391 SRN2YLR119W 642 nt9.51□□□□□ -0.89
TY1A-NL1Q12391 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1A-NL1Q12391 ABZ2YMR289W 1125 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1A-NL1Q12391 YPR064WYPR064W 420 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1A-NL1Q12391 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1A-NL1Q12391 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1A-NL1Q12391 IRC24YIR036C 792 nt9.46□□□□□ -0.9
TY1A-NL1Q12391 STR3YGL184C 1398 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1A-NL1Q12391 DUT1YBR252W 444 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1A-NL1Q12391 PBP1YGR178C 2169 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1A-NL1Q12391 YDR509WYDR509W 348 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1A-NL1Q12391 TAD3YLR316C 969 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1A-NL1Q12391 CYT2YKL087C 675 nt9.38□□□□□ -0.91
TY1A-NL1Q12391 AVT6YER119C 1347 nt9.37□□□□□ -0.91
TY1A-NL1Q12391 TOM20YGR082W 552 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1A-NL1Q12391 AQY2YLL052C 450 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1A-NL1Q12391 GOR1YNL274C 1053 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1A-NL1Q12391 GDH3YAL062W 1374 nt9.35□□□□□ -0.91
TY1A-NL1Q12391 RTN2YDL204W 1182 nt9.32□□□□□ -0.92
TY1A-NL1Q12391 LCP5YER127W 1074 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1A-NL1Q12391 BDH1YAL060W 1149 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1A-NL1Q12391 URH1YDR400W 1023 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1A-NL1Q12391 YLR415CYLR415C 339 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1A-NL1Q12391 SEM1YDR363W-A 270 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1A-NL1Q12391 Q0144Q0144 330 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1A-NL1Q12391 SHM2YLR058C 1410 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1A-NL1Q12391 RTG1YOL067C 534 nt9.26□□□□□ -0.93
TY1A-NL1Q12391 ARP10YDR106W 855 nt9.25□□□□□ -0.93
TY1A-NL1Q12391 AI5_BETAQ0075 1065 nt9.24□□□□□ -0.93
TY1A-NL1Q12391 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.24□□□□□ -0.93
TY1A-NL1Q12391 TIM17YJL143W 477 nt9.24□□□□□ -0.93
TY1A-NL1Q12391 DAT1YML113W 747 nt9.22□□□□□ -0.93
TY1A-NL1Q12391 NIT1YIL164C 600 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1A-NL1Q12391 YSP3YOR003W 1437 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1A-NL1Q12391 YAT1YAR035W 2064 nt9.17□□□□□ -0.94
TY1A-NL1Q12391 PLB1YMR008C 1995 nt9.15□□□□□ -0.95
TY1A-NL1Q12391 CMP2YML057W 1815 nt9.15□□□□□ -0.95
TY1A-NL1Q12391 NBP35YGL091C 987 nt9.14□□□□□ -0.95
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