Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

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Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 RPM1RPM1 483 nt9.46□□□□□ -0.9
TRM13Q12383 DDR2YOL052C-A 186 nt9.43□□□□□ -0.9
TRM13Q12383 NAR1YNL240C 1476 nt9.42□□□□□ -0.9
TRM13Q12383 TRM5YHR070W 1500 nt9.41□□□□□ -0.9
TRM13Q12383 FRD1YEL047C 1413 nt9.41□□□□□ -0.9
TRM13Q12383 BNA2YJR078W 1362 nt9.41□□□□□ -0.9
TRM13Q12383 GAL1YBR020W 1587 nt9.41□□□□□ -0.9
TRM13Q12383 ERV46YAL042W 1248 nt9.4□□□□□ -0.9
TRM13Q12383 YKR005CYKR005C 1578 nt9.4□□□□□ -0.9
TRM13Q12383 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.39□□□□□ -0.91
TRM13Q12383 YKR040CYKR040C 504 nt9.39□□□□□ -0.91
TRM13Q12383 WSC2YNL283C 1512 nt9.38□□□□□ -0.91
TRM13Q12383 DIC1YLR348C 897 nt9.38□□□□□ -0.91
TRM13Q12383 LPX1YOR084W 1164 nt9.35□□□□□ -0.91
TRM13Q12383 DUS1YML080W 1272 nt9.34□□□□□ -0.91
TRM13Q12383 YPR011CYPR011C 981 nt9.34□□□□□ -0.91
TRM13Q12383 AQY1YPR192W 918 nt9.34□□□□□ -0.91
TRM13Q12383 ANP1YEL036C 1503 nt9.34□□□□□ -0.91
TRM13Q12383 YCL074WYCL074W 927 nt9.33□□□□□ -0.92
TRM13Q12383 YGR259CYGR259C 441 nt9.32□□□□□ -0.92
TRM13Q12383 MIC12YBR262C 321 nt9.32□□□□□ -0.92
TRM13Q12383 BIO5YNR056C 1686 nt9.32□□□□□ -0.92
TRM13Q12383 SNF1YDR477W 1902 nt9.31□□□□□ -0.92
TRM13Q12383 IRC24YIR036C 792 nt9.29□□□□□ -0.92
TRM13Q12383 AGP1YCL025C 1902 nt9.28□□□□□ -0.92
TRM13Q12383 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.26□□□□□ -0.93
TRM13Q12383 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.26□□□□□ -0.93
TRM13Q12383 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.26□□□□□ -0.93
TRM13Q12383 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.26□□□□□ -0.93
TRM13Q12383 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.26□□□□□ -0.93
TRM13Q12383 CYT2YKL087C 675 nt9.26□□□□□ -0.93
TRM13Q12383 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.25□□□□□ -0.93
TRM13Q12383 STB1YNL309W 1263 nt9.25□□□□□ -0.93
TRM13Q12383 HHO1YPL127C 777 nt9.25□□□□□ -0.93
TRM13Q12383 PBP1YGR178C 2169 nt9.24□□□□□ -0.93
TRM13Q12383 FEN2YCR028C 1539 nt9.23□□□□□ -0.93
TRM13Q12383 SPC25YER018C 666 nt9.23□□□□□ -0.93
TRM13Q12383 GPI16YHR188C 1833 nt9.22□□□□□ -0.93
TRM13Q12383 YGR201CYGR201C 678 nt9.19□□□□□ -0.94
TRM13Q12383 YIR016WYIR016W 798 nt9.16□□□□□ -0.94
TRM13Q12383 TIM23YNR017W 669 nt9.15□□□□□ -0.94
TRM13Q12383 YLR179CYLR179C 606 nt9.14□□□□□ -0.95
TRM13Q12383 YLR235CYLR235C 399 nt9.14□□□□□ -0.95
TRM13Q12383 VPS60YDR486C 690 nt9.13□□□□□ -0.95
TRM13Q12383 XDJ1YLR090W 1380 nt9.12□□□□□ -0.95
TRM13Q12383 PTH1YHR189W 573 nt9.11□□□□□ -0.95
TRM13Q12383 STR3YGL184C 1398 nt9.11□□□□□ -0.95
TRM13Q12383 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.1□□□□□ -0.95
TRM13Q12383 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.1□□□□□ -0.95
TRM13Q12383 CCT4YDL143W 1587 nt9.1□□□□□ -0.95
TRM13Q12383 CMP2YML057W 1815 nt9.1□□□□□ -0.95
TRM13Q12383 SWC5YBR231C 912 nt9.09□□□□□ -0.95
TRM13Q12383 RTN2YDL204W 1182 nt9.06□□□□□ -0.96
TRM13Q12383 ALG3YBL082C 1377 nt9.06□□□□□ -0.96
TRM13Q12383 AHT1YHR093W 549 nt9.04□□□□□ -0.96
TRM13Q12383 AQY2YLL052C 450 nt9.04□□□□□ -0.96
TRM13Q12383 GOR1YNL274C 1053 nt9.03□□□□□ -0.96
TRM13Q12383 DUT1YBR252W 444 nt9.01□□□□□ -0.97
TRM13Q12383 AVT6YER119C 1347 nt9.01□□□□□ -0.97
TRM13Q12383 CSM2YIL132C 642 nt9□□□□□ -0.97
TRM13Q12383 YPR064WYPR064W 420 nt8.99□□□□□ -0.97
TRM13Q12383 NDI1YML120C 1542 nt8.99□□□□□ -0.97
TRM13Q12383 YAT1YAR035W 2064 nt8.97□□□□□ -0.97
TRM13Q12383 GDH3YAL062W 1374 nt8.96□□□□□ -0.98
TRM13Q12383 YKL030WYKL030W 606 nt8.95□□□□□ -0.98
TRM13Q12383 SPP1YPL138C 1062 nt8.9□□□□□ -0.98
TRM13Q12383 TAD3YLR316C 969 nt8.89□□□□□ -0.99
TRM13Q12383 SPT20YOL148C 1815 nt8.87□□□□□ -0.99
TRM13Q12383 INA1YLR413W 2028 nt8.84□□□□□ -0.99
TRM13Q12383 HSL7YBR133C 2484 nt8.83□□□□□ -1
TRM13Q12383 SHM2YLR058C 1410 nt8.83□□□□□ -1
TRM13Q12383 HIF1YLL022C 1158 nt8.82□□□□□ -1
TRM13Q12383 DAT1YML113W 747 nt8.82□□□□□ -1
TRM13Q12383 PLB1YMR008C 1995 nt8.81□□□□□ -1
TRM13Q12383 TIM17YJL143W 477 nt8.81□□□□□ -1
TRM13Q12383 YLR415CYLR415C 339 nt8.81□□□□□ -1
TRM13Q12383 ALD4YOR374W 1560 nt8.81□□□□□ -1
TRM13Q12383 ARP6YLR085C 1317 nt8.79□□□□□ -1
TRM13Q12383 BDH1YAL060W 1149 nt8.78□□□□□ -1
TRM13Q12383 PRM5YIL117C 957 nt8.77□□□□□ -1.01
TRM13Q12383 RPC82YPR190C 1965 nt8.77□□□□□ -1.01
TRM13Q12383 YCR102CYCR102C 1107 nt8.76□□□□□ -1.01
TRM13Q12383 NBP35YGL091C 987 nt8.75□□□□□ -1.01
TRM13Q12383 PAU21YOR394W 495 nt8.72□□□□□ -1.01
TRM13Q12383 PAU22YPL282C 495 nt8.72□□□□□ -1.01
TRM13Q12383 NIT1YIL164C 600 nt8.71□□□□□ -1.02
TRM13Q12383 SAM35YHR083W 990 nt8.7□□□□□ -1.02
TRM13Q12383 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.69□□□□□ -1.02
TRM13Q12383 ZRT3YKL175W 1512 nt8.68□□□□□ -1.02
TRM13Q12383 SGT2YOR007C 1041 nt8.67□□□□□ -1.02
TRM13Q12383 FRE6YLL051C 2139 nt8.66□□□□□ -1.02
TRM13Q12383 UTR1YJR049C 1593 nt8.66□□□□□ -1.02
TRM13Q12383 YSP3YOR003W 1437 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM13Q12383 LSC2YGR244C 1284 nt8.62□□□□□ -1.03
TRM13Q12383 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.62□□□□□ -1.03
TRM13Q12383 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.62□□□□□ -1.03
TRM13Q12383 SSN3YPL042C 1668 nt8.62□□□□□ -1.03
TRM13Q12383 ARO7YPR060C 771 nt8.61□□□□□ -1.03
TRM13Q12383 GAP1YKR039W 1809 nt8.61□□□□□ -1.03
TRM13Q12383 RIM8YGL045W 1629 nt8.6□□□□□ -1.03
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