Protein–RNA interactions for Protein: Q12272

TPT1, tRNA 2'-phosphotransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPT1Q12272 SPT20YOL148C 1815 nt8.31□□□□□ -1.08
TPT1Q12272 SNG1YGR197C 1644 nt8.31□□□□□ -1.08
TPT1Q12272 YLR281CYLR281C 468 nt8.3□□□□□ -1.08
TPT1Q12272 FMT1YBL013W 1206 nt8.3□□□□□ -1.08
TPT1Q12272 CWP1YKL096W 720 nt8.29□□□□□ -1.08
TPT1Q12272 DUS1YML080W 1272 nt8.28□□□□□ -1.08
TPT1Q12272 ATF2YGR177C 1608 nt8.27□□□□□ -1.09
TPT1Q12272 WHI5YOR083W 888 nt8.26□□□□□ -1.09
TPT1Q12272 AGP1YCL025C 1902 nt8.26□□□□□ -1.09
TPT1Q12272 NPP1YCR026C 2229 nt8.26□□□□□ -1.09
TPT1Q12272 SFP1YLR403W 2052 nt8.25□□□□□ -1.09
TPT1Q12272 IDH1YNL037C 1083 nt8.24□□□□□ -1.09
TPT1Q12272 RIM8YGL045W 1629 nt8.24□□□□□ -1.09
TPT1Q12272 YIH1YCR059C 777 nt8.23□□□□□ -1.09
TPT1Q12272 IMP2'YIL154C 1041 nt8.23□□□□□ -1.09
TPT1Q12272 YLL053CYLL053C 459 nt8.23□□□□□ -1.09
TPT1Q12272 ILV2YMR108W 2064 nt8.22□□□□□ -1.09
TPT1Q12272 YFL067WYFL067W 528 nt8.22□□□□□ -1.09
TPT1Q12272 YOR139CYOR139C 393 nt8.22□□□□□ -1.09
TPT1Q12272 GBP2YCL011C 1284 nt8.21□□□□□ -1.1
TPT1Q12272 TCD2YKL027W 1344 nt8.21□□□□□ -1.1
TPT1Q12272 RPC82YPR190C 1965 nt8.21□□□□□ -1.1
TPT1Q12272 DTR1YBR180W 1719 nt8.2□□□□□ -1.1
TPT1Q12272 BNA2YJR078W 1362 nt8.18□□□□□ -1.1
TPT1Q12272 YGL114WYGL114W 2178 nt8.18□□□□□ -1.1
TPT1Q12272 INA1YLR413W 2028 nt8.17□□□□□ -1.1
TPT1Q12272 MIC12YBR262C 321 nt8.15□□□□□ -1.1
TPT1Q12272 RNQ1YCL028W 1218 nt8.14□□□□□ -1.11
TPT1Q12272 MAE1YKL029C 2010 nt8.13□□□□□ -1.11
TPT1Q12272 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.13□□□□□ -1.11
TPT1Q12272 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.13□□□□□ -1.11
TPT1Q12272 HEM14YER014W 1620 nt8.13□□□□□ -1.11
TPT1Q12272 SOR2YDL246C 1074 nt8.12□□□□□ -1.11
TPT1Q12272 SOR1YJR159W 1074 nt8.12□□□□□ -1.11
TPT1Q12272 FTR1YER145C 1215 nt8.11□□□□□ -1.11
TPT1Q12272 DDR2YOL052C-A 186 nt8.1□□□□□ -1.11
TPT1Q12272 GPI16YHR188C 1833 nt8.1□□□□□ -1.11
TPT1Q12272 MUP1YGR055W 1725 nt8.09□□□□□ -1.11
TPT1Q12272 TRM5YHR070W 1500 nt8.09□□□□□ -1.11
TPT1Q12272 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt8.09□□□□□ -1.11
TPT1Q12272 GAL1YBR020W 1587 nt8.08□□□□□ -1.12
TPT1Q12272 STR3YGL184C 1398 nt8.08□□□□□ -1.12
TPT1Q12272 ANP1YEL036C 1503 nt8.08□□□□□ -1.12
TPT1Q12272 HHO1YPL127C 777 nt8.06□□□□□ -1.12
TPT1Q12272 LPX1YOR084W 1164 nt8.04□□□□□ -1.12
TPT1Q12272 GDH3YAL062W 1374 nt8.04□□□□□ -1.12
TPT1Q12272 XDJ1YLR090W 1380 nt8.04□□□□□ -1.12
TPT1Q12272 HMG2YLR450W 3138 nt8.02□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 RTN2YDL204W 1182 nt8.02□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 FMP45YDL222C 930 nt8.02□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 TPO4YOR273C 1980 nt8.02□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 YDR433WYDR433W 441 nt8.01□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 MXR2YCL033C 507 nt8.01□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 YCL042WYCL042W 360 nt8.01□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 RFC1YOR217W 2586 nt8.01□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 PUS2YGL063W 1113 nt8□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 ERV46YAL042W 1248 nt7.99□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 GAL2YLR081W 1725 nt7.99□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 ACO2YJL200C 2370 nt7.98□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 HOL1YNR055C 1761 nt7.97□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 FRD1YEL047C 1413 nt7.97□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 HIF1YLL022C 1158 nt7.97□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 YPR011CYPR011C 981 nt7.97□□□□□ -1.13
TPT1Q12272 AQY2YLL052C 450 nt7.96□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 RSC4YKR008W 1878 nt7.96□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 UGA4YDL210W 1716 nt7.95□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 DUT1YBR252W 444 nt7.95□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 YGR201CYGR201C 678 nt7.94□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 YKR040CYKR040C 504 nt7.94□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 GTB1YDR221W 2109 nt7.93□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt7.93□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 IMT4tM(CAU)E 72 nt7.93□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 IMT3tM(CAU)J3 72 nt7.93□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 IMT1tM(CAU)O1 72 nt7.93□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 IMT2tM(CAU)P 72 nt7.93□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 FEN2YCR028C 1539 nt7.93□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 ALD4YOR374W 1560 nt7.91□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt7.9□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 DIC1YLR348C 897 nt7.9□□□□□ -1.14
TPT1Q12272 AQY1YPR192W 918 nt7.89□□□□□ -1.15
TPT1Q12272 YIR016WYIR016W 798 nt7.88□□□□□ -1.15
TPT1Q12272 STB1YNL309W 1263 nt7.88□□□□□ -1.15
TPT1Q12272 URA8YJR103W 1737 nt7.87□□□□□ -1.15
TPT1Q12272 SPC25YER018C 666 nt7.86□□□□□ -1.15
TPT1Q12272 YMR209CYMR209C 1374 nt7.85□□□□□ -1.15
TPT1Q12272 MCM5YLR274W 2328 nt7.85□□□□□ -1.15
TPT1Q12272 TOK1YJL093C 2076 nt7.85□□□□□ -1.15
TPT1Q12272 PRM5YIL117C 957 nt7.84□□□□□ -1.15
TPT1Q12272 ZRT3YKL175W 1512 nt7.81□□□□□ -1.16
TPT1Q12272 GOR1YNL274C 1053 nt7.8□□□□□ -1.16
TPT1Q12272 PLB1YMR008C 1995 nt7.79□□□□□ -1.16
TPT1Q12272 MAS1YLR163C 1389 nt7.79□□□□□ -1.16
TPT1Q12272 AVT6YER119C 1347 nt7.78□□□□□ -1.16
TPT1Q12272 VPS60YDR486C 690 nt7.78□□□□□ -1.16
TPT1Q12272 YNL024CYNL024C 741 nt7.78□□□□□ -1.16
TPT1Q12272 YHL008CYHL008C 1884 nt7.76□□□□□ -1.17
TPT1Q12272 ILV3YJR016C 1758 nt7.76□□□□□ -1.17
TPT1Q12272 ALG3YBL082C 1377 nt7.74□□□□□ -1.17
TPT1Q12272 HIS2YFR025C 1008 nt7.74□□□□□ -1.17
TPT1Q12272 YJL067WYJL067W 351 nt7.74□□□□□ -1.17
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