Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 DIC1YLR348C 897 nt9.35□□□□□ -0.91
VAM3Q12241 MIC10YCL057C-A 294 nt9.35□□□□□ -0.91
VAM3Q12241 YLR235CYLR235C 399 nt9.34□□□□□ -0.91
VAM3Q12241 DDR2YOL052C-A 186 nt9.33□□□□□ -0.92
VAM3Q12241 CCA1YER168C 1641 nt9.32□□□□□ -0.92
VAM3Q12241 PTH1YHR189W 573 nt9.32□□□□□ -0.92
VAM3Q12241 GAL1YBR020W 1587 nt9.31□□□□□ -0.92
VAM3Q12241 TRM5YHR070W 1500 nt9.31□□□□□ -0.92
VAM3Q12241 ALG12YNR030W 1656 nt9.29□□□□□ -0.92
VAM3Q12241 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.28□□□□□ -0.92
VAM3Q12241 AQY1YPR192W 918 nt9.26□□□□□ -0.93
VAM3Q12241 BNA2YJR078W 1362 nt9.25□□□□□ -0.93
VAM3Q12241 YKL030WYKL030W 606 nt9.25□□□□□ -0.93
VAM3Q12241 TIM23YNR017W 669 nt9.25□□□□□ -0.93
VAM3Q12241 PRP4YPR178W 1398 nt9.24□□□□□ -0.93
VAM3Q12241 ANP1YEL036C 1503 nt9.23□□□□□ -0.93
VAM3Q12241 RTG1YOL067C 534 nt9.23□□□□□ -0.93
VAM3Q12241 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.22□□□□□ -0.93
VAM3Q12241 YEL076CYEL076C 651 nt9.22□□□□□ -0.93
VAM3Q12241 YLR464WYLR464W 651 nt9.22□□□□□ -0.93
VAM3Q12241 YLR179CYLR179C 606 nt9.2□□□□□ -0.94
VAM3Q12241 AAC1YMR056C 930 nt9.2□□□□□ -0.94
VAM3Q12241 BMT6YLR063W 1098 nt9.18□□□□□ -0.94
VAM3Q12241 DPS1YLL018C 1674 nt9.17□□□□□ -0.94
VAM3Q12241 SSN3YPL042C 1668 nt9.17□□□□□ -0.94
VAM3Q12241 MRPL8YJL063C 717 nt9.17□□□□□ -0.94
VAM3Q12241 STB1YNL309W 1263 nt9.17□□□□□ -0.94
VAM3Q12241 MIC12YBR262C 321 nt9.17□□□□□ -0.94
VAM3Q12241 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.16□□□□□ -0.94
VAM3Q12241 WSC2YNL283C 1512 nt9.15□□□□□ -0.94
VAM3Q12241 SPC25YER018C 666 nt9.15□□□□□ -0.94
VAM3Q12241 FRE6YLL051C 2139 nt9.14□□□□□ -0.95
VAM3Q12241 FEN2YCR028C 1539 nt9.14□□□□□ -0.95
VAM3Q12241 GPI16YHR188C 1833 nt9.14□□□□□ -0.95
VAM3Q12241 AHT1YHR093W 549 nt9.13□□□□□ -0.95
VAM3Q12241 YKR005CYKR005C 1578 nt9.12□□□□□ -0.95
VAM3Q12241 YCL074WYCL074W 927 nt9.12□□□□□ -0.95
VAM3Q12241 DUS1YML080W 1272 nt9.12□□□□□ -0.95
VAM3Q12241 YPR064WYPR064W 420 nt9.12□□□□□ -0.95
VAM3Q12241 HHO1YPL127C 777 nt9.11□□□□□ -0.95
VAM3Q12241 ADO1YJR105W 1023 nt9.1□□□□□ -0.95
VAM3Q12241 HUA1YGR268C 597 nt9.09□□□□□ -0.95
VAM3Q12241 AGP1YCL025C 1902 nt9.09□□□□□ -0.95
VAM3Q12241 YIR016WYIR016W 798 nt9.06□□□□□ -0.96
VAM3Q12241 TAD3YLR316C 969 nt9.06□□□□□ -0.96
VAM3Q12241 CCT4YDL143W 1587 nt9.05□□□□□ -0.96
VAM3Q12241 YGR201CYGR201C 678 nt9.05□□□□□ -0.96
VAM3Q12241 YGR259CYGR259C 441 nt9.05□□□□□ -0.96
VAM3Q12241 VPS60YDR486C 690 nt9.04□□□□□ -0.96
VAM3Q12241 GID7YCL039W 2238 nt9.03□□□□□ -0.96
VAM3Q12241 NAR1YNL240C 1476 nt9.02□□□□□ -0.96
VAM3Q12241 IRC24YIR036C 792 nt9.02□□□□□ -0.97
VAM3Q12241 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.01□□□□□ -0.97
VAM3Q12241 SWC5YBR231C 912 nt9.01□□□□□ -0.97
VAM3Q12241 SNF1YDR477W 1902 nt8.99□□□□□ -0.97
VAM3Q12241 HSL7YBR133C 2484 nt8.98□□□□□ -0.97
VAM3Q12241 BIO5YNR056C 1686 nt8.98□□□□□ -0.97
VAM3Q12241 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.97□□□□□ -0.97
VAM3Q12241 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.97□□□□□ -0.97
VAM3Q12241 XDJ1YLR090W 1380 nt8.97□□□□□ -0.97
VAM3Q12241 ALG3YBL082C 1377 nt8.97□□□□□ -0.97
VAM3Q12241 BDH1YAL060W 1149 nt8.93□□□□□ -0.98
VAM3Q12241 STR3YGL184C 1398 nt8.93□□□□□ -0.98
VAM3Q12241 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.91□□□□□ -0.98
VAM3Q12241 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.91□□□□□ -0.98
VAM3Q12241 YLR415CYLR415C 339 nt8.91□□□□□ -0.98
VAM3Q12241 CYT2YKL087C 675 nt8.9□□□□□ -0.98
VAM3Q12241 GOR1YNL274C 1053 nt8.9□□□□□ -0.98
VAM3Q12241 NPP1YCR026C 2229 nt8.9□□□□□ -0.98
VAM3Q12241 PBP1YGR178C 2169 nt8.9□□□□□ -0.98
VAM3Q12241 AVT6YER119C 1347 nt8.89□□□□□ -0.99
VAM3Q12241 YAT1YAR035W 2064 nt8.87□□□□□ -0.99
VAM3Q12241 BSP1YPR171W 1731 nt8.87□□□□□ -0.99
VAM3Q12241 SFP1YLR403W 2052 nt8.87□□□□□ -0.99
VAM3Q12241 RTN2YDL204W 1182 nt8.86□□□□□ -0.99
VAM3Q12241 AQY2YLL052C 450 nt8.86□□□□□ -0.99
VAM3Q12241 DUT1YBR252W 444 nt8.86□□□□□ -0.99
VAM3Q12241 YSP3YOR003W 1437 nt8.86□□□□□ -0.99
VAM3Q12241 GDH3YAL062W 1374 nt8.86□□□□□ -0.99
VAM3Q12241 ESBP6YNL125C 2022 nt8.85□□□□□ -0.99
VAM3Q12241 HEL2YDR266C 1920 nt8.83□□□□□ -1
VAM3Q12241 PEX25YPL112C 1185 nt8.8□□□□□ -1
VAM3Q12241 MET2YNL277W 1461 nt8.8□□□□□ -1
VAM3Q12241 YFR018CYFR018C 1092 nt8.78□□□□□ -1
VAM3Q12241 TIM17YJL143W 477 nt8.78□□□□□ -1
VAM3Q12241 YNL115CYNL115C 1935 nt8.77□□□□□ -1.01
VAM3Q12241 RFC1YOR217W 2586 nt8.76□□□□□ -1.01
VAM3Q12241 SHM2YLR058C 1410 nt8.75□□□□□ -1.01
VAM3Q12241 YDR094WYDR094W 336 nt8.75□□□□□ -1.01
VAM3Q12241 DAT1YML113W 747 nt8.72□□□□□ -1.01
VAM3Q12241 YFL066CYFL066C 1179 nt8.71□□□□□ -1.02
VAM3Q12241 VPS75YNL246W 795 nt8.71□□□□□ -1.02
VAM3Q12241 CMP2YML057W 1815 nt8.7□□□□□ -1.02
VAM3Q12241 ILV2YMR108W 2064 nt8.7□□□□□ -1.02
VAM3Q12241 NIT1YIL164C 600 nt8.68□□□□□ -1.02
VAM3Q12241 UBX6YJL048C 1191 nt8.68□□□□□ -1.02
VAM3Q12241 YCR102CYCR102C 1107 nt8.67□□□□□ -1.02
VAM3Q12241 PRE6YOL038W 765 nt8.67□□□□□ -1.02
VAM3Q12241 RRT5YFR032C 870 nt8.66□□□□□ -1.02
VAM3Q12241 ARP6YLR085C 1317 nt8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms