Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 PRP4YPR178W 1398 nt12.59□□□□□ -0.39
LSP1Q12230 ANP1YEL036C 1503 nt12.58□□□□□ -0.4
LSP1Q12230 ALG12YNR030W 1656 nt12.58□□□□□ -0.4
LSP1Q12230 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.56□□□□□ -0.4
LSP1Q12230 UME6YDR207C 2511 nt12.56□□□□□ -0.4
LSP1Q12230 STB1YNL309W 1263 nt12.55□□□□□ -0.4
LSP1Q12230 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.54□□□□□ -0.4
LSP1Q12230 YEL076CYEL076C 651 nt12.54□□□□□ -0.4
LSP1Q12230 YLR464WYLR464W 651 nt12.54□□□□□ -0.4
LSP1Q12230 SPP1YPL138C 1062 nt12.54□□□□□ -0.4
LSP1Q12230 AQY1YPR192W 918 nt12.54□□□□□ -0.4
LSP1Q12230 YLR179CYLR179C 606 nt12.53□□□□□ -0.4
LSP1Q12230 DUS1YML080W 1272 nt12.53□□□□□ -0.4
LSP1Q12230 TIM23YNR017W 669 nt12.52□□□□□ -0.41
LSP1Q12230 DPS1YLL018C 1674 nt12.51□□□□□ -0.41
LSP1Q12230 FEN2YCR028C 1539 nt12.5□□□□□ -0.41
LSP1Q12230 YLR235CYLR235C 399 nt12.49□□□□□ -0.41
LSP1Q12230 AGP1YCL025C 1902 nt12.49□□□□□ -0.41
LSP1Q12230 MCH5YOR306C 1566 nt12.48□□□□□ -0.41
LSP1Q12230 AAC1YMR056C 930 nt12.48□□□□□ -0.41
LSP1Q12230 MIC12YBR262C 321 nt12.48□□□□□ -0.41
LSP1Q12230 SPC25YER018C 666 nt12.47□□□□□ -0.41
LSP1Q12230 HHO1YPL127C 777 nt12.46□□□□□ -0.41
LSP1Q12230 GPI16YHR188C 1833 nt12.46□□□□□ -0.42
LSP1Q12230 BMT6YLR063W 1098 nt12.45□□□□□ -0.42
LSP1Q12230 YKR005CYKR005C 1578 nt12.44□□□□□ -0.42
LSP1Q12230 VPS60YDR486C 690 nt12.42□□□□□ -0.42
LSP1Q12230 WSC2YNL283C 1512 nt12.41□□□□□ -0.42
LSP1Q12230 YCL074WYCL074W 927 nt12.4□□□□□ -0.42
LSP1Q12230 YIR016WYIR016W 798 nt12.4□□□□□ -0.42
LSP1Q12230 CCT4YDL143W 1587 nt12.39□□□□□ -0.43
LSP1Q12230 SWC5YBR231C 912 nt12.36□□□□□ -0.43
LSP1Q12230 ALG3YBL082C 1377 nt12.35□□□□□ -0.43
LSP1Q12230 YGR259CYGR259C 441 nt12.34□□□□□ -0.43
LSP1Q12230 NAR1YNL240C 1476 nt12.33□□□□□ -0.44
LSP1Q12230 AHT1YHR093W 549 nt12.32□□□□□ -0.44
LSP1Q12230 YKL030WYKL030W 606 nt12.32□□□□□ -0.44
LSP1Q12230 SNF1YDR477W 1902 nt12.31□□□□□ -0.44
LSP1Q12230 BIO5YNR056C 1686 nt12.29□□□□□ -0.44
LSP1Q12230 YPR064WYPR064W 420 nt12.28□□□□□ -0.44
LSP1Q12230 YGR201CYGR201C 678 nt12.27□□□□□ -0.45
LSP1Q12230 DUT1YBR252W 444 nt12.27□□□□□ -0.45
LSP1Q12230 XDJ1YLR090W 1380 nt12.27□□□□□ -0.45
LSP1Q12230 MOT3YMR070W 1473 nt12.25□□□□□ -0.45
LSP1Q12230 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.25□□□□□ -0.45
LSP1Q12230 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.25□□□□□ -0.45
LSP1Q12230 STR3YGL184C 1398 nt12.21□□□□□ -0.45
LSP1Q12230 AQY2YLL052C 450 nt12.21□□□□□ -0.45
LSP1Q12230 AVT6YER119C 1347 nt12.19□□□□□ -0.46
LSP1Q12230 IRC24YIR036C 792 nt12.19□□□□□ -0.46
LSP1Q12230 TAD3YLR316C 969 nt12.17□□□□□ -0.46
LSP1Q12230 GOR1YNL274C 1053 nt12.17□□□□□ -0.46
LSP1Q12230 GDH3YAL062W 1374 nt12.16□□□□□ -0.46
LSP1Q12230 YJL225CYJL225C 5277 nt12.14□□□□□ -0.47
LSP1Q12230 PBP1YGR178C 2169 nt12.08□□□□□ -0.48
LSP1Q12230 CYT2YKL087C 675 nt12.07□□□□□ -0.48
LSP1Q12230 BDH1YAL060W 1149 nt12.04□□□□□ -0.48
LSP1Q12230 YLR415CYLR415C 339 nt12.03□□□□□ -0.48
LSP1Q12230 SHM2YLR058C 1410 nt12.03□□□□□ -0.48
LSP1Q12230 RTN2YDL204W 1182 nt12□□□□□ -0.49
LSP1Q12230 RTG1YOL067C 534 nt11.96□□□□□ -0.49
LSP1Q12230 TIM17YJL143W 477 nt11.95□□□□□ -0.5
LSP1Q12230 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.93□□□□□ -0.5
LSP1Q12230 YSP3YOR003W 1437 nt11.86□□□□□ -0.51
LSP1Q12230 NIT1YIL164C 600 nt11.86□□□□□ -0.51
LSP1Q12230 PLB1YMR008C 1995 nt11.85□□□□□ -0.51
LSP1Q12230 CMP2YML057W 1815 nt11.84□□□□□ -0.51
LSP1Q12230 YAT1YAR035W 2064 nt11.84□□□□□ -0.51
LSP1Q12230 DAT1YML113W 747 nt11.84□□□□□ -0.51
LSP1Q12230 SGT2YOR007C 1041 nt11.84□□□□□ -0.51
LSP1Q12230 YCR102CYCR102C 1107 nt11.81□□□□□ -0.52
LSP1Q12230 NBP35YGL091C 987 nt11.81□□□□□ -0.52
LSP1Q12230 HUA1YGR268C 597 nt11.79□□□□□ -0.52
LSP1Q12230 YNL115CYNL115C 1935 nt11.78□□□□□ -0.52
LSP1Q12230 PRM5YIL117C 957 nt11.77□□□□□ -0.53
LSP1Q12230 HIF1YLL022C 1158 nt11.74□□□□□ -0.53
LSP1Q12230 ARP6YLR085C 1317 nt11.74□□□□□ -0.53
LSP1Q12230 ALD4YOR374W 1560 nt11.71□□□□□ -0.54
LSP1Q12230 NDI1YML120C 1542 nt11.68□□□□□ -0.54
LSP1Q12230 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.68□□□□□ -0.54
LSP1Q12230 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.68□□□□□ -0.54
LSP1Q12230 PEX25YPL112C 1185 nt11.67□□□□□ -0.54
LSP1Q12230 YFL066CYFL066C 1179 nt11.65□□□□□ -0.54
LSP1Q12230 UTR1YJR049C 1593 nt11.65□□□□□ -0.54
LSP1Q12230 VPS75YNL246W 795 nt11.6□□□□□ -0.55
LSP1Q12230 INA1YLR413W 2028 nt11.59□□□□□ -0.55
LSP1Q12230 GAP1YKR039W 1809 nt11.58□□□□□ -0.56
LSP1Q12230 SHH4YLR164W 507 nt11.58□□□□□ -0.56
LSP1Q12230 TIR3YIL011W 810 nt11.57□□□□□ -0.56
LSP1Q12230 PRO1YDR300C 1287 nt11.56□□□□□ -0.56
LSP1Q12230 SPT20YOL148C 1815 nt11.56□□□□□ -0.56
LSP1Q12230 RPC82YPR190C 1965 nt11.55□□□□□ -0.56
LSP1Q12230 SAM35YHR083W 990 nt11.54□□□□□ -0.56
LSP1Q12230 PAU7YAR020C 168 nt11.53□□□□□ -0.56
LSP1Q12230 LSC2YGR244C 1284 nt11.52□□□□□ -0.57
LSP1Q12230 ADO1YJR105W 1023 nt11.51□□□□□ -0.57
LSP1Q12230 ATG15YCR068W 1563 nt11.49□□□□□ -0.57
LSP1Q12230 MRPL8YJL063C 717 nt11.48□□□□□ -0.57
LSP1Q12230 ZRT3YKL175W 1512 nt11.45□□□□□ -0.58
LSP1Q12230 POM34YLR018C 900 nt11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 78.1 ms