Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.85□□□□□ -0.51
PUS1Q12211 HSP60YLR259C 1719 nt11.83□□□□□ -0.52
PUS1Q12211 BIO4YNR057C 714 nt11.81□□□□□ -0.52
PUS1Q12211 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.8□□□□□ -0.52
PUS1Q12211 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.8□□□□□ -0.52
PUS1Q12211 YLL053CYLL053C 459 nt11.8□□□□□ -0.52
PUS1Q12211 WSC2YNL283C 1512 nt11.8□□□□□ -0.52
PUS1Q12211 SIM1YIL123W 1431 nt11.79□□□□□ -0.52
PUS1Q12211 YFR018CYFR018C 1092 nt11.79□□□□□ -0.52
PUS1Q12211 TAD3YLR316C 969 nt11.79□□□□□ -0.52
PUS1Q12211 AHT1YHR093W 549 nt11.78□□□□□ -0.52
PUS1Q12211 FTR1YER145C 1215 nt11.75□□□□□ -0.53
PUS1Q12211 PAU16YKL224C 372 nt11.75□□□□□ -0.53
PUS1Q12211 AQY1YPR192W 918 nt11.75□□□□□ -0.53
PUS1Q12211 RRT5YFR032C 870 nt11.71□□□□□ -0.53
PUS1Q12211 GAL1YBR020W 1587 nt11.71□□□□□ -0.54
PUS1Q12211 PRE6YOL038W 765 nt11.7□□□□□ -0.54
PUS1Q12211 TRM5YHR070W 1500 nt11.65□□□□□ -0.54
PUS1Q12211 ERF2YLR246W 1080 nt11.62□□□□□ -0.55
PUS1Q12211 SWE1YJL187C 2460 nt11.62□□□□□ -0.55
PUS1Q12211 STB1YNL309W 1263 nt11.61□□□□□ -0.55
PUS1Q12211 PEX25YPL112C 1185 nt11.61□□□□□ -0.55
PUS1Q12211 SPC25YER018C 666 nt11.6□□□□□ -0.55
PUS1Q12211 BDH1YAL060W 1149 nt11.59□□□□□ -0.55
PUS1Q12211 ATF2YGR177C 1608 nt11.59□□□□□ -0.55
PUS1Q12211 GLK1YCL040W 1503 nt11.59□□□□□ -0.55
PUS1Q12211 YFL067WYFL067W 528 nt11.58□□□□□ -0.56
PUS1Q12211 DDR2YOL052C-A 186 nt11.58□□□□□ -0.56
PUS1Q12211 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.57□□□□□ -0.56
PUS1Q12211 CRR1YLR213C 1269 nt11.57□□□□□ -0.56
PUS1Q12211 CCT4YDL143W 1587 nt11.57□□□□□ -0.56
PUS1Q12211 YFL066CYFL066C 1179 nt11.56□□□□□ -0.56
PUS1Q12211 YLR415CYLR415C 339 nt11.56□□□□□ -0.56
PUS1Q12211 GPI16YHR188C 1833 nt11.56□□□□□ -0.56
PUS1Q12211 YSP3YOR003W 1437 nt11.55□□□□□ -0.56
PUS1Q12211 SWC5YBR231C 912 nt11.53□□□□□ -0.56
PUS1Q12211 YNL115CYNL115C 1935 nt11.52□□□□□ -0.56
PUS1Q12211 NAR1YNL240C 1476 nt11.52□□□□□ -0.56
PUS1Q12211 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.51□□□□□ -0.57
PUS1Q12211 VPS60YDR486C 690 nt11.5□□□□□ -0.57
PUS1Q12211 ANP1YEL036C 1503 nt11.45□□□□□ -0.58
PUS1Q12211 ALG3YBL082C 1377 nt11.45□□□□□ -0.58
PUS1Q12211 HEM12YDR047W 1089 nt11.44□□□□□ -0.58
PUS1Q12211 SBA1YKL117W 651 nt11.44□□□□□ -0.58
PUS1Q12211 FEN2YCR028C 1539 nt11.44□□□□□ -0.58
PUS1Q12211 SNG1YGR197C 1644 nt11.43□□□□□ -0.58
PUS1Q12211 NAT4YMR069W 858 nt11.43□□□□□ -0.58
PUS1Q12211 MIC10YCL057C-A 294 nt11.4□□□□□ -0.58
PUS1Q12211 LYS4YDR234W 2082 nt11.4□□□□□ -0.58
PUS1Q12211 VPS75YNL246W 795 nt11.39□□□□□ -0.59
PUS1Q12211 AAC1YMR056C 930 nt11.35□□□□□ -0.59
PUS1Q12211 FUR4YBR021W 1902 nt11.35□□□□□ -0.59
PUS1Q12211 YIR016WYIR016W 798 nt11.33□□□□□ -0.6
PUS1Q12211 MIR1YJR077C 936 nt11.33□□□□□ -0.6
PUS1Q12211 MSF1YPR047W 1410 nt11.3□□□□□ -0.6
PUS1Q12211 THI74YDR438W 1113 nt11.3□□□□□ -0.6
PUS1Q12211 PRP4YPR178W 1398 nt11.28□□□□□ -0.6
PUS1Q12211 TIM17YJL143W 477 nt11.28□□□□□ -0.6
PUS1Q12211 VAR1Q0140 1197 nt11.26□□□□□ -0.61
PUS1Q12211 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.25□□□□□ -0.61
PUS1Q12211 FRE6YLL051C 2139 nt11.24□□□□□ -0.61
PUS1Q12211 PBP1YGR178C 2169 nt11.24□□□□□ -0.61
PUS1Q12211 PAU7YAR020C 168 nt11.23□□□□□ -0.61
PUS1Q12211 DPS1YLL018C 1674 nt11.23□□□□□ -0.61
PUS1Q12211 CMP2YML057W 1815 nt11.23□□□□□ -0.61
PUS1Q12211 HSL7YBR133C 2484 nt11.23□□□□□ -0.61
PUS1Q12211 BNA2YJR078W 1362 nt11.22□□□□□ -0.61
PUS1Q12211 CYT2YKL087C 675 nt11.22□□□□□ -0.61
PUS1Q12211 BIO5YNR056C 1686 nt11.22□□□□□ -0.61
PUS1Q12211 SHM2YLR058C 1410 nt11.19□□□□□ -0.62
PUS1Q12211 XDJ1YLR090W 1380 nt11.18□□□□□ -0.62
PUS1Q12211 MIC12YBR262C 321 nt11.18□□□□□ -0.62
PUS1Q12211 DAT1YML113W 747 nt11.17□□□□□ -0.62
PUS1Q12211 RAX1YOR301W 1308 nt11.15□□□□□ -0.62
PUS1Q12211 UBA4YHR111W 1323 nt11.12□□□□□ -0.63
PUS1Q12211 SHB17YKR043C 816 nt11.11□□□□□ -0.63
PUS1Q12211 SNF1YDR477W 1902 nt11.11□□□□□ -0.63
PUS1Q12211 SGT2YOR007C 1041 nt11.1□□□□□ -0.63
PUS1Q12211 GDH3YAL062W 1374 nt11.09□□□□□ -0.63
PUS1Q12211 YGR201CYGR201C 678 nt11.09□□□□□ -0.63
PUS1Q12211 BMT6YLR063W 1098 nt11.09□□□□□ -0.63
PUS1Q12211 YGL034CYGL034C 366 nt11.08□□□□□ -0.64
PUS1Q12211 NIT1YIL164C 600 nt11.08□□□□□ -0.64
PUS1Q12211 YSR3YKR053C 1215 nt11.07□□□□□ -0.64
PUS1Q12211 HHO1YPL127C 777 nt11.06□□□□□ -0.64
PUS1Q12211 YDR010CYDR010C 333 nt11.03□□□□□ -0.64
PUS1Q12211 YMR244WYMR244W 1068 nt11.01□□□□□ -0.65
PUS1Q12211 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.01□□□□□ -0.65
PUS1Q12211 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.01□□□□□ -0.65
PUS1Q12211 YKR005CYKR005C 1578 nt10.99□□□□□ -0.65
PUS1Q12211 XYL2YLR070C 1071 nt10.98□□□□□ -0.65
PUS1Q12211 AVT6YER119C 1347 nt10.98□□□□□ -0.65
PUS1Q12211 GLR1YPL091W 1452 nt10.98□□□□□ -0.65
PUS1Q12211 CCA1YER168C 1641 nt10.97□□□□□ -0.65
PUS1Q12211 RET2YFR051C 1641 nt10.97□□□□□ -0.65
PUS1Q12211 PHO89YBR296C 1725 nt10.96□□□□□ -0.65
PUS1Q12211 YCR087WYCR087W 516 nt10.96□□□□□ -0.65
PUS1Q12211 NDI1YML120C 1542 nt10.94□□□□□ -0.66
PUS1Q12211 SSN3YPL042C 1668 nt10.94□□□□□ -0.66
PUS1Q12211 HEL2YDR266C 1920 nt10.94□□□□□ -0.66
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