Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thbs3Q05895 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thbs3Q05895 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Thbs3Q05895 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thbs3Q05895 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thbs3Q05895 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thbs3Q05895 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thbs3Q05895 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thbs3Q05895 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thbs3Q05895 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Thbs3Q05895 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thbs3Q05895 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thbs3Q05895 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Thbs3Q05895 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thbs3Q05895 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thbs3Q05895 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Thbs3Q05895 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Thbs3Q05895 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Thbs3Q05895 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Thbs3Q05895 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thbs3Q05895 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thbs3Q05895 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Thbs3Q05895 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thbs3Q05895 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thbs3Q05895 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thbs3Q05895 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thbs3Q05895 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thbs3Q05895 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thbs3Q05895 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Thbs3Q05895 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thbs3Q05895 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thbs3Q05895 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thbs3Q05895 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thbs3Q05895 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thbs3Q05895 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thbs3Q05895 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Thbs3Q05895 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thbs3Q05895 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thbs3Q05895 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thbs3Q05895 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Thbs3Q05895 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thbs3Q05895 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thbs3Q05895 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thbs3Q05895 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thbs3Q05895 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thbs3Q05895 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thbs3Q05895 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thbs3Q05895 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thbs3Q05895 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thbs3Q05895 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thbs3Q05895 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thbs3Q05895 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thbs3Q05895 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thbs3Q05895 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thbs3Q05895 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Thbs3Q05895 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thbs3Q05895 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thbs3Q05895 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thbs3Q05895 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thbs3Q05895 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Thbs3Q05895 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Thbs3Q05895 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thbs3Q05895 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thbs3Q05895 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Thbs3Q05895 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thbs3Q05895 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thbs3Q05895 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thbs3Q05895 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thbs3Q05895 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thbs3Q05895 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thbs3Q05895 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thbs3Q05895 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thbs3Q05895 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Thbs3Q05895 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Thbs3Q05895 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Thbs3Q05895 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thbs3Q05895 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Thbs3Q05895 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thbs3Q05895 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thbs3Q05895 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thbs3Q05895 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thbs3Q05895 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thbs3Q05895 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thbs3Q05895 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms