Protein–RNA interactions for Protein: Q04398

SPG3, Stationary phase protein 3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPG3Q04398 RTF1YGL244W 1677 nt11.29□□□□□ -0.6
SPG3Q04398 SPC25YER018C 666 nt11.28□□□□□ -0.6
SPG3Q04398 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.28□□□□□ -0.6
SPG3Q04398 YFL067WYFL067W 528 nt11.28□□□□□ -0.6
SPG3Q04398 STB1YNL309W 1263 nt11.28□□□□□ -0.6
SPG3Q04398 LYS4YDR234W 2082 nt11.27□□□□□ -0.61
SPG3Q04398 DDR2YOL052C-A 186 nt11.26□□□□□ -0.61
SPG3Q04398 PRE6YOL038W 765 nt11.25□□□□□ -0.61
SPG3Q04398 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.23□□□□□ -0.61
SPG3Q04398 BDH1YAL060W 1149 nt11.23□□□□□ -0.61
SPG3Q04398 CCT4YDL143W 1587 nt11.23□□□□□ -0.61
SPG3Q04398 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.21□□□□□ -0.61
SPG3Q04398 PAU16YKL224C 372 nt11.21□□□□□ -0.61
SPG3Q04398 GPI16YHR188C 1833 nt11.21□□□□□ -0.62
SPG3Q04398 RRT5YFR032C 870 nt11.19□□□□□ -0.62
SPG3Q04398 YSP3YOR003W 1437 nt11.18□□□□□ -0.62
SPG3Q04398 VPS60YDR486C 690 nt11.18□□□□□ -0.62
SPG3Q04398 PEX25YPL112C 1185 nt11.18□□□□□ -0.62
SPG3Q04398 ANP1YEL036C 1503 nt11.18□□□□□ -0.62
SPG3Q04398 SNG1YGR197C 1644 nt11.17□□□□□ -0.62
SPG3Q04398 HEM12YDR047W 1089 nt11.16□□□□□ -0.62
SPG3Q04398 YFL066CYFL066C 1179 nt11.16□□□□□ -0.62
SPG3Q04398 YLR415CYLR415C 339 nt11.16□□□□□ -0.62
SPG3Q04398 FEN2YCR028C 1539 nt11.15□□□□□ -0.62
SPG3Q04398 MIC10YCL057C-A 294 nt11.15□□□□□ -0.62
SPG3Q04398 ALG3YBL082C 1377 nt11.14□□□□□ -0.63
SPG3Q04398 PTK1YKL198C 1989 nt11.14□□□□□ -0.63
SPG3Q04398 SWC5YBR231C 912 nt11.13□□□□□ -0.63
SPG3Q04398 YNL115CYNL115C 1935 nt11.11□□□□□ -0.63
SPG3Q04398 YIR016WYIR016W 798 nt11.05□□□□□ -0.64
SPG3Q04398 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.02□□□□□ -0.65
SPG3Q04398 SPT8YLR055C 1809 nt11.01□□□□□ -0.65
SPG3Q04398 VPS75YNL246W 795 nt10.97□□□□□ -0.65
SPG3Q04398 MIC12YBR262C 321 nt10.94□□□□□ -0.66
SPG3Q04398 YFL054CYFL054C 1941 nt10.93□□□□□ -0.66
SPG3Q04398 RAX1YOR301W 1308 nt10.91□□□□□ -0.66
SPG3Q04398 NAT4YMR069W 858 nt10.91□□□□□ -0.66
SPG3Q04398 BNA2YJR078W 1362 nt10.9□□□□□ -0.66
SPG3Q04398 MIR1YJR077C 936 nt10.9□□□□□ -0.66
SPG3Q04398 TIM17YJL143W 477 nt10.89□□□□□ -0.67
SPG3Q04398 GLK1YCL040W 1503 nt10.88□□□□□ -0.67
SPG3Q04398 SHM2YLR058C 1410 nt10.87□□□□□ -0.67
SPG3Q04398 XDJ1YLR090W 1380 nt10.87□□□□□ -0.67
SPG3Q04398 SBA1YKL117W 651 nt10.86□□□□□ -0.67
SPG3Q04398 THI74YDR438W 1113 nt10.83□□□□□ -0.68
SPG3Q04398 MSF1YPR047W 1410 nt10.83□□□□□ -0.68
SPG3Q04398 YJL225CYJL225C 5277 nt10.81□□□□□ -0.68
SPG3Q04398 YGR201CYGR201C 678 nt10.79□□□□□ -0.68
SPG3Q04398 NIT1YIL164C 600 nt10.79□□□□□ -0.68
SPG3Q04398 HHO1YPL127C 777 nt10.79□□□□□ -0.68
SPG3Q04398 GDH3YAL062W 1374 nt10.77□□□□□ -0.68
SPG3Q04398 PAU7YAR020C 168 nt10.77□□□□□ -0.69
SPG3Q04398 SGT2YOR007C 1041 nt10.75□□□□□ -0.69
SPG3Q04398 DAT1YML113W 747 nt10.74□□□□□ -0.69
SPG3Q04398 SWE1YJL187C 2460 nt10.72□□□□□ -0.69
SPG3Q04398 CCA1YER168C 1641 nt10.72□□□□□ -0.69
SPG3Q04398 UBA4YHR111W 1323 nt10.71□□□□□ -0.69
SPG3Q04398 SHB17YKR043C 816 nt10.71□□□□□ -0.69
SPG3Q04398 AGP1YCL025C 1902 nt10.7□□□□□ -0.7
SPG3Q04398 YDR010CYDR010C 333 nt10.68□□□□□ -0.7
SPG3Q04398 AVT6YER119C 1347 nt10.67□□□□□ -0.7
SPG3Q04398 YGL034CYGL034C 366 nt10.64□□□□□ -0.71
SPG3Q04398 YSR3YKR053C 1215 nt10.63□□□□□ -0.71
SPG3Q04398 GOR1YNL274C 1053 nt10.63□□□□□ -0.71
SPG3Q04398 DUT1YBR252W 444 nt10.63□□□□□ -0.71
SPG3Q04398 RET2YFR051C 1641 nt10.6□□□□□ -0.71
SPG3Q04398 XYL2YLR070C 1071 nt10.56□□□□□ -0.72
SPG3Q04398 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.56□□□□□ -0.72
SPG3Q04398 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.56□□□□□ -0.72
SPG3Q04398 PHO89YBR296C 1725 nt10.55□□□□□ -0.72
SPG3Q04398 YCR102CYCR102C 1107 nt10.55□□□□□ -0.72
SPG3Q04398 YCR087WYCR087W 516 nt10.51□□□□□ -0.73
SPG3Q04398 YMR244WYMR244W 1068 nt10.51□□□□□ -0.73
SPG3Q04398 RBG1YAL036C 1110 nt10.48□□□□□ -0.73
SPG3Q04398 GLR1YPL091W 1452 nt10.48□□□□□ -0.73
SPG3Q04398 SFA1YDL168W 1161 nt10.47□□□□□ -0.73
SPG3Q04398 AIM45YPR004C 1035 nt10.47□□□□□ -0.73
SPG3Q04398 NDI1YML120C 1542 nt10.47□□□□□ -0.73
SPG3Q04398 NBP35YGL091C 987 nt10.46□□□□□ -0.73
SPG3Q04398 DUS1YML080W 1272 nt10.46□□□□□ -0.73
SPG3Q04398 STR3YGL184C 1398 nt10.45□□□□□ -0.74
SPG3Q04398 COQ2YNR041C 1119 nt10.45□□□□□ -0.74
SPG3Q04398 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.42□□□□□ -0.74
SPG3Q04398 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.42□□□□□ -0.74
SPG3Q04398 MRP20YDR405W 792 nt10.42□□□□□ -0.74
SPG3Q04398 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.41□□□□□ -0.74
SPG3Q04398 SHH4YLR164W 507 nt10.41□□□□□ -0.74
SPG3Q04398 YCL074WYCL074W 927 nt10.4□□□□□ -0.74
SPG3Q04398 TIR3YIL011W 810 nt10.39□□□□□ -0.75
SPG3Q04398 PAC11YDR488C 1602 nt10.39□□□□□ -0.75
SPG3Q04398 AQY2YLL052C 450 nt10.38□□□□□ -0.75
SPG3Q04398 FUR4YBR021W 1902 nt10.35□□□□□ -0.75
SPG3Q04398 POM34YLR018C 900 nt10.32□□□□□ -0.76
SPG3Q04398 RPL4BYDR012W 1089 nt10.3□□□□□ -0.76
SPG3Q04398 RBG2YGR173W 1107 nt10.3□□□□□ -0.76
SPG3Q04398 TOM6YOR045W 186 nt10.3□□□□□ -0.76
SPG3Q04398 RPL4AYBR031W 1089 nt10.3□□□□□ -0.76
SPG3Q04398 LSC2YGR244C 1284 nt10.29□□□□□ -0.76
SPG3Q04398 PRO1YDR300C 1287 nt10.27□□□□□ -0.77
SPG3Q04398 RPS14BYJL191W 417 nt10.27□□□□□ -0.77
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