Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 ERV46YAL042W 1248 nt8.5□□□□□ -1.05
UPS3Q04006 YLL053CYLL053C 459 nt8.5□□□□□ -1.05
UPS3Q04006 BMT6YLR063W 1098 nt8.49□□□□□ -1.05
UPS3Q04006 RAX1YOR301W 1308 nt8.49□□□□□ -1.05
UPS3Q04006 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt8.48□□□□□ -1.05
UPS3Q04006 IMT4tM(CAU)E 72 nt8.48□□□□□ -1.05
UPS3Q04006 IMT3tM(CAU)J3 72 nt8.48□□□□□ -1.05
UPS3Q04006 IMT1tM(CAU)O1 72 nt8.48□□□□□ -1.05
UPS3Q04006 IMT2tM(CAU)P 72 nt8.48□□□□□ -1.05
UPS3Q04006 YAT1YAR035W 2064 nt8.47□□□□□ -1.05
UPS3Q04006 SFP1YLR403W 2052 nt8.45□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 NDI1YML120C 1542 nt8.45□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 DDR2YOL052C-A 186 nt8.45□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 FRD1YEL047C 1413 nt8.44□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 FTR1YER145C 1215 nt8.43□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 MET2YNL277W 1461 nt8.43□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 ATF2YGR177C 1608 nt8.43□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 LPX1YOR084W 1164 nt8.42□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 SNG1YGR197C 1644 nt8.41□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 BNA2YJR078W 1362 nt8.41□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 YPR011CYPR011C 981 nt8.41□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 CCA1YER168C 1641 nt8.4□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 DIC1YLR348C 897 nt8.4□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 MIC10YCL057C-A 294 nt8.4□□□□□ -1.06
UPS3Q04006 AQY1YPR192W 918 nt8.39□□□□□ -1.07
UPS3Q04006 GAL1YBR020W 1587 nt8.39□□□□□ -1.07
UPS3Q04006 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt8.38□□□□□ -1.07
UPS3Q04006 TRM5YHR070W 1500 nt8.38□□□□□ -1.07
UPS3Q04006 YKR005CYKR005C 1578 nt8.37□□□□□ -1.07
UPS3Q04006 NPP1YCR026C 2229 nt8.35□□□□□ -1.07
UPS3Q04006 MAE1YKL029C 2010 nt8.35□□□□□ -1.07
UPS3Q04006 RIM8YGL045W 1629 nt8.34□□□□□ -1.07
UPS3Q04006 Q0182Q0182 405 nt8.33□□□□□ -1.08
UPS3Q04006 SPT20YOL148C 1815 nt8.31□□□□□ -1.08
UPS3Q04006 ANP1YEL036C 1503 nt8.31□□□□□ -1.08
UPS3Q04006 WSC2YNL283C 1512 nt8.29□□□□□ -1.08
UPS3Q04006 YGL114WYGL114W 2178 nt8.29□□□□□ -1.08
UPS3Q04006 IRC24YIR036C 792 nt8.28□□□□□ -1.08
UPS3Q04006 YLR235CYLR235C 399 nt8.28□□□□□ -1.08
UPS3Q04006 STB1YNL309W 1263 nt8.28□□□□□ -1.08
UPS3Q04006 HMG2YLR450W 3138 nt8.28□□□□□ -1.08
UPS3Q04006 GPI16YHR188C 1833 nt8.27□□□□□ -1.09
UPS3Q04006 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt8.27□□□□□ -1.09
UPS3Q04006 DUS1YML080W 1272 nt8.27□□□□□ -1.09
UPS3Q04006 YGR259CYGR259C 441 nt8.26□□□□□ -1.09
UPS3Q04006 SPC25YER018C 666 nt8.25□□□□□ -1.09
UPS3Q04006 MIC12YBR262C 321 nt8.25□□□□□ -1.09
UPS3Q04006 TPO4YOR273C 1980 nt8.24□□□□□ -1.09
UPS3Q04006 FEN2YCR028C 1539 nt8.24□□□□□ -1.09
UPS3Q04006 YCL074WYCL074W 927 nt8.24□□□□□ -1.09
UPS3Q04006 YLR179CYLR179C 606 nt8.24□□□□□ -1.09
UPS3Q04006 TIM23YNR017W 669 nt8.24□□□□□ -1.09
UPS3Q04006 HHO1YPL127C 777 nt8.24□□□□□ -1.09
UPS3Q04006 PTH1YHR189W 573 nt8.2□□□□□ -1.1
UPS3Q04006 YGR201CYGR201C 678 nt8.19□□□□□ -1.1
UPS3Q04006 GID7YCL039W 2238 nt8.18□□□□□ -1.1
UPS3Q04006 UGA4YDL210W 1716 nt8.18□□□□□ -1.1
UPS3Q04006 RPC82YPR190C 1965 nt8.17□□□□□ -1.1
UPS3Q04006 YIR016WYIR016W 798 nt8.17□□□□□ -1.1
UPS3Q04006 SWC5YBR231C 912 nt8.17□□□□□ -1.1
UPS3Q04006 ACO2YJL200C 2370 nt8.17□□□□□ -1.1
UPS3Q04006 CCT4YDL143W 1587 nt8.16□□□□□ -1.1
UPS3Q04006 VPS60YDR486C 690 nt8.15□□□□□ -1.1
UPS3Q04006 YPR064WYPR064W 420 nt8.14□□□□□ -1.11
UPS3Q04006 AGP1YCL025C 1902 nt8.13□□□□□ -1.11
UPS3Q04006 MUP1YGR055W 1725 nt8.12□□□□□ -1.11
UPS3Q04006 AHT1YHR093W 549 nt8.12□□□□□ -1.11
UPS3Q04006 YKL030WYKL030W 606 nt8.12□□□□□ -1.11
UPS3Q04006 GOR1YNL274C 1053 nt8.08□□□□□ -1.12
UPS3Q04006 SSN3YPL042C 1668 nt8.08□□□□□ -1.12
UPS3Q04006 INA1YLR413W 2028 nt8.07□□□□□ -1.12
UPS3Q04006 URA8YJR103W 1737 nt8.06□□□□□ -1.12
UPS3Q04006 ALG3YBL082C 1377 nt8.06□□□□□ -1.12
UPS3Q04006 SPP1YPL138C 1062 nt8.05□□□□□ -1.12
UPS3Q04006 XDJ1YLR090W 1380 nt8.04□□□□□ -1.12
UPS3Q04006 STR3YGL184C 1398 nt8.03□□□□□ -1.12
UPS3Q04006 TAD3YLR316C 969 nt8.03□□□□□ -1.12
UPS3Q04006 AVT6YER119C 1347 nt8.03□□□□□ -1.12
UPS3Q04006 AQY2YLL052C 450 nt8.02□□□□□ -1.13
UPS3Q04006 RTN2YDL204W 1182 nt8.01□□□□□ -1.13
UPS3Q04006 GDH3YAL062W 1374 nt8□□□□□ -1.13
UPS3Q04006 MOT3YMR070W 1473 nt8□□□□□ -1.13
UPS3Q04006 RDN18-1RDN18-1 1800 nt7.99□□□□□ -1.13
UPS3Q04006 RDN18-2RDN18-2 1800 nt7.99□□□□□ -1.13
UPS3Q04006 HOL1YNR055C 1761 nt7.97□□□□□ -1.13
UPS3Q04006 YLR415CYLR415C 339 nt7.96□□□□□ -1.14
UPS3Q04006 GTB1YDR221W 2109 nt7.95□□□□□ -1.14
UPS3Q04006 TIM17YJL143W 477 nt7.93□□□□□ -1.14
UPS3Q04006 DUT1YBR252W 444 nt7.93□□□□□ -1.14
UPS3Q04006 ESBP6YNL125C 2022 nt7.9□□□□□ -1.15
UPS3Q04006 YHL008CYHL008C 1884 nt7.89□□□□□ -1.15
UPS3Q04006 SHM2YLR058C 1410 nt7.89□□□□□ -1.15
UPS3Q04006 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt7.89□□□□□ -1.15
UPS3Q04006 BDH1YAL060W 1149 nt7.88□□□□□ -1.15
UPS3Q04006 YMR209CYMR209C 1374 nt7.87□□□□□ -1.15
UPS3Q04006 ILV2YMR108W 2064 nt7.87□□□□□ -1.15
UPS3Q04006 DAT1YML113W 747 nt7.86□□□□□ -1.15
UPS3Q04006 YCR102CYCR102C 1107 nt7.85□□□□□ -1.15
UPS3Q04006 THI72YOR192C 1800 nt7.85□□□□□ -1.15
UPS3Q04006 RFC1YOR217W 2586 nt7.8□□□□□ -1.16
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