Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLI1Q01543 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLI1Q01543 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FLI1Q01543 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FLI1Q01543 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FLI1Q01543 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FLI1Q01543 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FLI1Q01543 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLI1Q01543 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLI1Q01543 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLI1Q01543 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FLI1Q01543 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FLI1Q01543 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FLI1Q01543 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FLI1Q01543 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLI1Q01543 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLI1Q01543 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FLI1Q01543 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLI1Q01543 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLI1Q01543 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLI1Q01543 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLI1Q01543 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLI1Q01543 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLI1Q01543 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLI1Q01543 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FLI1Q01543 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FLI1Q01543 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FLI1Q01543 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FLI1Q01543 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FLI1Q01543 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLI1Q01543 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLI1Q01543 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLI1Q01543 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FLI1Q01543 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLI1Q01543 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FLI1Q01543 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLI1Q01543 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLI1Q01543 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLI1Q01543 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FLI1Q01543 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FLI1Q01543 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FLI1Q01543 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLI1Q01543 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLI1Q01543 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLI1Q01543 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLI1Q01543 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLI1Q01543 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FLI1Q01543 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FLI1Q01543 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FLI1Q01543 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FLI1Q01543 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FLI1Q01543 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FLI1Q01543 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FLI1Q01543 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FLI1Q01543 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FLI1Q01543 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FLI1Q01543 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FLI1Q01543 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FLI1Q01543 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FLI1Q01543 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FLI1Q01543 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FLI1Q01543 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FLI1Q01543 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FLI1Q01543 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FLI1Q01543 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLI1Q01543 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLI1Q01543 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLI1Q01543 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FLI1Q01543 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLI1Q01543 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FLI1Q01543 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms