Protein–RNA interactions for Protein: Q01477

UBP3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP3Q01477 YFL054CYFL054C 1941 nt11.76□□□□□ -0.53
UBP3Q01477 YFL067WYFL067W 528 nt11.76□□□□□ -0.53
UBP3Q01477 DDR2YOL052C-A 186 nt11.76□□□□□ -0.53
UBP3Q01477 AQY1YPR192W 918 nt11.75□□□□□ -0.53
UBP3Q01477 SNG1YGR197C 1644 nt11.74□□□□□ -0.53
UBP3Q01477 STB1YNL309W 1263 nt11.73□□□□□ -0.53
UBP3Q01477 YPR064WYPR064W 420 nt11.73□□□□□ -0.53
UBP3Q01477 HEM12YDR047W 1089 nt11.72□□□□□ -0.53
UBP3Q01477 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.71□□□□□ -0.53
UBP3Q01477 SPC25YER018C 666 nt11.71□□□□□ -0.53
UBP3Q01477 UME6YDR207C 2511 nt11.7□□□□□ -0.54
UBP3Q01477 TAD3YLR316C 969 nt11.7□□□□□ -0.54
UBP3Q01477 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.69□□□□□ -0.54
UBP3Q01477 ANP1YEL036C 1503 nt11.68□□□□□ -0.54
UBP3Q01477 CCT4YDL143W 1587 nt11.65□□□□□ -0.54
UBP3Q01477 SPT8YLR055C 1809 nt11.65□□□□□ -0.55
UBP3Q01477 FEN2YCR028C 1539 nt11.64□□□□□ -0.55
UBP3Q01477 VPS60YDR486C 690 nt11.63□□□□□ -0.55
UBP3Q01477 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.63□□□□□ -0.55
UBP3Q01477 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.62□□□□□ -0.55
UBP3Q01477 GPI16YHR188C 1833 nt11.61□□□□□ -0.55 RIP-Chip
UBP3Q01477 ALG3YBL082C 1377 nt11.6□□□□□ -0.55
UBP3Q01477 BDH1YAL060W 1149 nt11.59□□□□□ -0.55
UBP3Q01477 YIR016WYIR016W 798 nt11.55□□□□□ -0.56 RIP-Chip
UBP3Q01477 RPM1RPM1 483 nt11.55□□□□□ -0.56
UBP3Q01477 UBX6YJL048C 1191 nt11.53□□□□□ -0.56
UBP3Q01477 FRE6YLL051C 2139 nt11.53□□□□□ -0.56 RIP-Chip
UBP3Q01477 SWC5YBR231C 912 nt11.52□□□□□ -0.57
UBP3Q01477 RAX1YOR301W 1308 nt11.52□□□□□ -0.57
UBP3Q01477 SWE1YJL187C 2460 nt11.51□□□□□ -0.57
UBP3Q01477 YSP3YOR003W 1437 nt11.51□□□□□ -0.57
UBP3Q01477 YDR094WYDR094W 336 nt11.48□□□□□ -0.57
UBP3Q01477 MIC12YBR262C 321 nt11.47□□□□□ -0.57
UBP3Q01477 YLR415CYLR415C 339 nt11.46□□□□□ -0.57
UBP3Q01477 YFL066CYFL066C 1179 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP3Q01477 YFR018CYFR018C 1092 nt11.43□□□□□ -0.58
UBP3Q01477 PRE6YOL038W 765 nt11.43□□□□□ -0.58
UBP3Q01477 BNA2YJR078W 1362 nt11.42□□□□□ -0.58
UBP3Q01477 YJL225CYJL225C 5277 nt11.42□□□□□ -0.58
UBP3Q01477 CCA1YER168C 1641 nt11.42□□□□□ -0.58
UBP3Q01477 YNL115CYNL115C 1935 nt11.4□□□□□ -0.58
UBP3Q01477 NME1NME1 340 nt11.39□□□□□ -0.59
UBP3Q01477 PEX25YPL112C 1185 nt11.38□□□□□ -0.59
UBP3Q01477 HHO1YPL127C 777 nt11.35□□□□□ -0.59
UBP3Q01477 AGP1YCL025C 1902 nt11.35□□□□□ -0.59
UBP3Q01477 XDJ1YLR090W 1380 nt11.32□□□□□ -0.6
UBP3Q01477 BOR1YNL275W 1731 nt11.29□□□□□ -0.6 RIP-Chip
UBP3Q01477 SHM2YLR058C 1410 nt11.28□□□□□ -0.6
UBP3Q01477 PAU16YKL224C 372 nt11.27□□□□□ -0.61
UBP3Q01477 DUT1YBR252W 444 nt11.27□□□□□ -0.61
UBP3Q01477 GDH3YAL062W 1374 nt11.27□□□□□ -0.61
UBP3Q01477 YGR201CYGR201C 678 nt11.25□□□□□ -0.61
UBP3Q01477 RRT5YFR032C 870 nt11.22□□□□□ -0.61
UBP3Q01477 TIM17YJL143W 477 nt11.22□□□□□ -0.61 RIP-Chip
UBP3Q01477 NIT1YIL164C 600 nt11.21□□□□□ -0.61
UBP3Q01477 VPS75YNL246W 795 nt11.2□□□□□ -0.62
UBP3Q01477 AVT6YER119C 1347 nt11.18□□□□□ -0.62 RIP-Chip
UBP3Q01477 MCH5YOR306C 1566 nt11.17□□□□□ -0.62 RIP-Chip
UBP3Q01477 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.16□□□□□ -0.62
UBP3Q01477 FUR4YBR021W 1902 nt11.14□□□□□ -0.63
UBP3Q01477 SGT2YOR007C 1041 nt11.14□□□□□ -0.63 RIP-Chip
UBP3Q01477 GOR1YNL274C 1053 nt11.12□□□□□ -0.63
UBP3Q01477 DUS1YML080W 1272 nt11.1□□□□□ -0.63 RIP-Chip
UBP3Q01477 MIR1YJR077C 936 nt11.09□□□□□ -0.63 RIP-Chip
UBP3Q01477 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.07□□□□□ -0.64
UBP3Q01477 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.07□□□□□ -0.64
UBP3Q01477 STR3YGL184C 1398 nt11.07□□□□□ -0.64
UBP3Q01477 DAT1YML113W 747 nt11.04□□□□□ -0.64 RIP-Chip
UBP3Q01477 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.04□□□□□ -0.64
UBP3Q01477 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.04□□□□□ -0.64
UBP3Q01477 HSP60YLR259C 1719 nt11.04□□□□□ -0.64
UBP3Q01477 YCL074WYCL074W 927 nt11.03□□□□□ -0.64
UBP3Q01477 GLK1YCL040W 1503 nt11.01□□□□□ -0.65
UBP3Q01477 PAU7YAR020C 168 nt11.01□□□□□ -0.65
UBP3Q01477 YDR010CYDR010C 333 nt11□□□□□ -0.65
UBP3Q01477 SHB17YKR043C 816 nt10.99□□□□□ -0.65
UBP3Q01477 THI74YDR438W 1113 nt10.98□□□□□ -0.65
UBP3Q01477 AQY2YLL052C 450 nt10.97□□□□□ -0.65
UBP3Q01477 YCR102CYCR102C 1107 nt10.96□□□□□ -0.65 RIP-Chip
UBP3Q01477 NBP35YGL091C 987 nt10.96□□□□□ -0.65
UBP3Q01477 NAT4YMR069W 858 nt10.95□□□□□ -0.66
UBP3Q01477 MSF1YPR047W 1410 nt10.93□□□□□ -0.66
UBP3Q01477 UBA4YHR111W 1323 nt10.93□□□□□ -0.66 RIP-Chip
UBP3Q01477 YGR139WYGR139W 339 nt10.93□□□□□ -0.66
UBP3Q01477 YKR005CYKR005C 1578 nt10.89□□□□□ -0.67 RIP-Chip
UBP3Q01477 PRP4YPR178W 1398 nt10.89□□□□□ -0.67
UBP3Q01477 SHH4YLR164W 507 nt10.88□□□□□ -0.67
UBP3Q01477 SFA1YDL168W 1161 nt10.86□□□□□ -0.67 RIP-Chip
UBP3Q01477 RET2YFR051C 1641 nt10.85□□□□□ -0.67 RIP-Chip
UBP3Q01477 DPS1YLL018C 1674 nt10.83□□□□□ -0.68
UBP3Q01477 YSR3YKR053C 1215 nt10.83□□□□□ -0.68
UBP3Q01477 PHO89YBR296C 1725 nt10.83□□□□□ -0.68
UBP3Q01477 YGR259CYGR259C 441 nt10.82□□□□□ -0.68
UBP3Q01477 ALG12YNR030W 1656 nt10.82□□□□□ -0.68
UBP3Q01477 YGL034CYGL034C 366 nt10.81□□□□□ -0.68
UBP3Q01477 XYL2YLR070C 1071 nt10.81□□□□□ -0.68
UBP3Q01477 TIR3YIL011W 810 nt10.79□□□□□ -0.68
UBP3Q01477 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.77□□□□□ -0.69
UBP3Q01477 ARP6YLR085C 1317 nt10.77□□□□□ -0.69
UBP3Q01477 COQ2YNR041C 1119 nt10.76□□□□□ -0.69 RIP-Chip
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