Protein–RNA interactions for Protein: Q01454

CTF4, DNA polymerase alpha-binding protein, yeastyeast

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF4Q01454 CCT4YDL143W 1587 nt13.8□□□□□ -0.2
CTF4Q01454 SBA1YKL117W 651 nt13.8□□□□□ -0.2
CTF4Q01454 BDH1YAL060W 1149 nt13.8□□□□□ -0.2
CTF4Q01454 YNL115CYNL115C 1935 nt13.78□□□□□ -0.2
CTF4Q01454 SPC25YER018C 666 nt13.78□□□□□ -0.2
CTF4Q01454 YFL067WYFL067W 528 nt13.78□□□□□ -0.2
CTF4Q01454 ERF2YLR246W 1080 nt13.78□□□□□ -0.2
CTF4Q01454 SWC5YBR231C 912 nt13.78□□□□□ -0.2
CTF4Q01454 ATF2YGR177C 1608 nt13.78□□□□□ -0.2
CTF4Q01454 GPI16YHR188C 1833 nt13.77□□□□□ -0.21
CTF4Q01454 YSP3YOR003W 1437 nt13.76□□□□□ -0.21
CTF4Q01454 NAT4YMR069W 858 nt13.75□□□□□ -0.21
CTF4Q01454 GLK1YCL040W 1503 nt13.73□□□□□ -0.21
CTF4Q01454 BDF1YLR399C 2061 nt13.73□□□□□ -0.21
CTF4Q01454 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.71□□□□□ -0.21
CTF4Q01454 VPS60YDR486C 690 nt13.71□□□□□ -0.21
CTF4Q01454 PCH2YBR186W 1695 nt13.67□□□□□ -0.22
CTF4Q01454 FEN2YCR028C 1539 nt13.66□□□□□ -0.22
CTF4Q01454 CRR1YLR213C 1269 nt13.66□□□□□ -0.22
CTF4Q01454 ALG3YBL082C 1377 nt13.61□□□□□ -0.23
CTF4Q01454 HEM12YDR047W 1089 nt13.6□□□□□ -0.23
CTF4Q01454 ANP1YEL036C 1503 nt13.59□□□□□ -0.23
CTF4Q01454 SNG1YGR197C 1644 nt13.58□□□□□ -0.24
CTF4Q01454 TAT1YBR069C 1860 nt13.57□□□□□ -0.24
CTF4Q01454 MSF1YPR047W 1410 nt13.56□□□□□ -0.24
CTF4Q01454 VPS75YNL246W 795 nt13.56□□□□□ -0.24
CTF4Q01454 THI74YDR438W 1113 nt13.55□□□□□ -0.24
CTF4Q01454 PAU7YAR020C 168 nt13.54□□□□□ -0.24
CTF4Q01454 MIC10YCL057C-A 294 nt13.54□□□□□ -0.24
CTF4Q01454 GUT2YIL155C 1950 nt13.54□□□□□ -0.24
CTF4Q01454 NCP1YHR042W 2076 nt13.53□□□□□ -0.24
CTF4Q01454 BOP3YNL042W 1191 nt13.53□□□□□ -0.24
CTF4Q01454 SPT8YLR055C 1809 nt13.53□□□□□ -0.24
CTF4Q01454 YIR016WYIR016W 798 nt13.52□□□□□ -0.25
CTF4Q01454 MIR1YJR077C 936 nt13.51□□□□□ -0.25
CTF4Q01454 LYS4YDR234W 2082 nt13.48□□□□□ -0.25
CTF4Q01454 TIM17YJL143W 477 nt13.47□□□□□ -0.25
CTF4Q01454 RTF1YGL244W 1677 nt13.46□□□□□ -0.26
CTF4Q01454 BNA2YJR078W 1362 nt13.42□□□□□ -0.26
CTF4Q01454 DAT1YML113W 747 nt13.39□□□□□ -0.27
CTF4Q01454 SHM2YLR058C 1410 nt13.35□□□□□ -0.27
CTF4Q01454 XDJ1YLR090W 1380 nt13.32□□□□□ -0.28
CTF4Q01454 UBA4YHR111W 1323 nt13.31□□□□□ -0.28
CTF4Q01454 YGL034CYGL034C 366 nt13.3□□□□□ -0.28
CTF4Q01454 SHB17YKR043C 816 nt13.29□□□□□ -0.28
CTF4Q01454 YSR3YKR053C 1215 nt13.28□□□□□ -0.28
CTF4Q01454 PIB2YGL023C 1908 nt13.27□□□□□ -0.28
CTF4Q01454 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.27□□□□□ -0.29
CTF4Q01454 GDH3YAL062W 1374 nt13.27□□□□□ -0.29
CTF4Q01454 RAX1YOR301W 1308 nt13.26□□□□□ -0.29
CTF4Q01454 YMR244WYMR244W 1068 nt13.24□□□□□ -0.29
CTF4Q01454 SGT2YOR007C 1041 nt13.24□□□□□ -0.29
CTF4Q01454 HHO1YPL127C 777 nt13.24□□□□□ -0.29
CTF4Q01454 GLR1YPL091W 1452 nt13.23□□□□□ -0.29
CTF4Q01454 NDI1YML120C 1542 nt13.2□□□□□ -0.3
CTF4Q01454 XYL2YLR070C 1071 nt13.2□□□□□ -0.3
CTF4Q01454 MIC12YBR262C 321 nt13.2□□□□□ -0.3
CTF4Q01454 Q0182Q0182 405 nt13.19□□□□□ -0.3
CTF4Q01454 RBG1YAL036C 1110 nt13.19□□□□□ -0.3
CTF4Q01454 PTK1YKL198C 1989 nt13.19□□□□□ -0.3
CTF4Q01454 NIT1YIL164C 600 nt13.17□□□□□ -0.3
CTF4Q01454 YDR010CYDR010C 333 nt13.15□□□□□ -0.3
CTF4Q01454 PHO89YBR296C 1725 nt13.14□□□□□ -0.31
CTF4Q01454 AVT6YER119C 1347 nt13.13□□□□□ -0.31
CTF4Q01454 YFL054CYFL054C 1941 nt13.13□□□□□ -0.31
CTF4Q01454 YGR201CYGR201C 678 nt13.13□□□□□ -0.31
CTF4Q01454 YCR087WYCR087W 516 nt13.08□□□□□ -0.32
CTF4Q01454 GOR1YNL274C 1053 nt13.08□□□□□ -0.32
CTF4Q01454 RET2YFR051C 1641 nt13.07□□□□□ -0.32
CTF4Q01454 MRP20YDR405W 792 nt13.02□□□□□ -0.33
CTF4Q01454 RBG2YGR173W 1107 nt13.01□□□□□ -0.33
CTF4Q01454 AIM45YPR004C 1035 nt13.01□□□□□ -0.33
CTF4Q01454 YCR102CYCR102C 1107 nt12.95□□□□□ -0.34
CTF4Q01454 DUT1YBR252W 444 nt12.92□□□□□ -0.34
CTF4Q01454 COQ2YNR041C 1119 nt12.91□□□□□ -0.34
CTF4Q01454 CCA1YER168C 1641 nt12.9□□□□□ -0.34
CTF4Q01454 YMR226CYMR226C 804 nt12.88□□□□□ -0.35
CTF4Q01454 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.87□□□□□ -0.35
CTF4Q01454 AGP1YCL025C 1902 nt12.87□□□□□ -0.35
CTF4Q01454 SFA1YDL168W 1161 nt12.85□□□□□ -0.35
CTF4Q01454 YLR111WYLR111W 333 nt12.84□□□□□ -0.35
CTF4Q01454 DUS1YML080W 1272 nt12.84□□□□□ -0.35
CTF4Q01454 SDH5YOL071W 489 nt12.8□□□□□ -0.36
CTF4Q01454 SWE1YJL187C 2460 nt12.78□□□□□ -0.36
CTF4Q01454 RPL4BYDR012W 1089 nt12.77□□□□□ -0.37
CTF4Q01454 CLB6YGR109C 1143 nt12.77□□□□□ -0.37
CTF4Q01454 RPL4AYBR031W 1089 nt12.77□□□□□ -0.37
CTF4Q01454 AQY2YLL052C 450 nt12.74□□□□□ -0.37
CTF4Q01454 NBP35YGL091C 987 nt12.71□□□□□ -0.37
CTF4Q01454 TIR3YIL011W 810 nt12.69□□□□□ -0.38
CTF4Q01454 SHH4YLR164W 507 nt12.69□□□□□ -0.38
CTF4Q01454 TOM6YOR045W 186 nt12.68□□□□□ -0.38
CTF4Q01454 SAM1YLR180W 1149 nt12.67□□□□□ -0.38
CTF4Q01454 UTH1YKR042W 1098 nt12.66□□□□□ -0.38
CTF4Q01454 RPS14BYJL191W 417 nt12.65□□□□□ -0.38
CTF4Q01454 PEX2YJL210W 816 nt12.65□□□□□ -0.38
CTF4Q01454 STR3YGL184C 1398 nt12.63□□□□□ -0.39
CTF4Q01454 RAD23YEL037C 1197 nt12.59□□□□□ -0.39
CTF4Q01454 POM34YLR018C 900 nt12.59□□□□□ -0.39
CTF4Q01454 NRT1YOR071C 1797 nt12.58□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 86.6 ms