Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH15P55291 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH15P55291 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH15P55291 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH15P55291 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH15P55291 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH15P55291 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH15P55291 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH15P55291 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH15P55291 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH15P55291 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH15P55291 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH15P55291 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH15P55291 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH15P55291 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH15P55291 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH15P55291 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH15P55291 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH15P55291 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH15P55291 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH15P55291 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH15P55291 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH15P55291 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH15P55291 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH15P55291 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH15P55291 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH15P55291 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH15P55291 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH15P55291 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH15P55291 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH15P55291 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH15P55291 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH15P55291 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH15P55291 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH15P55291 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH15P55291 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH15P55291 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH15P55291 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH15P55291 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH15P55291 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH15P55291 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH15P55291 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDH15P55291 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH15P55291 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH15P55291 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH15P55291 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH15P55291 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH15P55291 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH15P55291 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH15P55291 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH15P55291 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH15P55291 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH15P55291 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH15P55291 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH15P55291 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH15P55291 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH15P55291 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH15P55291 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH15P55291 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH15P55291 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDH15P55291 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDH15P55291 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH15P55291 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH15P55291 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH15P55291 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH15P55291 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH15P55291 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH15P55291 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH15P55291 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH15P55291 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH15P55291 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH15P55291 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH15P55291 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH15P55291 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH15P55291 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH15P55291 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH15P55291 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH15P55291 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH15P55291 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH15P55291 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH15P55291 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH15P55291 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH15P55291 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH15P55291 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH15P55291 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH15P55291 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH15P55291 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH15P55291 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH15P55291 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH15P55291 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH15P55291 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH15P55291 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH15P55291 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH15P55291 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH15P55291 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH15P55291 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH15P55291 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH15P55291 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH15P55291 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH15P55291 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms