Protein–RNA interactions for Protein: P53946

ARP5, Actin-related protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARP5P53946 AHT1YHR093W 549 nt12.66□□□□□ -0.38
ARP5P53946 WSC2YNL283C 1512 nt12.66□□□□□ -0.38
ARP5P53946 ADO1YJR105W 1023 nt12.65□□□□□ -0.38
ARP5P53946 DDR2YOL052C-A 186 nt12.65□□□□□ -0.38
ARP5P53946 HEM12YDR047W 1089 nt12.64□□□□□ -0.39
ARP5P53946 SNG1YGR197C 1644 nt12.63□□□□□ -0.39
ARP5P53946 SPT8YLR055C 1809 nt12.63□□□□□ -0.39
ARP5P53946 MIC10YCL057C-A 294 nt12.63□□□□□ -0.39
ARP5P53946 SPC25YER018C 666 nt12.62□□□□□ -0.39
ARP5P53946 HUA1YGR268C 597 nt12.62□□□□□ -0.39
ARP5P53946 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.61□□□□□ -0.39
ARP5P53946 STB1YNL309W 1263 nt12.61□□□□□ -0.39
ARP5P53946 YPR064WYPR064W 420 nt12.61□□□□□ -0.39
ARP5P53946 ANP1YEL036C 1503 nt12.58□□□□□ -0.4
ARP5P53946 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.57□□□□□ -0.4
ARP5P53946 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.55□□□□□ -0.4
ARP5P53946 TAD3YLR316C 969 nt12.54□□□□□ -0.4
ARP5P53946 GPI16YHR188C 1833 nt12.52□□□□□ -0.41
ARP5P53946 CCT4YDL143W 1587 nt12.51□□□□□ -0.41
ARP5P53946 FEN2YCR028C 1539 nt12.5□□□□□ -0.41
ARP5P53946 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.48□□□□□ -0.41
ARP5P53946 VPS60YDR486C 690 nt12.47□□□□□ -0.41
ARP5P53946 SWE1YJL187C 2460 nt12.46□□□□□ -0.41
ARP5P53946 RAX1YOR301W 1308 nt12.46□□□□□ -0.41
ARP5P53946 ALG3YBL082C 1377 nt12.42□□□□□ -0.42
ARP5P53946 YIR016WYIR016W 798 nt12.4□□□□□ -0.42
ARP5P53946 UME6YDR207C 2511 nt12.39□□□□□ -0.43
ARP5P53946 BDH1YAL060W 1149 nt12.39□□□□□ -0.43
ARP5P53946 SWC5YBR231C 912 nt12.39□□□□□ -0.43
ARP5P53946 MIC12YBR262C 321 nt12.39□□□□□ -0.43
ARP5P53946 BNA2YJR078W 1362 nt12.35□□□□□ -0.43
ARP5P53946 Q0182Q0182 405 nt12.31□□□□□ -0.44
ARP5P53946 YLR415CYLR415C 339 nt12.31□□□□□ -0.44
ARP5P53946 CCA1YER168C 1641 nt12.29□□□□□ -0.44
ARP5P53946 YSP3YOR003W 1437 nt12.29□□□□□ -0.44
ARP5P53946 BOR1YNL275W 1731 nt12.25□□□□□ -0.45
ARP5P53946 YDR094WYDR094W 336 nt12.22□□□□□ -0.45
ARP5P53946 YFR018CYFR018C 1092 nt12.22□□□□□ -0.45
ARP5P53946 HHO1YPL127C 777 nt12.22□□□□□ -0.45
ARP5P53946 YGR201CYGR201C 678 nt12.2□□□□□ -0.46
ARP5P53946 PEX25YPL112C 1185 nt12.19□□□□□ -0.46
ARP5P53946 AGP1YCL025C 1902 nt12.19□□□□□ -0.46
ARP5P53946 YNL115CYNL115C 1935 nt12.17□□□□□ -0.46
ARP5P53946 XDJ1YLR090W 1380 nt12.17□□□□□ -0.46
ARP5P53946 YFL066CYFL066C 1179 nt12.13□□□□□ -0.47
ARP5P53946 UBX6YJL048C 1191 nt12.11□□□□□ -0.47
ARP5P53946 SHM2YLR058C 1410 nt12.11□□□□□ -0.47
ARP5P53946 GDH3YAL062W 1374 nt12.09□□□□□ -0.47
ARP5P53946 TIM17YJL143W 477 nt12.09□□□□□ -0.47
ARP5P53946 PRE6YOL038W 765 nt12.09□□□□□ -0.47
ARP5P53946 FUR4YBR021W 1902 nt12.05□□□□□ -0.48
ARP5P53946 VPS75YNL246W 795 nt12.05□□□□□ -0.48
ARP5P53946 NIT1YIL164C 600 nt12.01□□□□□ -0.49
ARP5P53946 DUT1YBR252W 444 nt12.01□□□□□ -0.49
ARP5P53946 AVT6YER119C 1347 nt12.01□□□□□ -0.49
ARP5P53946 RRT5YFR032C 870 nt12□□□□□ -0.49
ARP5P53946 HSP60YLR259C 1719 nt11.98□□□□□ -0.49
ARP5P53946 GOR1YNL274C 1053 nt11.98□□□□□ -0.49
ARP5P53946 GLK1YCL040W 1503 nt11.96□□□□□ -0.49
ARP5P53946 YCL074WYCL074W 927 nt11.96□□□□□ -0.49
ARP5P53946 PAU16YKL224C 372 nt11.96□□□□□ -0.49
ARP5P53946 DUS1YML080W 1272 nt11.96□□□□□ -0.49
ARP5P53946 DAT1YML113W 747 nt11.95□□□□□ -0.5
ARP5P53946 SGT2YOR007C 1041 nt11.94□□□□□ -0.5
ARP5P53946 MCH5YOR306C 1566 nt11.92□□□□□ -0.5
ARP5P53946 STR3YGL184C 1398 nt11.92□□□□□ -0.5
ARP5P53946 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.9□□□□□ -0.5
ARP5P53946 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.9□□□□□ -0.5
ARP5P53946 ALG12YNR030W 1656 nt11.89□□□□□ -0.51
ARP5P53946 MIR1YJR077C 936 nt11.84□□□□□ -0.51
ARP5P53946 YCR102CYCR102C 1107 nt11.83□□□□□ -0.52
ARP5P53946 PRP4YPR178W 1398 nt11.81□□□□□ -0.52
ARP5P53946 YKR005CYKR005C 1578 nt11.8□□□□□ -0.52
ARP5P53946 PAU7YAR020C 168 nt11.8□□□□□ -0.52
ARP5P53946 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.79□□□□□ -0.52
ARP5P53946 NBP35YGL091C 987 nt11.79□□□□□ -0.52
ARP5P53946 AQY2YLL052C 450 nt11.79□□□□□ -0.52
ARP5P53946 YDR010CYDR010C 333 nt11.75□□□□□ -0.53
ARP5P53946 DPS1YLL018C 1674 nt11.75□□□□□ -0.53
ARP5P53946 SHB17YKR043C 816 nt11.74□□□□□ -0.53
ARP5P53946 YGR259CYGR259C 441 nt11.73□□□□□ -0.53
ARP5P53946 THI74YDR438W 1113 nt11.72□□□□□ -0.53
ARP5P53946 NAT4YMR069W 858 nt11.7□□□□□ -0.54
ARP5P53946 RTN2YDL204W 1182 nt11.69□□□□□ -0.54
ARP5P53946 UBA4YHR111W 1323 nt11.68□□□□□ -0.54
ARP5P53946 BMT6YLR063W 1098 nt11.67□□□□□ -0.54
ARP5P53946 MSF1YPR047W 1410 nt11.67□□□□□ -0.54
ARP5P53946 ARP6YLR085C 1317 nt11.65□□□□□ -0.54
ARP5P53946 RET2YFR051C 1641 nt11.65□□□□□ -0.54
ARP5P53946 TIR3YIL011W 810 nt11.65□□□□□ -0.54
ARP5P53946 AAC1YMR056C 930 nt11.65□□□□□ -0.54
ARP5P53946 SHH4YLR164W 507 nt11.61□□□□□ -0.55
ARP5P53946 LSC2YGR244C 1284 nt11.6□□□□□ -0.55
ARP5P53946 IRC24YIR036C 792 nt11.6□□□□□ -0.55
ARP5P53946 SFA1YDL168W 1161 nt11.59□□□□□ -0.55
ARP5P53946 YSR3YKR053C 1215 nt11.58□□□□□ -0.56
ARP5P53946 PHO89YBR296C 1725 nt11.57□□□□□ -0.56
ARP5P53946 SNF1YDR477W 1902 nt11.57□□□□□ -0.56
ARP5P53946 PLB1YMR008C 1995 nt11.56□□□□□ -0.56
ARP5P53946 POM34YLR018C 900 nt11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms