Protein–RNA interactions for Protein: P47076

RPC17, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, yeastyeast

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC17P47076 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.48□□□□□ -0.57
RPC17P47076 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.48□□□□□ -0.57
RPC17P47076 TIM23YNR017W 669 nt11.48□□□□□ -0.57
RPC17P47076 ANP1YEL036C 1503 nt11.45□□□□□ -0.58
RPC17P47076 YLR179CYLR179C 606 nt11.44□□□□□ -0.58
RPC17P47076 CCA1YER168C 1641 nt11.42□□□□□ -0.58
RPC17P47076 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.41□□□□□ -0.58
RPC17P47076 STB1YNL309W 1263 nt11.41□□□□□ -0.58
RPC17P47076 SPC25YER018C 666 nt11.4□□□□□ -0.58
RPC17P47076 HSP60YLR259C 1719 nt11.39□□□□□ -0.59
RPC17P47076 YKL030WYKL030W 606 nt11.38□□□□□ -0.59
RPC17P47076 BNA2YJR078W 1362 nt11.38□□□□□ -0.59
RPC17P47076 GPI16YHR188C 1833 nt11.37□□□□□ -0.59
RPC17P47076 FEN2YCR028C 1539 nt11.35□□□□□ -0.59
RPC17P47076 AHT1YHR093W 549 nt11.34□□□□□ -0.59
RPC17P47076 FUR4YBR021W 1902 nt11.34□□□□□ -0.59
RPC17P47076 WSC2YNL283C 1512 nt11.34□□□□□ -0.59
RPC17P47076 GLK1YCL040W 1503 nt11.32□□□□□ -0.6
RPC17P47076 MIC12YBR262C 321 nt11.32□□□□□ -0.6
RPC17P47076 CCT4YDL143W 1587 nt11.29□□□□□ -0.6
RPC17P47076 VPS60YDR486C 690 nt11.29□□□□□ -0.6
RPC17P47076 YPR064WYPR064W 420 nt11.28□□□□□ -0.6
RPC17P47076 YIR016WYIR016W 798 nt11.25□□□□□ -0.61
RPC17P47076 SWC5YBR231C 912 nt11.24□□□□□ -0.61
RPC17P47076 ALG3YBL082C 1377 nt11.22□□□□□ -0.61
RPC17P47076 HHO1YPL127C 777 nt11.22□□□□□ -0.61
RPC17P47076 AGP1YCL025C 1902 nt11.22□□□□□ -0.61
RPC17P47076 TAD3YLR316C 969 nt11.2□□□□□ -0.62
RPC17P47076 RTG1YOL067C 534 nt11.2□□□□□ -0.62
RPC17P47076 YGR201CYGR201C 678 nt11.16□□□□□ -0.62
RPC17P47076 DUS1YML080W 1272 nt11.16□□□□□ -0.62
RPC17P47076 PRP4YPR178W 1398 nt11.15□□□□□ -0.63
RPC17P47076 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.14□□□□□ -0.63
RPC17P47076 YEL076CYEL076C 651 nt11.14□□□□□ -0.63
RPC17P47076 YLR464WYLR464W 651 nt11.14□□□□□ -0.63
RPC17P47076 YCL074WYCL074W 927 nt11.12□□□□□ -0.63
RPC17P47076 MRPL8YJL063C 717 nt11.12□□□□□ -0.63
RPC17P47076 DPS1YLL018C 1674 nt11.08□□□□□ -0.64
RPC17P47076 XDJ1YLR090W 1380 nt11.08□□□□□ -0.64
RPC17P47076 ALG12YNR030W 1656 nt11.07□□□□□ -0.64
RPC17P47076 YKR005CYKR005C 1578 nt11.07□□□□□ -0.64
RPC17P47076 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.06□□□□□ -0.64
RPC17P47076 BDH1YAL060W 1149 nt11.06□□□□□ -0.64
RPC17P47076 BMT6YLR063W 1098 nt11.05□□□□□ -0.64
RPC17P47076 YLR415CYLR415C 339 nt11.04□□□□□ -0.64
RPC17P47076 AAC1YMR056C 930 nt11.04□□□□□ -0.64
RPC17P47076 HUA1YGR268C 597 nt11.03□□□□□ -0.64
RPC17P47076 DUT1YBR252W 444 nt11□□□□□ -0.65
RPC17P47076 AVT6YER119C 1347 nt11□□□□□ -0.65
RPC17P47076 GDH3YAL062W 1374 nt11□□□□□ -0.65
RPC17P47076 YGR259CYGR259C 441 nt10.99□□□□□ -0.65
RPC17P47076 ADO1YJR105W 1023 nt10.99□□□□□ -0.65
RPC17P47076 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.98□□□□□ -0.65
RPC17P47076 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.98□□□□□ -0.65
RPC17P47076 GOR1YNL274C 1053 nt10.98□□□□□ -0.65
RPC17P47076 STR3YGL184C 1398 nt10.97□□□□□ -0.65
RPC17P47076 UME6YDR207C 2511 nt10.95□□□□□ -0.66
RPC17P47076 SHM2YLR058C 1410 nt10.94□□□□□ -0.66
RPC17P47076 YSP3YOR003W 1437 nt10.94□□□□□ -0.66
RPC17P47076 TIM17YJL143W 477 nt10.93□□□□□ -0.66
RPC17P47076 AQY2YLL052C 450 nt10.91□□□□□ -0.66
RPC17P47076 SNF1YDR477W 1902 nt10.91□□□□□ -0.66
RPC17P47076 IRC24YIR036C 792 nt10.88□□□□□ -0.67
RPC17P47076 MCH5YOR306C 1566 nt10.86□□□□□ -0.67
RPC17P47076 BIO5YNR056C 1686 nt10.85□□□□□ -0.67
RPC17P47076 RTN2YDL204W 1182 nt10.83□□□□□ -0.68
RPC17P47076 NIT1YIL164C 600 nt10.83□□□□□ -0.68
RPC17P47076 DAT1YML113W 747 nt10.83□□□□□ -0.68
RPC17P47076 YNL115CYNL115C 1935 nt10.83□□□□□ -0.68
RPC17P47076 PEX25YPL112C 1185 nt10.81□□□□□ -0.68
RPC17P47076 Q0182Q0182 405 nt10.78□□□□□ -0.68
RPC17P47076 SGT2YOR007C 1041 nt10.78□□□□□ -0.68
RPC17P47076 NAR1YNL240C 1476 nt10.77□□□□□ -0.69
RPC17P47076 YCR102CYCR102C 1107 nt10.75□□□□□ -0.69
RPC17P47076 VPS75YNL246W 795 nt10.73□□□□□ -0.69
RPC17P47076 NBP35YGL091C 987 nt10.72□□□□□ -0.69
RPC17P47076 PBP1YGR178C 2169 nt10.72□□□□□ -0.69
RPC17P47076 YFL066CYFL066C 1179 nt10.71□□□□□ -0.69
RPC17P47076 UBX6YJL048C 1191 nt10.7□□□□□ -0.7
RPC17P47076 YFR018CYFR018C 1092 nt10.68□□□□□ -0.7
RPC17P47076 CYT2YKL087C 675 nt10.66□□□□□ -0.7
RPC17P47076 ARP6YLR085C 1317 nt10.65□□□□□ -0.7
RPC17P47076 PLB1YMR008C 1995 nt10.65□□□□□ -0.7
RPC17P47076 YDR094WYDR094W 336 nt10.57□□□□□ -0.72
RPC17P47076 PAU7YAR020C 168 nt10.57□□□□□ -0.72
RPC17P47076 PRE6YOL038W 765 nt10.57□□□□□ -0.72
RPC17P47076 TIR3YIL011W 810 nt10.56□□□□□ -0.72
RPC17P47076 LSC2YGR244C 1284 nt10.53□□□□□ -0.72
RPC17P47076 PRM5YIL117C 957 nt10.52□□□□□ -0.73
RPC17P47076 SHH4YLR164W 507 nt10.51□□□□□ -0.73
RPC17P47076 GAP1YKR039W 1809 nt10.49□□□□□ -0.73
RPC17P47076 UTR1YJR049C 1593 nt10.48□□□□□ -0.73
RPC17P47076 RRT5YFR032C 870 nt10.48□□□□□ -0.73
RPC17P47076 SHB17YKR043C 816 nt10.48□□□□□ -0.73
RPC17P47076 ALD4YOR374W 1560 nt10.48□□□□□ -0.73
RPC17P47076 YDR010CYDR010C 333 nt10.47□□□□□ -0.73
RPC17P47076 PRO1YDR300C 1287 nt10.46□□□□□ -0.73
RPC17P47076 HIF1YLL022C 1158 nt10.46□□□□□ -0.73
RPC17P47076 MIR1YJR077C 936 nt10.44□□□□□ -0.74
RPC17P47076 POM34YLR018C 900 nt10.44□□□□□ -0.74
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