Protein–RNA interactions for Protein: P45818

ROK1, ATP-dependent RNA helicase ROK1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ROK1P45818 YFL067WYFL067W 528 nt11.17□□□□□ -0.62
ROK1P45818 WSC2YNL283C 1512 nt11.17□□□□□ -0.62
ROK1P45818 ATF2YGR177C 1608 nt11.17□□□□□ -0.62
ROK1P45818 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.13□□□□□ -0.63
ROK1P45818 TAD3YLR316C 969 nt11.13□□□□□ -0.63
ROK1P45818 DDR2YOL052C-A 186 nt11.13□□□□□ -0.63
ROK1P45818 SPC25YER018C 666 nt11.1□□□□□ -0.63
ROK1P45818 STB1YNL309W 1263 nt11.1□□□□□ -0.63
ROK1P45818 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.09□□□□□ -0.63
ROK1P45818 HEM12YDR047W 1089 nt11.08□□□□□ -0.64
ROK1P45818 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.06□□□□□ -0.64
ROK1P45818 SNG1YGR197C 1644 nt11.06□□□□□ -0.64
ROK1P45818 GPI16YHR188C 1833 nt11.05□□□□□ -0.64
ROK1P45818 ANP1YEL036C 1503 nt11.04□□□□□ -0.64
ROK1P45818 CCT4YDL143W 1587 nt11.03□□□□□ -0.64
ROK1P45818 YDR094WYDR094W 336 nt11.03□□□□□ -0.64
ROK1P45818 MIC10YCL057C-A 294 nt11.01□□□□□ -0.65
ROK1P45818 UBX6YJL048C 1191 nt11□□□□□ -0.65
ROK1P45818 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.99□□□□□ -0.65
ROK1P45818 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.99□□□□□ -0.65
ROK1P45818 FEN2YCR028C 1539 nt10.99□□□□□ -0.65
ROK1P45818 YFL054CYFL054C 1941 nt10.98□□□□□ -0.65
ROK1P45818 VPS60YDR486C 690 nt10.97□□□□□ -0.65
ROK1P45818 BDH1YAL060W 1149 nt10.96□□□□□ -0.65
ROK1P45818 SWC5YBR231C 912 nt10.96□□□□□ -0.65
ROK1P45818 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.95□□□□□ -0.66
ROK1P45818 YFR018CYFR018C 1092 nt10.93□□□□□ -0.66
ROK1P45818 YLR415CYLR415C 339 nt10.93□□□□□ -0.66
ROK1P45818 ALG3YBL082C 1377 nt10.91□□□□□ -0.66
ROK1P45818 YSP3YOR003W 1437 nt10.9□□□□□ -0.66
ROK1P45818 YIR016WYIR016W 798 nt10.89□□□□□ -0.67
ROK1P45818 SPT8YLR055C 1809 nt10.88□□□□□ -0.67
ROK1P45818 RAX1YOR301W 1308 nt10.87□□□□□ -0.67
ROK1P45818 PEX25YPL112C 1185 nt10.85□□□□□ -0.67
ROK1P45818 BNA2YJR078W 1362 nt10.85□□□□□ -0.67
ROK1P45818 MIC12YBR262C 321 nt10.83□□□□□ -0.68
ROK1P45818 YNL115CYNL115C 1935 nt10.81□□□□□ -0.68
ROK1P45818 RRT5YFR032C 870 nt10.8□□□□□ -0.68
ROK1P45818 YFL066CYFL066C 1179 nt10.79□□□□□ -0.68
ROK1P45818 PRE6YOL038W 765 nt10.79□□□□□ -0.68
ROK1P45818 SWE1YJL187C 2460 nt10.76□□□□□ -0.69
ROK1P45818 UME6YDR207C 2511 nt10.76□□□□□ -0.69
ROK1P45818 PAU16YKL224C 372 nt10.74□□□□□ -0.69
ROK1P45818 YGR201CYGR201C 678 nt10.71□□□□□ -0.69
ROK1P45818 TIM17YJL143W 477 nt10.71□□□□□ -0.69
ROK1P45818 VPS75YNL246W 795 nt10.71□□□□□ -0.69
ROK1P45818 HHO1YPL127C 777 nt10.71□□□□□ -0.69
ROK1P45818 XDJ1YLR090W 1380 nt10.7□□□□□ -0.7
ROK1P45818 RPM1RPM1 483 nt10.69□□□□□ -0.7
ROK1P45818 CCA1YER168C 1641 nt10.67□□□□□ -0.7
ROK1P45818 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.67□□□□□ -0.7
ROK1P45818 SHM2YLR058C 1410 nt10.67□□□□□ -0.7
ROK1P45818 GDH3YAL062W 1374 nt10.64□□□□□ -0.71
ROK1P45818 AGP1YCL025C 1902 nt10.59□□□□□ -0.71
ROK1P45818 AVT6YER119C 1347 nt10.57□□□□□ -0.72
ROK1P45818 NIT1YIL164C 600 nt10.56□□□□□ -0.72
ROK1P45818 MIR1YJR077C 936 nt10.55□□□□□ -0.72
ROK1P45818 GLK1YCL040W 1503 nt10.54□□□□□ -0.72
ROK1P45818 SGT2YOR007C 1041 nt10.54□□□□□ -0.72
ROK1P45818 PAU7YAR020C 168 nt10.53□□□□□ -0.72
ROK1P45818 NAT4YMR069W 858 nt10.53□□□□□ -0.72
ROK1P45818 GOR1YNL274C 1053 nt10.53□□□□□ -0.72
ROK1P45818 DAT1YML113W 747 nt10.5□□□□□ -0.73
ROK1P45818 THI74YDR438W 1113 nt10.49□□□□□ -0.73
ROK1P45818 DUT1YBR252W 444 nt10.47□□□□□ -0.73
ROK1P45818 MSF1YPR047W 1410 nt10.46□□□□□ -0.74
ROK1P45818 DUS1YML080W 1272 nt10.45□□□□□ -0.74
ROK1P45818 BOR1YNL275W 1731 nt10.44□□□□□ -0.74
ROK1P45818 YCR102CYCR102C 1107 nt10.43□□□□□ -0.74
ROK1P45818 SHB17YKR043C 816 nt10.43□□□□□ -0.74
ROK1P45818 UBA4YHR111W 1323 nt10.41□□□□□ -0.74
ROK1P45818 YCL074WYCL074W 927 nt10.41□□□□□ -0.74
ROK1P45818 YDR010CYDR010C 333 nt10.41□□□□□ -0.74
ROK1P45818 FUR4YBR021W 1902 nt10.4□□□□□ -0.74
ROK1P45818 STR3YGL184C 1398 nt10.37□□□□□ -0.75
ROK1P45818 RET2YFR051C 1641 nt10.35□□□□□ -0.75
ROK1P45818 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.33□□□□□ -0.76
ROK1P45818 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.33□□□□□ -0.76
ROK1P45818 NBP35YGL091C 987 nt10.33□□□□□ -0.76
ROK1P45818 YSR3YKR053C 1215 nt10.33□□□□□ -0.76
ROK1P45818 YGL034CYGL034C 366 nt10.31□□□□□ -0.76
ROK1P45818 AQY2YLL052C 450 nt10.31□□□□□ -0.76
ROK1P45818 MCH5YOR306C 1566 nt10.3□□□□□ -0.76
ROK1P45818 PHO89YBR296C 1725 nt10.28□□□□□ -0.76
ROK1P45818 YCR087WYCR087W 516 nt10.28□□□□□ -0.76
ROK1P45818 HSP60YLR259C 1719 nt10.27□□□□□ -0.76
ROK1P45818 TIR3YIL011W 810 nt10.25□□□□□ -0.77
ROK1P45818 XYL2YLR070C 1071 nt10.25□□□□□ -0.77
ROK1P45818 SBA1YKL117W 651 nt10.24□□□□□ -0.77
ROK1P45818 SFA1YDL168W 1161 nt10.23□□□□□ -0.77
ROK1P45818 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.2□□□□□ -0.78
ROK1P45818 YKR005CYKR005C 1578 nt10.2□□□□□ -0.78
ROK1P45818 RTN2YDL204W 1182 nt10.19□□□□□ -0.78
ROK1P45818 MRP20YDR405W 792 nt10.19□□□□□ -0.78
ROK1P45818 LSC2YGR244C 1284 nt10.19□□□□□ -0.78
ROK1P45818 SHH4YLR164W 507 nt10.19□□□□□ -0.78
ROK1P45818 PRP4YPR178W 1398 nt10.18□□□□□ -0.78
ROK1P45818 COQ2YNR041C 1119 nt10.18□□□□□ -0.78
ROK1P45818 AIM45YPR004C 1035 nt10.18□□□□□ -0.78
ROK1P45818 ARP6YLR085C 1317 nt10.17□□□□□ -0.78
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