Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 SNG1YGR197C 1644 nt11.88□□□□□ -0.51
SHQ1P40486 YFL067WYFL067W 528 nt11.86□□□□□ -0.51
SHQ1P40486 YJL225CYJL225C 5277 nt11.85□□□□□ -0.51
SHQ1P40486 DDR2YOL052C-A 186 nt11.83□□□□□ -0.52
SHQ1P40486 UBX6YJL048C 1191 nt11.82□□□□□ -0.52
SHQ1P40486 TIM23YNR017W 669 nt11.79□□□□□ -0.52
SHQ1P40486 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.77□□□□□ -0.53
SHQ1P40486 YDR094WYDR094W 336 nt11.76□□□□□ -0.53
SHQ1P40486 RAX1YOR301W 1308 nt11.76□□□□□ -0.53
SHQ1P40486 YLR179CYLR179C 606 nt11.75□□□□□ -0.53
SHQ1P40486 AQY1YPR192W 918 nt11.74□□□□□ -0.53
SHQ1P40486 ANP1YEL036C 1503 nt11.74□□□□□ -0.53
SHQ1P40486 CCA1YER168C 1641 nt11.73□□□□□ -0.53
SHQ1P40486 BOR1YNL275W 1731 nt11.72□□□□□ -0.53
SHQ1P40486 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.72□□□□□ -0.53
SHQ1P40486 STB1YNL309W 1263 nt11.71□□□□□ -0.53
SHQ1P40486 SPC25YER018C 666 nt11.69□□□□□ -0.54
SHQ1P40486 WSC2YNL283C 1512 nt11.68□□□□□ -0.54
SHQ1P40486 HSP60YLR259C 1719 nt11.66□□□□□ -0.54
SHQ1P40486 FEN2YCR028C 1539 nt11.65□□□□□ -0.54
SHQ1P40486 AHT1YHR093W 549 nt11.63□□□□□ -0.55
SHQ1P40486 YPR064WYPR064W 420 nt11.63□□□□□ -0.55
SHQ1P40486 GPI16YHR188C 1833 nt11.63□□□□□ -0.55
SHQ1P40486 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.62□□□□□ -0.55
SHQ1P40486 BNA2YJR078W 1362 nt11.62□□□□□ -0.55
SHQ1P40486 FUR4YBR021W 1902 nt11.62□□□□□ -0.55
SHQ1P40486 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.61□□□□□ -0.55
SHQ1P40486 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.61□□□□□ -0.55
SHQ1P40486 VPS60YDR486C 690 nt11.61□□□□□ -0.55
SHQ1P40486 MIC12YBR262C 321 nt11.6□□□□□ -0.55
SHQ1P40486 CCT4YDL143W 1587 nt11.59□□□□□ -0.55
SHQ1P40486 ALG3YBL082C 1377 nt11.58□□□□□ -0.56
SHQ1P40486 GLK1YCL040W 1503 nt11.58□□□□□ -0.56
SHQ1P40486 YIR016WYIR016W 798 nt11.56□□□□□ -0.56
SHQ1P40486 AGP1YCL025C 1902 nt11.56□□□□□ -0.56
SHQ1P40486 TAD3YLR316C 969 nt11.54□□□□□ -0.56
SHQ1P40486 SWC5YBR231C 912 nt11.52□□□□□ -0.57
SHQ1P40486 YFR018CYFR018C 1092 nt11.49□□□□□ -0.57
SHQ1P40486 HHO1YPL127C 777 nt11.49□□□□□ -0.57
SHQ1P40486 RRT5YFR032C 870 nt11.45□□□□□ -0.58
SHQ1P40486 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.44□□□□□ -0.58
SHQ1P40486 DUS1YML080W 1272 nt11.42□□□□□ -0.58
SHQ1P40486 XDJ1YLR090W 1380 nt11.41□□□□□ -0.58
SHQ1P40486 PRP4YPR178W 1398 nt11.41□□□□□ -0.58
SHQ1P40486 YGR201CYGR201C 678 nt11.39□□□□□ -0.59
SHQ1P40486 Q0182Q0182 405 nt11.39□□□□□ -0.59
SHQ1P40486 BDH1YAL060W 1149 nt11.39□□□□□ -0.59
SHQ1P40486 DUT1YBR252W 444 nt11.39□□□□□ -0.59
SHQ1P40486 PAU16YKL224C 372 nt11.37□□□□□ -0.59
SHQ1P40486 YCL074WYCL074W 927 nt11.36□□□□□ -0.59
SHQ1P40486 DPS1YLL018C 1674 nt11.34□□□□□ -0.59
SHQ1P40486 YKR005CYKR005C 1578 nt11.33□□□□□ -0.6
SHQ1P40486 YLR415CYLR415C 339 nt11.32□□□□□ -0.6
SHQ1P40486 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.3□□□□□ -0.6
SHQ1P40486 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.3□□□□□ -0.6
SHQ1P40486 ALG12YNR030W 1656 nt11.3□□□□□ -0.6
SHQ1P40486 PEX25YPL112C 1185 nt11.3□□□□□ -0.6
SHQ1P40486 GDH3YAL062W 1374 nt11.29□□□□□ -0.6
SHQ1P40486 PRE6YOL038W 765 nt11.29□□□□□ -0.6
SHQ1P40486 AVT6YER119C 1347 nt11.29□□□□□ -0.6
SHQ1P40486 STR3YGL184C 1398 nt11.27□□□□□ -0.61
SHQ1P40486 YSP3YOR003W 1437 nt11.26□□□□□ -0.61
SHQ1P40486 AAC1YMR056C 930 nt11.26□□□□□ -0.61
SHQ1P40486 SHM2YLR058C 1410 nt11.25□□□□□ -0.61
SHQ1P40486 YFL066CYFL066C 1179 nt11.24□□□□□ -0.61
SHQ1P40486 YGR259CYGR259C 441 nt11.24□□□□□ -0.61
SHQ1P40486 BMT6YLR063W 1098 nt11.24□□□□□ -0.61
SHQ1P40486 GOR1YNL274C 1053 nt11.24□□□□□ -0.61
SHQ1P40486 YNL115CYNL115C 1935 nt11.22□□□□□ -0.61
SHQ1P40486 UME6YDR207C 2511 nt11.22□□□□□ -0.61
SHQ1P40486 SNF1YDR477W 1902 nt11.21□□□□□ -0.61
SHQ1P40486 AQY2YLL052C 450 nt11.21□□□□□ -0.61
SHQ1P40486 TIM17YJL143W 477 nt11.18□□□□□ -0.62
SHQ1P40486 NIT1YIL164C 600 nt11.15□□□□□ -0.62
SHQ1P40486 NAT4YMR069W 858 nt11.15□□□□□ -0.62
SHQ1P40486 BIO5YNR056C 1686 nt11.14□□□□□ -0.63
SHQ1P40486 MCH5YOR306C 1566 nt11.13□□□□□ -0.63
SHQ1P40486 VPS75YNL246W 795 nt11.13□□□□□ -0.63
SHQ1P40486 IRC24YIR036C 792 nt11.09□□□□□ -0.63
SHQ1P40486 SGT2YOR007C 1041 nt11.09□□□□□ -0.63
SHQ1P40486 DAT1YML113W 747 nt11.08□□□□□ -0.64
SHQ1P40486 RTN2YDL204W 1182 nt11.05□□□□□ -0.64
SHQ1P40486 SBA1YKL117W 651 nt11.03□□□□□ -0.64
SHQ1P40486 NAR1YNL240C 1476 nt11.03□□□□□ -0.64
SHQ1P40486 THI74YDR438W 1113 nt11.02□□□□□ -0.65
SHQ1P40486 MSF1YPR047W 1410 nt11.01□□□□□ -0.65
SHQ1P40486 MIR1YJR077C 936 nt11.01□□□□□ -0.65
SHQ1P40486 PAU7YAR020C 168 nt11.01□□□□□ -0.65
SHQ1P40486 NBP35YGL091C 987 nt11□□□□□ -0.65
SHQ1P40486 YCR102CYCR102C 1107 nt10.99□□□□□ -0.65
SHQ1P40486 PBP1YGR178C 2169 nt10.97□□□□□ -0.65
SHQ1P40486 PLB1YMR008C 1995 nt10.93□□□□□ -0.66
SHQ1P40486 ARP6YLR085C 1317 nt10.89□□□□□ -0.67
SHQ1P40486 CYT2YKL087C 675 nt10.88□□□□□ -0.67
SHQ1P40486 SHH4YLR164W 507 nt10.86□□□□□ -0.67
SHQ1P40486 UBA4YHR111W 1323 nt10.84□□□□□ -0.67
SHQ1P40486 PRM5YIL117C 957 nt10.82□□□□□ -0.68
SHQ1P40486 SHB17YKR043C 816 nt10.82□□□□□ -0.68
SHQ1P40486 TIR3YIL011W 810 nt10.81□□□□□ -0.68
SHQ1P40486 YGL034CYGL034C 366 nt10.8□□□□□ -0.68
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