Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.79□□□□□ -0.52
VFA1P40080 STB1YNL309W 1263 nt11.79□□□□□ -0.52
VFA1P40080 ANP1YEL036C 1503 nt11.79□□□□□ -0.52
VFA1P40080 RAX1YOR301W 1308 nt11.78□□□□□ -0.52
VFA1P40080 WSC2YNL283C 1512 nt11.77□□□□□ -0.52
VFA1P40080 RTG1YOL067C 534 nt11.76□□□□□ -0.53
VFA1P40080 SPC25YER018C 666 nt11.75□□□□□ -0.53
VFA1P40080 AHT1YHR093W 549 nt11.73□□□□□ -0.53
VFA1P40080 CCA1YER168C 1641 nt11.72□□□□□ -0.53
VFA1P40080 FEN2YCR028C 1539 nt11.72□□□□□ -0.53
VFA1P40080 NVJ2YPR091C 2313 nt11.71□□□□□ -0.53
VFA1P40080 GPI16YHR188C 1833 nt11.7□□□□□ -0.54
VFA1P40080 VPS60YDR486C 690 nt11.69□□□□□ -0.54
VFA1P40080 YPR064WYPR064W 420 nt11.69□□□□□ -0.54
VFA1P40080 BNA2YJR078W 1362 nt11.67□□□□□ -0.54
VFA1P40080 CCT4YDL143W 1587 nt11.67□□□□□ -0.54
VFA1P40080 ALG3YBL082C 1377 nt11.64□□□□□ -0.55
VFA1P40080 MIC12YBR262C 321 nt11.63□□□□□ -0.55
VFA1P40080 YIR016WYIR016W 798 nt11.62□□□□□ -0.55
VFA1P40080 SWC5YBR231C 912 nt11.62□□□□□ -0.55
VFA1P40080 BOR1YNL275W 1731 nt11.62□□□□□ -0.55
VFA1P40080 TAD3YLR316C 969 nt11.61□□□□□ -0.55
VFA1P40080 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.59□□□□□ -0.55
VFA1P40080 YEL076CYEL076C 651 nt11.59□□□□□ -0.55
VFA1P40080 YLR464WYLR464W 651 nt11.59□□□□□ -0.55
VFA1P40080 HSP60YLR259C 1719 nt11.57□□□□□ -0.56
VFA1P40080 FUR4YBR021W 1902 nt11.57□□□□□ -0.56
VFA1P40080 AGP1YCL025C 1902 nt11.56□□□□□ -0.56
VFA1P40080 HHO1YPL127C 777 nt11.53□□□□□ -0.56
VFA1P40080 HUA1YGR268C 597 nt11.52□□□□□ -0.57
VFA1P40080 GLK1YCL040W 1503 nt11.51□□□□□ -0.57
VFA1P40080 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.49□□□□□ -0.57
VFA1P40080 BDH1YAL060W 1149 nt11.49□□□□□ -0.57
VFA1P40080 MRPL8YJL063C 717 nt11.47□□□□□ -0.57
VFA1P40080 DUS1YML080W 1272 nt11.46□□□□□ -0.57
VFA1P40080 YGR201CYGR201C 678 nt11.44□□□□□ -0.58
VFA1P40080 YLR415CYLR415C 339 nt11.44□□□□□ -0.58
VFA1P40080 XDJ1YLR090W 1380 nt11.42□□□□□ -0.58
VFA1P40080 ADO1YJR105W 1023 nt11.42□□□□□ -0.58
VFA1P40080 DUT1YBR252W 444 nt11.41□□□□□ -0.58
VFA1P40080 YSP3YOR003W 1437 nt11.37□□□□□ -0.59
VFA1P40080 YCL074WYCL074W 927 nt11.36□□□□□ -0.59
VFA1P40080 GDH3YAL062W 1374 nt11.36□□□□□ -0.59
VFA1P40080 PRP4YPR178W 1398 nt11.35□□□□□ -0.59
VFA1P40080 AVT6YER119C 1347 nt11.35□□□□□ -0.59
VFA1P40080 SHM2YLR058C 1410 nt11.33□□□□□ -0.6
VFA1P40080 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.3□□□□□ -0.6
VFA1P40080 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.3□□□□□ -0.6
VFA1P40080 GOR1YNL274C 1053 nt11.3□□□□□ -0.6
VFA1P40080 YKR005CYKR005C 1578 nt11.29□□□□□ -0.6
VFA1P40080 YNL115CYNL115C 1935 nt11.29□□□□□ -0.6
VFA1P40080 DPS1YLL018C 1674 nt11.28□□□□□ -0.6
VFA1P40080 TIM17YJL143W 477 nt11.28□□□□□ -0.6
VFA1P40080 STR3YGL184C 1398 nt11.28□□□□□ -0.6
VFA1P40080 PEX25YPL112C 1185 nt11.25□□□□□ -0.61
VFA1P40080 AQY2YLL052C 450 nt11.24□□□□□ -0.61
VFA1P40080 YFL066CYFL066C 1179 nt11.23□□□□□ -0.61
VFA1P40080 YGR259CYGR259C 441 nt11.21□□□□□ -0.61
VFA1P40080 NIT1YIL164C 600 nt11.21□□□□□ -0.61
VFA1P40080 BMT6YLR063W 1098 nt11.21□□□□□ -0.61
VFA1P40080 AAC1YMR056C 930 nt11.2□□□□□ -0.62
VFA1P40080 ALG12YNR030W 1656 nt11.18□□□□□ -0.62
VFA1P40080 SGT2YOR007C 1041 nt11.18□□□□□ -0.62
VFA1P40080 YJL225CYJL225C 5277 nt11.17□□□□□ -0.62
VFA1P40080 PRE6YOL038W 765 nt11.15□□□□□ -0.62
VFA1P40080 SNF1YDR477W 1902 nt11.15□□□□□ -0.62
VFA1P40080 YFR018CYFR018C 1092 nt11.14□□□□□ -0.63
VFA1P40080 DAT1YML113W 747 nt11.14□□□□□ -0.63
VFA1P40080 VPS75YNL246W 795 nt11.11□□□□□ -0.63
VFA1P40080 BIO5YNR056C 1686 nt11.05□□□□□ -0.64
VFA1P40080 YCR102CYCR102C 1107 nt11.05□□□□□ -0.64
VFA1P40080 RTN2YDL204W 1182 nt11.05□□□□□ -0.64
VFA1P40080 IRC24YIR036C 792 nt11.05□□□□□ -0.64
VFA1P40080 YDR094WYDR094W 336 nt11.04□□□□□ -0.64
VFA1P40080 NBP35YGL091C 987 nt11.04□□□□□ -0.64
VFA1P40080 UME6YDR207C 2511 nt11.01□□□□□ -0.65
VFA1P40080 PAU7YAR020C 168 nt10.98□□□□□ -0.65
VFA1P40080 MCH5YOR306C 1566 nt10.98□□□□□ -0.65
VFA1P40080 RRT5YFR032C 870 nt10.96□□□□□ -0.65
VFA1P40080 PLB1YMR008C 1995 nt10.96□□□□□ -0.66
VFA1P40080 UBX6YJL048C 1191 nt10.94□□□□□ -0.66
VFA1P40080 PAU16YKL224C 372 nt10.93□□□□□ -0.66
VFA1P40080 NAR1YNL240C 1476 nt10.93□□□□□ -0.66
VFA1P40080 ARP6YLR085C 1317 nt10.92□□□□□ -0.66
VFA1P40080 SHH4YLR164W 507 nt10.92□□□□□ -0.66
VFA1P40080 SHB17YKR043C 816 nt10.91□□□□□ -0.66
VFA1P40080 YDR010CYDR010C 333 nt10.89□□□□□ -0.67
VFA1P40080 MIR1YJR077C 936 nt10.89□□□□□ -0.67
VFA1P40080 PBP1YGR178C 2169 nt10.86□□□□□ -0.67
VFA1P40080 TIR3YIL011W 810 nt10.86□□□□□ -0.67
VFA1P40080 SFA1YDL168W 1161 nt10.81□□□□□ -0.68
VFA1P40080 PRO1YDR300C 1287 nt10.81□□□□□ -0.68
VFA1P40080 PRM5YIL117C 957 nt10.81□□□□□ -0.68
VFA1P40080 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.8□□□□□ -0.68
VFA1P40080 UBA4YHR111W 1323 nt10.8□□□□□ -0.68
VFA1P40080 LSC2YGR244C 1284 nt10.79□□□□□ -0.68
VFA1P40080 CYT2YKL087C 675 nt10.79□□□□□ -0.68
VFA1P40080 GAP1YKR039W 1809 nt10.79□□□□□ -0.68
VFA1P40080 UTR1YJR049C 1593 nt10.78□□□□□ -0.68
VFA1P40080 RET2YFR051C 1641 nt10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms