Protein–RNA interactions for Protein: P38990

SAK1, SNF1-activating kinase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SAK1P38990 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.52□□□□□ -0.57
SAK1P38990 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.52□□□□□ -0.57
SAK1P38990 YLR235CYLR235C 399 nt11.52□□□□□ -0.57
SAK1P38990 DDR2YOL052C-A 186 nt11.52□□□□□ -0.57
SAK1P38990 TRM5YHR070W 1500 nt11.51□□□□□ -0.57
SAK1P38990 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.51□□□□□ -0.57
SAK1P38990 YKL030WYKL030W 606 nt11.49□□□□□ -0.57
SAK1P38990 MIC10YCL057C-A 294 nt11.49□□□□□ -0.57
SAK1P38990 SNG1YGR197C 1644 nt11.49□□□□□ -0.57
SAK1P38990 AQY1YPR192W 918 nt11.47□□□□□ -0.57
SAK1P38990 TIM23YNR017W 669 nt11.45□□□□□ -0.58
SAK1P38990 RAX1YOR301W 1308 nt11.44□□□□□ -0.58
SAK1P38990 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.44□□□□□ -0.58
SAK1P38990 YDR094WYDR094W 336 nt11.43□□□□□ -0.58
SAK1P38990 YLR179CYLR179C 606 nt11.41□□□□□ -0.58
SAK1P38990 ANP1YEL036C 1503 nt11.37□□□□□ -0.59
SAK1P38990 STB1YNL309W 1263 nt11.37□□□□□ -0.59
SAK1P38990 BOR1YNL275W 1731 nt11.37□□□□□ -0.59
SAK1P38990 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.36□□□□□ -0.59
SAK1P38990 SPC25YER018C 666 nt11.35□□□□□ -0.59
SAK1P38990 BNA2YJR078W 1362 nt11.34□□□□□ -0.59
SAK1P38990 GPI16YHR188C 1833 nt11.32□□□□□ -0.6
SAK1P38990 CCA1YER168C 1641 nt11.31□□□□□ -0.6
SAK1P38990 FEN2YCR028C 1539 nt11.3□□□□□ -0.6
SAK1P38990 AHT1YHR093W 549 nt11.28□□□□□ -0.6
SAK1P38990 YPR064WYPR064W 420 nt11.27□□□□□ -0.61
SAK1P38990 WSC2YNL283C 1512 nt11.26□□□□□ -0.61
SAK1P38990 CCT4YDL143W 1587 nt11.25□□□□□ -0.61
SAK1P38990 HSP60YLR259C 1719 nt11.24□□□□□ -0.61
SAK1P38990 VPS60YDR486C 690 nt11.23□□□□□ -0.61
SAK1P38990 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.23□□□□□ -0.61
SAK1P38990 MIC12YBR262C 321 nt11.23□□□□□ -0.61
SAK1P38990 FUR4YBR021W 1902 nt11.21□□□□□ -0.61
SAK1P38990 GLK1YCL040W 1503 nt11.21□□□□□ -0.61
SAK1P38990 YIR016WYIR016W 798 nt11.21□□□□□ -0.61
SAK1P38990 SWC5YBR231C 912 nt11.21□□□□□ -0.61
SAK1P38990 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.2□□□□□ -0.62
SAK1P38990 TAD3YLR316C 969 nt11.18□□□□□ -0.62
SAK1P38990 HHO1YPL127C 777 nt11.18□□□□□ -0.62
SAK1P38990 MCH5YOR306C 1566 nt11.18□□□□□ -0.62
SAK1P38990 ALG3YBL082C 1377 nt11.16□□□□□ -0.62
SAK1P38990 DUS1YML080W 1272 nt11.1□□□□□ -0.63
SAK1P38990 AGP1YCL025C 1902 nt11.09□□□□□ -0.63
SAK1P38990 YFR018CYFR018C 1092 nt11.09□□□□□ -0.63
SAK1P38990 YGR201CYGR201C 678 nt11.09□□□□□ -0.63
SAK1P38990 PRP4YPR178W 1398 nt11.05□□□□□ -0.64
SAK1P38990 BDH1YAL060W 1149 nt11.05□□□□□ -0.64
SAK1P38990 YCL074WYCL074W 927 nt11.04□□□□□ -0.64
SAK1P38990 RRT5YFR032C 870 nt11.04□□□□□ -0.64
SAK1P38990 PAU16YKL224C 372 nt11.04□□□□□ -0.64
SAK1P38990 PRE6YOL038W 765 nt11.04□□□□□ -0.64
SAK1P38990 YLR415CYLR415C 339 nt11.02□□□□□ -0.65
SAK1P38990 YSP3YOR003W 1437 nt11.01□□□□□ -0.65
SAK1P38990 XDJ1YLR090W 1380 nt11□□□□□ -0.65
SAK1P38990 BMT6YLR063W 1098 nt10.98□□□□□ -0.65
SAK1P38990 YFL066CYFL066C 1179 nt10.97□□□□□ -0.65
SAK1P38990 AVT6YER119C 1347 nt10.97□□□□□ -0.65
SAK1P38990 GDH3YAL062W 1374 nt10.97□□□□□ -0.65
SAK1P38990 DPS1YLL018C 1674 nt10.97□□□□□ -0.65
SAK1P38990 YKR005CYKR005C 1578 nt10.96□□□□□ -0.65
SAK1P38990 GOR1YNL274C 1053 nt10.96□□□□□ -0.65
SAK1P38990 AAC1YMR056C 930 nt10.94□□□□□ -0.66
SAK1P38990 PEX25YPL112C 1185 nt10.94□□□□□ -0.66
SAK1P38990 ALG12YNR030W 1656 nt10.92□□□□□ -0.66
SAK1P38990 DUT1YBR252W 444 nt10.92□□□□□ -0.66
SAK1P38990 TIM17YJL143W 477 nt10.91□□□□□ -0.66
SAK1P38990 YNL115CYNL115C 1935 nt10.91□□□□□ -0.66
SAK1P38990 YGR259CYGR259C 441 nt10.9□□□□□ -0.66
SAK1P38990 SHM2YLR058C 1410 nt10.9□□□□□ -0.66
SAK1P38990 STR3YGL184C 1398 nt10.9□□□□□ -0.67
SAK1P38990 SBA1YKL117W 651 nt10.88□□□□□ -0.67
SAK1P38990 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.86□□□□□ -0.67
SAK1P38990 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.86□□□□□ -0.67
SAK1P38990 AQY2YLL052C 450 nt10.86□□□□□ -0.67
SAK1P38990 IRC24YIR036C 792 nt10.8□□□□□ -0.68
SAK1P38990 DAT1YML113W 747 nt10.77□□□□□ -0.69
SAK1P38990 NIT1YIL164C 600 nt10.76□□□□□ -0.69
SAK1P38990 NAT4YMR069W 858 nt10.76□□□□□ -0.69
SAK1P38990 RTN2YDL204W 1182 nt10.75□□□□□ -0.69
SAK1P38990 VPS75YNL246W 795 nt10.75□□□□□ -0.69
SAK1P38990 SNF1YDR477W 1902 nt10.75□□□□□ -0.69
SAK1P38990 SGT2YOR007C 1041 nt10.73□□□□□ -0.69
SAK1P38990 YCR102CYCR102C 1107 nt10.71□□□□□ -0.69
SAK1P38990 MIR1YJR077C 936 nt10.7□□□□□ -0.7
SAK1P38990 BIO5YNR056C 1686 nt10.69□□□□□ -0.7
SAK1P38990 NBP35YGL091C 987 nt10.66□□□□□ -0.7
SAK1P38990 NAR1YNL240C 1476 nt10.63□□□□□ -0.71
SAK1P38990 MSF1YPR047W 1410 nt10.61□□□□□ -0.71
SAK1P38990 THI74YDR438W 1113 nt10.61□□□□□ -0.71
SAK1P38990 PAU7YAR020C 168 nt10.59□□□□□ -0.71
SAK1P38990 ARP6YLR085C 1317 nt10.58□□□□□ -0.72
SAK1P38990 PLB1YMR008C 1995 nt10.56□□□□□ -0.72
SAK1P38990 CYT2YKL087C 675 nt10.53□□□□□ -0.72
SAK1P38990 PBP1YGR178C 2169 nt10.52□□□□□ -0.72
SAK1P38990 SHB17YKR043C 816 nt10.52□□□□□ -0.73
SAK1P38990 YDR010CYDR010C 333 nt10.51□□□□□ -0.73
SAK1P38990 TIR3YIL011W 810 nt10.51□□□□□ -0.73
SAK1P38990 UBA4YHR111W 1323 nt10.5□□□□□ -0.73
SAK1P38990 LSC2YGR244C 1284 nt10.49□□□□□ -0.73
SAK1P38990 GAP1YKR039W 1809 nt10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.9 ms