Protein–RNA interactions for Protein: P38344

REI1, Cytoplasmic 60S subunit biogenesis factor REI1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REI1P38344 TRM5YHR070W 1500 nt11.7□□□□□ -0.54
REI1P38344 DIC1YLR348C 897 nt11.7□□□□□ -0.54
REI1P38344 ALG12YNR030W 1656 nt11.68□□□□□ -0.54
REI1P38344 DDR2YOL052C-A 186 nt11.65□□□□□ -0.54
REI1P38344 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.63□□□□□ -0.55
REI1P38344 ANP1YEL036C 1503 nt11.6□□□□□ -0.55
REI1P38344 PRP4YPR178W 1398 nt11.56□□□□□ -0.56
REI1P38344 NME1NME1 340 nt11.56□□□□□ -0.56
REI1P38344 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.55□□□□□ -0.56
REI1P38344 YEL076CYEL076C 651 nt11.55□□□□□ -0.56
REI1P38344 YLR464WYLR464W 651 nt11.55□□□□□ -0.56
REI1P38344 MCH5YOR306C 1566 nt11.54□□□□□ -0.56
REI1P38344 AQY1YPR192W 918 nt11.54□□□□□ -0.56
REI1P38344 YGR139WYGR139W 339 nt11.53□□□□□ -0.56
REI1P38344 MIC12YBR262C 321 nt11.53□□□□□ -0.56
REI1P38344 AGP1YCL025C 1902 nt11.52□□□□□ -0.57
REI1P38344 DPS1YLL018C 1674 nt11.52□□□□□ -0.57
REI1P38344 BNA2YJR078W 1362 nt11.52□□□□□ -0.57
REI1P38344 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.49□□□□□ -0.57
REI1P38344 SPC25YER018C 666 nt11.49□□□□□ -0.57
REI1P38344 PTH1YHR189W 573 nt11.49□□□□□ -0.57
REI1P38344 STB1YNL309W 1263 nt11.49□□□□□ -0.57
REI1P38344 AAC1YMR056C 930 nt11.48□□□□□ -0.57
REI1P38344 FEN2YCR028C 1539 nt11.47□□□□□ -0.57
REI1P38344 TIM23YNR017W 669 nt11.45□□□□□ -0.58
REI1P38344 YKR005CYKR005C 1578 nt11.45□□□□□ -0.58
REI1P38344 WSC2YNL283C 1512 nt11.45□□□□□ -0.58
REI1P38344 YLR235CYLR235C 399 nt11.43□□□□□ -0.58
REI1P38344 SPP1YPL138C 1062 nt11.43□□□□□ -0.58
REI1P38344 YLR179CYLR179C 606 nt11.42□□□□□ -0.58
REI1P38344 GPI16YHR188C 1833 nt11.42□□□□□ -0.58
REI1P38344 YCL074WYCL074W 927 nt11.39□□□□□ -0.59
REI1P38344 YIR016WYIR016W 798 nt11.39□□□□□ -0.59
REI1P38344 HHO1YPL127C 777 nt11.39□□□□□ -0.59
REI1P38344 SNF1YDR477W 1902 nt11.39□□□□□ -0.59
REI1P38344 VPS60YDR486C 690 nt11.38□□□□□ -0.59
REI1P38344 BMT6YLR063W 1098 nt11.38□□□□□ -0.59
REI1P38344 DUS1YML080W 1272 nt11.38□□□□□ -0.59
REI1P38344 AHT1YHR093W 549 nt11.36□□□□□ -0.59
REI1P38344 CCT4YDL143W 1587 nt11.36□□□□□ -0.59
REI1P38344 BIO5YNR056C 1686 nt11.36□□□□□ -0.59
REI1P38344 ALG3YBL082C 1377 nt11.34□□□□□ -0.59
REI1P38344 NAR1YNL240C 1476 nt11.33□□□□□ -0.6
REI1P38344 XDJ1YLR090W 1380 nt11.32□□□□□ -0.6
REI1P38344 YGR259CYGR259C 441 nt11.32□□□□□ -0.6
REI1P38344 YGR201CYGR201C 678 nt11.29□□□□□ -0.6
REI1P38344 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.28□□□□□ -0.6
REI1P38344 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.28□□□□□ -0.6
REI1P38344 PBP1YGR178C 2169 nt11.27□□□□□ -0.61
REI1P38344 YKL030WYKL030W 606 nt11.26□□□□□ -0.61
REI1P38344 IRC24YIR036C 792 nt11.25□□□□□ -0.61
REI1P38344 SWC5YBR231C 912 nt11.25□□□□□ -0.61
REI1P38344 DUT1YBR252W 444 nt11.25□□□□□ -0.61
REI1P38344 STR3YGL184C 1398 nt11.24□□□□□ -0.61
REI1P38344 YPR064WYPR064W 420 nt11.22□□□□□ -0.61
REI1P38344 CYT2YKL087C 675 nt11.16□□□□□ -0.62
REI1P38344 TAD3YLR316C 969 nt11.16□□□□□ -0.62
REI1P38344 AVT6YER119C 1347 nt11.12□□□□□ -0.63
REI1P38344 GDH3YAL062W 1374 nt11.11□□□□□ -0.63
REI1P38344 AQY2YLL052C 450 nt11.1□□□□□ -0.63
REI1P38344 GOR1YNL274C 1053 nt11.1□□□□□ -0.63
REI1P38344 BDH1YAL060W 1149 nt11.08□□□□□ -0.64
REI1P38344 RPM1RPM1 483 nt11.05□□□□□ -0.64
REI1P38344 RTN2YDL204W 1182 nt11.04□□□□□ -0.64
REI1P38344 SHM2YLR058C 1410 nt11.02□□□□□ -0.64
REI1P38344 YLR415CYLR415C 339 nt11□□□□□ -0.65
REI1P38344 RTG1YOL067C 534 nt10.99□□□□□ -0.65
REI1P38344 YAT1YAR035W 2064 nt10.94□□□□□ -0.66
REI1P38344 DAT1YML113W 747 nt10.93□□□□□ -0.66
REI1P38344 YSP3YOR003W 1437 nt10.92□□□□□ -0.66
REI1P38344 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.92□□□□□ -0.66
REI1P38344 NIT1YIL164C 600 nt10.92□□□□□ -0.66
REI1P38344 TIM17YJL143W 477 nt10.91□□□□□ -0.66
REI1P38344 CMP2YML057W 1815 nt10.89□□□□□ -0.67
REI1P38344 PLB1YMR008C 1995 nt10.89□□□□□ -0.67
REI1P38344 NBP35YGL091C 987 nt10.88□□□□□ -0.67
REI1P38344 ARP6YLR085C 1317 nt10.85□□□□□ -0.67
REI1P38344 YCR102CYCR102C 1107 nt10.83□□□□□ -0.68
REI1P38344 SGT2YOR007C 1041 nt10.82□□□□□ -0.68
REI1P38344 HIF1YLL022C 1158 nt10.8□□□□□ -0.68
REI1P38344 PRM5YIL117C 957 nt10.79□□□□□ -0.68
REI1P38344 NDI1YML120C 1542 nt10.79□□□□□ -0.68
REI1P38344 HSL7YBR133C 2484 nt10.78□□□□□ -0.68
REI1P38344 YNL115CYNL115C 1935 nt10.76□□□□□ -0.69
REI1P38344 ALD4YOR374W 1560 nt10.75□□□□□ -0.69
REI1P38344 HUA1YGR268C 597 nt10.75□□□□□ -0.69
REI1P38344 MRPL8YJL063C 717 nt10.74□□□□□ -0.69
REI1P38344 UTR1YJR049C 1593 nt10.7□□□□□ -0.7
REI1P38344 PEX25YPL112C 1185 nt10.7□□□□□ -0.7
REI1P38344 RPC82YPR190C 1965 nt10.7□□□□□ -0.7
REI1P38344 SPT20YOL148C 1815 nt10.69□□□□□ -0.7
REI1P38344 CSM2YIL132C 642 nt10.65□□□□□ -0.7
REI1P38344 ADO1YJR105W 1023 nt10.65□□□□□ -0.7
REI1P38344 VPS75YNL246W 795 nt10.65□□□□□ -0.7
REI1P38344 INA1YLR413W 2028 nt10.64□□□□□ -0.71
REI1P38344 GAP1YKR039W 1809 nt10.64□□□□□ -0.71
REI1P38344 LSC2YGR244C 1284 nt10.64□□□□□ -0.71
REI1P38344 TIR3YIL011W 810 nt10.64□□□□□ -0.71
REI1P38344 SHH4YLR164W 507 nt10.64□□□□□ -0.71
REI1P38344 YFL066CYFL066C 1179 nt10.63□□□□□ -0.71
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