Protein–RNA interactions for Protein: P38138

ROT2, Glucosidase 2 subunit alpha, yeastyeast

Predictions only

Length 954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ROT2P38138 YLR235CYLR235C 399 nt10.49□□□□□ -0.73
ROT2P38138 TIM23YNR017W 669 nt10.48□□□□□ -0.73
ROT2P38138 ANP1YEL036C 1503 nt10.48□□□□□ -0.73
ROT2P38138 YJL225CYJL225C 5277 nt10.47□□□□□ -0.73
ROT2P38138 YLR179CYLR179C 606 nt10.46□□□□□ -0.73
ROT2P38138 AQY1YPR192W 918 nt10.46□□□□□ -0.73
ROT2P38138 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.44□□□□□ -0.74
ROT2P38138 STB1YNL309W 1263 nt10.44□□□□□ -0.74
ROT2P38138 FUR4YBR021W 1902 nt10.44□□□□□ -0.74
ROT2P38138 GLK1YCL040W 1503 nt10.43□□□□□ -0.74
ROT2P38138 SPC25YER018C 666 nt10.41□□□□□ -0.74
ROT2P38138 BNA2YJR078W 1362 nt10.4□□□□□ -0.74
ROT2P38138 FEN2YCR028C 1539 nt10.4□□□□□ -0.74
ROT2P38138 YKL030WYKL030W 606 nt10.37□□□□□ -0.75
ROT2P38138 GPI16YHR188C 1833 nt10.37□□□□□ -0.75
ROT2P38138 WSC2YNL283C 1512 nt10.36□□□□□ -0.75
ROT2P38138 MIC12YBR262C 321 nt10.35□□□□□ -0.75
ROT2P38138 VPS60YDR486C 690 nt10.34□□□□□ -0.75
ROT2P38138 AHT1YHR093W 549 nt10.34□□□□□ -0.75
ROT2P38138 CCT4YDL143W 1587 nt10.33□□□□□ -0.76
ROT2P38138 AGP1YCL025C 1902 nt10.33□□□□□ -0.76
ROT2P38138 YIR016WYIR016W 798 nt10.32□□□□□ -0.76
ROT2P38138 ALG3YBL082C 1377 nt10.3□□□□□ -0.76
ROT2P38138 HHO1YPL127C 777 nt10.3□□□□□ -0.76
ROT2P38138 YPR064WYPR064W 420 nt10.28□□□□□ -0.76
ROT2P38138 SWC5YBR231C 912 nt10.28□□□□□ -0.76
ROT2P38138 PRP4YPR178W 1398 nt10.26□□□□□ -0.77
ROT2P38138 DUS1YML080W 1272 nt10.26□□□□□ -0.77
ROT2P38138 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.24□□□□□ -0.77
ROT2P38138 YEL076CYEL076C 651 nt10.24□□□□□ -0.77
ROT2P38138 YLR464WYLR464W 651 nt10.24□□□□□ -0.77
ROT2P38138 TAD3YLR316C 969 nt10.21□□□□□ -0.77
ROT2P38138 DPS1YLL018C 1674 nt10.21□□□□□ -0.78
ROT2P38138 ALG12YNR030W 1656 nt10.21□□□□□ -0.78
ROT2P38138 RTG1YOL067C 534 nt10.2□□□□□ -0.78
ROT2P38138 YCL074WYCL074W 927 nt10.18□□□□□ -0.78
ROT2P38138 YKR005CYKR005C 1578 nt10.18□□□□□ -0.78
ROT2P38138 XDJ1YLR090W 1380 nt10.17□□□□□ -0.78
ROT2P38138 YGR201CYGR201C 678 nt10.17□□□□□ -0.78
ROT2P38138 DUT1YBR252W 444 nt10.17□□□□□ -0.78
ROT2P38138 AAC1YMR056C 930 nt10.15□□□□□ -0.78
ROT2P38138 UME6YDR207C 2511 nt10.15□□□□□ -0.78
ROT2P38138 BMT6YLR063W 1098 nt10.12□□□□□ -0.79
ROT2P38138 BDH1YAL060W 1149 nt10.11□□□□□ -0.79
ROT2P38138 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.11□□□□□ -0.79
ROT2P38138 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.11□□□□□ -0.79
ROT2P38138 YGR259CYGR259C 441 nt10.1□□□□□ -0.79
ROT2P38138 AVT6YER119C 1347 nt10.09□□□□□ -0.79
ROT2P38138 STR3YGL184C 1398 nt10.09□□□□□ -0.79
ROT2P38138 GDH3YAL062W 1374 nt10.09□□□□□ -0.79
ROT2P38138 YLR415CYLR415C 339 nt10.07□□□□□ -0.8
ROT2P38138 SNF1YDR477W 1902 nt10.07□□□□□ -0.8
ROT2P38138 GOR1YNL274C 1053 nt10.06□□□□□ -0.8
ROT2P38138 MCH5YOR306C 1566 nt10.05□□□□□ -0.8
ROT2P38138 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.05□□□□□ -0.8
ROT2P38138 AQY2YLL052C 450 nt10.04□□□□□ -0.8
ROT2P38138 SHM2YLR058C 1410 nt10.02□□□□□ -0.81
ROT2P38138 BIO5YNR056C 1686 nt10.02□□□□□ -0.81
ROT2P38138 HUA1YGR268C 597 nt10.01□□□□□ -0.81
ROT2P38138 YSP3YOR003W 1437 nt9.99□□□□□ -0.81
ROT2P38138 IRC24YIR036C 792 nt9.98□□□□□ -0.81
ROT2P38138 MRPL8YJL063C 717 nt9.97□□□□□ -0.81
ROT2P38138 TIM17YJL143W 477 nt9.96□□□□□ -0.82
ROT2P38138 NAR1YNL240C 1476 nt9.96□□□□□ -0.82
ROT2P38138 ADO1YJR105W 1023 nt9.92□□□□□ -0.82
ROT2P38138 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.92□□□□□ -0.82
ROT2P38138 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.92□□□□□ -0.82
ROT2P38138 NIT1YIL164C 600 nt9.91□□□□□ -0.82
ROT2P38138 YNL115CYNL115C 1935 nt9.9□□□□□ -0.82
ROT2P38138 PBP1YGR178C 2169 nt9.87□□□□□ -0.83
ROT2P38138 RTN2YDL204W 1182 nt9.87□□□□□ -0.83
ROT2P38138 SGT2YOR007C 1041 nt9.87□□□□□ -0.83
ROT2P38138 DAT1YML113W 747 nt9.86□□□□□ -0.83
ROT2P38138 YFL066CYFL066C 1179 nt9.83□□□□□ -0.84
ROT2P38138 PEX25YPL112C 1185 nt9.83□□□□□ -0.84
ROT2P38138 NBP35YGL091C 987 nt9.82□□□□□ -0.84
ROT2P38138 YCR102CYCR102C 1107 nt9.81□□□□□ -0.84
ROT2P38138 CYT2YKL087C 675 nt9.81□□□□□ -0.84
ROT2P38138 PLB1YMR008C 1995 nt9.79□□□□□ -0.84
ROT2P38138 VPS75YNL246W 795 nt9.75□□□□□ -0.85
ROT2P38138 ARP6YLR085C 1317 nt9.74□□□□□ -0.85
ROT2P38138 YFR018CYFR018C 1092 nt9.69□□□□□ -0.86
ROT2P38138 PRM5YIL117C 957 nt9.68□□□□□ -0.86
ROT2P38138 PRE6YOL038W 765 nt9.68□□□□□ -0.86
ROT2P38138 SHH4YLR164W 507 nt9.66□□□□□ -0.86
ROT2P38138 PAU7YAR020C 168 nt9.64□□□□□ -0.87
ROT2P38138 YAT1YAR035W 2064 nt9.63□□□□□ -0.87
ROT2P38138 TIR3YIL011W 810 nt9.63□□□□□ -0.87
ROT2P38138 HIF1YLL022C 1158 nt9.63□□□□□ -0.87
ROT2P38138 UTR1YJR049C 1593 nt9.63□□□□□ -0.87
ROT2P38138 PRO1YDR300C 1287 nt9.61□□□□□ -0.87
ROT2P38138 ALD4YOR374W 1560 nt9.61□□□□□ -0.87
ROT2P38138 GAP1YKR039W 1809 nt9.61□□□□□ -0.87
ROT2P38138 LSC2YGR244C 1284 nt9.58□□□□□ -0.88
ROT2P38138 YDR010CYDR010C 333 nt9.57□□□□□ -0.88
ROT2P38138 SHB17YKR043C 816 nt9.57□□□□□ -0.88
ROT2P38138 POM34YLR018C 900 nt9.55□□□□□ -0.88
ROT2P38138 CMP2YML057W 1815 nt9.54□□□□□ -0.88
ROT2P38138 YDR094WYDR094W 336 nt9.54□□□□□ -0.88
ROT2P38138 SFA1YDL168W 1161 nt9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.3 ms