Protein–RNA interactions for Protein: P36130

CAF4, CCR4-associated factor 4, yeastyeast

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CAF4P36130 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.61□□□□□ -0.71
CAF4P36130 YKL030WYKL030W 606 nt10.6□□□□□ -0.71
CAF4P36130 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.57□□□□□ -0.72
CAF4P36130 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.57□□□□□ -0.72
CAF4P36130 RAX1YOR301W 1308 nt10.57□□□□□ -0.72
CAF4P36130 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.56□□□□□ -0.72
CAF4P36130 STB1YNL309W 1263 nt10.56□□□□□ -0.72
CAF4P36130 ANP1YEL036C 1503 nt10.55□□□□□ -0.72
CAF4P36130 SPC25YER018C 666 nt10.53□□□□□ -0.72
CAF4P36130 WSC2YNL283C 1512 nt10.51□□□□□ -0.73
CAF4P36130 GPI16YHR188C 1833 nt10.51□□□□□ -0.73
CAF4P36130 AHT1YHR093W 549 nt10.5□□□□□ -0.73
CAF4P36130 RTG1YOL067C 534 nt10.5□□□□□ -0.73
CAF4P36130 FEN2YCR028C 1539 nt10.49□□□□□ -0.73
CAF4P36130 BNA2YJR078W 1362 nt10.49□□□□□ -0.73
CAF4P36130 CCA1YER168C 1641 nt10.48□□□□□ -0.73
CAF4P36130 YPR064WYPR064W 420 nt10.48□□□□□ -0.73
CAF4P36130 CCT4YDL143W 1587 nt10.46□□□□□ -0.74
CAF4P36130 VPS60YDR486C 690 nt10.45□□□□□ -0.74
CAF4P36130 SWC5YBR231C 912 nt10.43□□□□□ -0.74
CAF4P36130 BOR1YNL275W 1731 nt10.42□□□□□ -0.74
CAF4P36130 TAD3YLR316C 969 nt10.41□□□□□ -0.74
CAF4P36130 ALG3YBL082C 1377 nt10.4□□□□□ -0.74
CAF4P36130 YIR016WYIR016W 798 nt10.4□□□□□ -0.74
CAF4P36130 MIC12YBR262C 321 nt10.4□□□□□ -0.74
CAF4P36130 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.37□□□□□ -0.75
CAF4P36130 YEL076CYEL076C 651 nt10.37□□□□□ -0.75
CAF4P36130 YLR464WYLR464W 651 nt10.37□□□□□ -0.75
CAF4P36130 FUR4YBR021W 1902 nt10.36□□□□□ -0.75
CAF4P36130 HSP60YLR259C 1719 nt10.36□□□□□ -0.75
CAF4P36130 HHO1YPL127C 777 nt10.35□□□□□ -0.75
CAF4P36130 HUA1YGR268C 597 nt10.33□□□□□ -0.76
CAF4P36130 AGP1YCL025C 1902 nt10.31□□□□□ -0.76
CAF4P36130 GLK1YCL040W 1503 nt10.31□□□□□ -0.76
CAF4P36130 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.3□□□□□ -0.76
CAF4P36130 Q0182Q0182 405 nt10.3□□□□□ -0.76
CAF4P36130 MRPL8YJL063C 717 nt10.29□□□□□ -0.76
CAF4P36130 RPM1RPM1 483 nt10.29□□□□□ -0.76
CAF4P36130 BDH1YAL060W 1149 nt10.27□□□□□ -0.77
CAF4P36130 DUS1YML080W 1272 nt10.27□□□□□ -0.77
CAF4P36130 YGR201CYGR201C 678 nt10.26□□□□□ -0.77
CAF4P36130 ADO1YJR105W 1023 nt10.26□□□□□ -0.77
CAF4P36130 YLR415CYLR415C 339 nt10.26□□□□□ -0.77
CAF4P36130 XDJ1YLR090W 1380 nt10.23□□□□□ -0.77
CAF4P36130 YCL074WYCL074W 927 nt10.19□□□□□ -0.78
CAF4P36130 GDH3YAL062W 1374 nt10.18□□□□□ -0.78
CAF4P36130 AVT6YER119C 1347 nt10.18□□□□□ -0.78
CAF4P36130 PRP4YPR178W 1398 nt10.17□□□□□ -0.78
CAF4P36130 DUT1YBR252W 444 nt10.17□□□□□ -0.78
CAF4P36130 YSP3YOR003W 1437 nt10.16□□□□□ -0.78
CAF4P36130 GOR1YNL274C 1053 nt10.14□□□□□ -0.79
CAF4P36130 SHM2YLR058C 1410 nt10.14□□□□□ -0.79
CAF4P36130 TIM17YJL143W 477 nt10.13□□□□□ -0.79
CAF4P36130 YKR005CYKR005C 1578 nt10.12□□□□□ -0.79
CAF4P36130 DPS1YLL018C 1674 nt10.11□□□□□ -0.79
CAF4P36130 STR3YGL184C 1398 nt10.09□□□□□ -0.79
CAF4P36130 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.09□□□□□ -0.79
CAF4P36130 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.09□□□□□ -0.79
CAF4P36130 YNL115CYNL115C 1935 nt10.09□□□□□ -0.79
CAF4P36130 BMT6YLR063W 1098 nt10.08□□□□□ -0.8
CAF4P36130 AQY2YLL052C 450 nt10.07□□□□□ -0.8
CAF4P36130 MCH5YOR306C 1566 nt10.06□□□□□ -0.8
CAF4P36130 YGR259CYGR259C 441 nt10.06□□□□□ -0.8
CAF4P36130 PEX25YPL112C 1185 nt10.06□□□□□ -0.8
CAF4P36130 AAC1YMR056C 930 nt10.05□□□□□ -0.8
CAF4P36130 YFL066CYFL066C 1179 nt10.02□□□□□ -0.81
CAF4P36130 NIT1YIL164C 600 nt10.02□□□□□ -0.81
CAF4P36130 ALG12YNR030W 1656 nt10.01□□□□□ -0.81
CAF4P36130 SGT2YOR007C 1041 nt10□□□□□ -0.81
CAF4P36130 YFR018CYFR018C 1092 nt9.98□□□□□ -0.81
CAF4P36130 DAT1YML113W 747 nt9.98□□□□□ -0.81
CAF4P36130 VPS75YNL246W 795 nt9.97□□□□□ -0.81
CAF4P36130 SNF1YDR477W 1902 nt9.94□□□□□ -0.82
CAF4P36130 YCR102CYCR102C 1107 nt9.93□□□□□ -0.82
CAF4P36130 RTN2YDL204W 1182 nt9.93□□□□□ -0.82
CAF4P36130 PRE6YOL038W 765 nt9.93□□□□□ -0.82
CAF4P36130 IRC24YIR036C 792 nt9.92□□□□□ -0.82
CAF4P36130 NBP35YGL091C 987 nt9.88□□□□□ -0.83
CAF4P36130 BIO5YNR056C 1686 nt9.87□□□□□ -0.83
CAF4P36130 YDR094WYDR094W 336 nt9.87□□□□□ -0.83
CAF4P36130 PAU7YAR020C 168 nt9.85□□□□□ -0.83
CAF4P36130 RRT5YFR032C 870 nt9.82□□□□□ -0.84
CAF4P36130 PLB1YMR008C 1995 nt9.79□□□□□ -0.84
CAF4P36130 NAR1YNL240C 1476 nt9.79□□□□□ -0.84
CAF4P36130 ARP6YLR085C 1317 nt9.78□□□□□ -0.84
CAF4P36130 PAU16YKL224C 372 nt9.77□□□□□ -0.85
CAF4P36130 SHB17YKR043C 816 nt9.76□□□□□ -0.85
CAF4P36130 TIR3YIL011W 810 nt9.75□□□□□ -0.85
CAF4P36130 UBX6YJL048C 1191 nt9.75□□□□□ -0.85
CAF4P36130 YDR010CYDR010C 333 nt9.74□□□□□ -0.85
CAF4P36130 MIR1YJR077C 936 nt9.74□□□□□ -0.85
CAF4P36130 SHH4YLR164W 507 nt9.74□□□□□ -0.85
CAF4P36130 PBP1YGR178C 2169 nt9.69□□□□□ -0.86
CAF4P36130 LSC2YGR244C 1284 nt9.69□□□□□ -0.86
CAF4P36130 PRO1YDR300C 1287 nt9.68□□□□□ -0.86
CAF4P36130 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.67□□□□□ -0.86
CAF4P36130 PRM5YIL117C 957 nt9.67□□□□□ -0.86
CAF4P36130 CYT2YKL087C 675 nt9.67□□□□□ -0.86
CAF4P36130 GAP1YKR039W 1809 nt9.66□□□□□ -0.86
CAF4P36130 UBA4YHR111W 1323 nt9.66□□□□□ -0.86
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