Protein–RNA interactions for Protein: P28737

MSP1, Protein MSP1, yeastyeast

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSP1P28737 DDR2YOL052C-A 186 nt12.58□□□□□ -0.4
MSP1P28737 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.54□□□□□ -0.4
MSP1P28737 YEL076CYEL076C 651 nt12.54□□□□□ -0.4
MSP1P28737 YLR464WYLR464W 651 nt12.54□□□□□ -0.4
MSP1P28737 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.53□□□□□ -0.4
MSP1P28737 DPS1YLL018C 1674 nt12.51□□□□□ -0.41
MSP1P28737 AAC1YMR056C 930 nt12.49□□□□□ -0.41
MSP1P28737 ANP1YEL036C 1503 nt12.48□□□□□ -0.41
MSP1P28737 AGP1YCL025C 1902 nt12.48□□□□□ -0.41
MSP1P28737 Q0182Q0182 405 nt12.47□□□□□ -0.41
MSP1P28737 BNA2YJR078W 1362 nt12.45□□□□□ -0.42
MSP1P28737 YKR005CYKR005C 1578 nt12.43□□□□□ -0.42
MSP1P28737 PTH1YHR189W 573 nt12.42□□□□□ -0.42
MSP1P28737 MIC12YBR262C 321 nt12.42□□□□□ -0.42
MSP1P28737 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.4□□□□□ -0.42
MSP1P28737 STB1YNL309W 1263 nt12.4□□□□□ -0.42
MSP1P28737 SNF1YDR477W 1902 nt12.39□□□□□ -0.43
MSP1P28737 DUS1YML080W 1272 nt12.39□□□□□ -0.43
MSP1P28737 NAR1YNL240C 1476 nt12.39□□□□□ -0.43
MSP1P28737 BIO5YNR056C 1686 nt12.38□□□□□ -0.43
MSP1P28737 FEN2YCR028C 1539 nt12.37□□□□□ -0.43
MSP1P28737 AQY1YPR192W 918 nt12.37□□□□□ -0.43
MSP1P28737 WSC2YNL283C 1512 nt12.37□□□□□ -0.43
MSP1P28737 BMT6YLR063W 1098 nt12.36□□□□□ -0.43
MSP1P28737 SPC25YER018C 666 nt12.34□□□□□ -0.43
MSP1P28737 YCL074WYCL074W 927 nt12.33□□□□□ -0.44
MSP1P28737 TIM23YNR017W 669 nt12.32□□□□□ -0.44
MSP1P28737 HHO1YPL127C 777 nt12.32□□□□□ -0.44
MSP1P28737 YLR179CYLR179C 606 nt12.31□□□□□ -0.44
MSP1P28737 SPP1YPL138C 1062 nt12.31□□□□□ -0.44
MSP1P28737 YGR259CYGR259C 441 nt12.29□□□□□ -0.44
MSP1P28737 GPI16YHR188C 1833 nt12.28□□□□□ -0.44
MSP1P28737 VPS60YDR486C 690 nt12.28□□□□□ -0.44
MSP1P28737 YIR016WYIR016W 798 nt12.28□□□□□ -0.44
MSP1P28737 ALG3YBL082C 1377 nt12.25□□□□□ -0.45
MSP1P28737 YLR235CYLR235C 399 nt12.24□□□□□ -0.45
MSP1P28737 DUT1YBR252W 444 nt12.24□□□□□ -0.45
MSP1P28737 XDJ1YLR090W 1380 nt12.23□□□□□ -0.45
MSP1P28737 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.23□□□□□ -0.45
MSP1P28737 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.23□□□□□ -0.45
MSP1P28737 CCT4YDL143W 1587 nt12.22□□□□□ -0.45
MSP1P28737 PBP1YGR178C 2169 nt12.22□□□□□ -0.45
MSP1P28737 YJL225CYJL225C 5277 nt12.2□□□□□ -0.46
MSP1P28737 IRC24YIR036C 792 nt12.18□□□□□ -0.46
MSP1P28737 AHT1YHR093W 549 nt12.17□□□□□ -0.46
MSP1P28737 STR3YGL184C 1398 nt12.17□□□□□ -0.46
MSP1P28737 SWC5YBR231C 912 nt12.15□□□□□ -0.46
MSP1P28737 YGR201CYGR201C 678 nt12.14□□□□□ -0.47
MSP1P28737 CYT2YKL087C 675 nt12.14□□□□□ -0.47
MSP1P28737 YKL030WYKL030W 606 nt12.08□□□□□ -0.48
MSP1P28737 AQY2YLL052C 450 nt12.07□□□□□ -0.48
MSP1P28737 YPR064WYPR064W 420 nt12.04□□□□□ -0.48
MSP1P28737 AVT6YER119C 1347 nt12.04□□□□□ -0.48
MSP1P28737 GOR1YNL274C 1053 nt12□□□□□ -0.49
MSP1P28737 GDH3YAL062W 1374 nt12□□□□□ -0.49
MSP1P28737 TAD3YLR316C 969 nt11.97□□□□□ -0.49
MSP1P28737 YAT1YAR035W 2064 nt11.95□□□□□ -0.5
MSP1P28737 MOT3YMR070W 1473 nt11.93□□□□□ -0.5
MSP1P28737 RTN2YDL204W 1182 nt11.92□□□□□ -0.5
MSP1P28737 CMP2YML057W 1815 nt11.9□□□□□ -0.5
MSP1P28737 BDH1YAL060W 1149 nt11.89□□□□□ -0.51
MSP1P28737 SHM2YLR058C 1410 nt11.88□□□□□ -0.51
MSP1P28737 YLR415CYLR415C 339 nt11.81□□□□□ -0.52
MSP1P28737 PLB1YMR008C 1995 nt11.78□□□□□ -0.52
MSP1P28737 NIT1YIL164C 600 nt11.76□□□□□ -0.53
MSP1P28737 TIM17YJL143W 477 nt11.74□□□□□ -0.53
MSP1P28737 RTG1YOL067C 534 nt11.74□□□□□ -0.53
MSP1P28737 PRM5YIL117C 957 nt11.73□□□□□ -0.53
MSP1P28737 DAT1YML113W 747 nt11.73□□□□□ -0.53
MSP1P28737 NBP35YGL091C 987 nt11.72□□□□□ -0.53
MSP1P28737 HIF1YLL022C 1158 nt11.72□□□□□ -0.53
MSP1P28737 NDI1YML120C 1542 nt11.71□□□□□ -0.53
MSP1P28737 HSL7YBR133C 2484 nt11.7□□□□□ -0.54
MSP1P28737 YSP3YOR003W 1437 nt11.7□□□□□ -0.54
MSP1P28737 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.69□□□□□ -0.54
MSP1P28737 SGT2YOR007C 1041 nt11.68□□□□□ -0.54
MSP1P28737 ARP6YLR085C 1317 nt11.67□□□□□ -0.54
MSP1P28737 YCR102CYCR102C 1107 nt11.65□□□□□ -0.54
MSP1P28737 ALD4YOR374W 1560 nt11.64□□□□□ -0.55
MSP1P28737 RPC82YPR190C 1965 nt11.63□□□□□ -0.55
MSP1P28737 SPT20YOL148C 1815 nt11.61□□□□□ -0.55
MSP1P28737 UTR1YJR049C 1593 nt11.58□□□□□ -0.55
MSP1P28737 YNL115CYNL115C 1935 nt11.58□□□□□ -0.56
MSP1P28737 INA1YLR413W 2028 nt11.57□□□□□ -0.56
MSP1P28737 SHH4YLR164W 507 nt11.5□□□□□ -0.57
MSP1P28737 GAP1YKR039W 1809 nt11.49□□□□□ -0.57
MSP1P28737 HUA1YGR268C 597 nt11.47□□□□□ -0.57
MSP1P28737 PEX25YPL112C 1185 nt11.47□□□□□ -0.57
MSP1P28737 PRO1YDR300C 1287 nt11.45□□□□□ -0.58
MSP1P28737 YFL066CYFL066C 1179 nt11.45□□□□□ -0.58
MSP1P28737 TIR3YIL011W 810 nt11.44□□□□□ -0.58
MSP1P28737 LSC2YGR244C 1284 nt11.41□□□□□ -0.58
MSP1P28737 ZRT3YKL175W 1512 nt11.4□□□□□ -0.58
MSP1P28737 VPS75YNL246W 795 nt11.39□□□□□ -0.59
MSP1P28737 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.38□□□□□ -0.59
MSP1P28737 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.38□□□□□ -0.59
MSP1P28737 SAM35YHR083W 990 nt11.37□□□□□ -0.59
MSP1P28737 YJL067WYJL067W 351 nt11.36□□□□□ -0.59
MSP1P28737 POM34YLR018C 900 nt11.36□□□□□ -0.59
MSP1P28737 MUP1YGR055W 1725 nt11.35□□□□□ -0.59
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