Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a9P28571 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a9P28571 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a9P28571 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a9P28571 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc6a9P28571 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc6a9P28571 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc6a9P28571 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a9P28571 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc6a9P28571 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc6a9P28571 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc6a9P28571 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc6a9P28571 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a9P28571 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc6a9P28571 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc6a9P28571 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc6a9P28571 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a9P28571 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc6a9P28571 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc6a9P28571 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a9P28571 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc6a9P28571 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a9P28571 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a9P28571 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a9P28571 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc6a9P28571 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc6a9P28571 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a9P28571 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc6a9P28571 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a9P28571 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a9P28571 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc6a9P28571 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc6a9P28571 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc6a9P28571 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc6a9P28571 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc6a9P28571 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc6a9P28571 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc6a9P28571 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc6a9P28571 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc6a9P28571 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc6a9P28571 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc6a9P28571 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc6a9P28571 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc6a9P28571 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc6a9P28571 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc6a9P28571 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc6a9P28571 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc6a9P28571 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc6a9P28571 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc6a9P28571 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc6a9P28571 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc6a9P28571 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc6a9P28571 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc6a9P28571 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc6a9P28571 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc6a9P28571 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc6a9P28571 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc6a9P28571 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc6a9P28571 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc6a9P28571 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc6a9P28571 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc6a9P28571 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc6a9P28571 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc6a9P28571 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc6a9P28571 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc6a9P28571 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc6a9P28571 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc6a9P28571 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc6a9P28571 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc6a9P28571 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc6a9P28571 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc6a9P28571 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc6a9P28571 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc6a9P28571 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc6a9P28571 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc6a9P28571 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc6a9P28571 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc6a9P28571 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc6a9P28571 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc6a9P28571 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc6a9P28571 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms