Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEC31AO94979 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEC31AO94979 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEC31AO94979 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEC31AO94979 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEC31AO94979 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEC31AO94979 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SEC31AO94979 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEC31AO94979 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEC31AO94979 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEC31AO94979 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEC31AO94979 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SEC31AO94979 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SEC31AO94979 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEC31AO94979 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEC31AO94979 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC31AO94979 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEC31AO94979 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEC31AO94979 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC31AO94979 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC31AO94979 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEC31AO94979 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC31AO94979 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEC31AO94979 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEC31AO94979 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC31AO94979 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEC31AO94979 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEC31AO94979 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEC31AO94979 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC31AO94979 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEC31AO94979 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEC31AO94979 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC31AO94979 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC31AO94979 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEC31AO94979 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC31AO94979 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SEC31AO94979 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SEC31AO94979 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEC31AO94979 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC31AO94979 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC31AO94979 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC31AO94979 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC31AO94979 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC31AO94979 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC31AO94979 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC31AO94979 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC31AO94979 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC31AO94979 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC31AO94979 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC31AO94979 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC31AO94979 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC31AO94979 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC31AO94979 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC31AO94979 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC31AO94979 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC31AO94979 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC31AO94979 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEC31AO94979 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SEC31AO94979 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEC31AO94979 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC31AO94979 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC31AO94979 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC31AO94979 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC31AO94979 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC31AO94979 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC31AO94979 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC31AO94979 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC31AO94979 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC31AO94979 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC31AO94979 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC31AO94979 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC31AO94979 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC31AO94979 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC31AO94979 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC31AO94979 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SEC31AO94979 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC31AO94979 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEC31AO94979 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC31AO94979 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC31AO94979 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEC31AO94979 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEC31AO94979 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC31AO94979 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC31AO94979 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEC31AO94979 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEC31AO94979 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC31AO94979 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC31AO94979 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC31AO94979 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC31AO94979 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC31AO94979 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC31AO94979 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC31AO94979 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC31AO94979 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC31AO94979 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC31AO94979 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SEC31AO94979 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC31AO94979 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC31AO94979 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC31AO94979 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms