Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ptpn9O35239 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ptpn9O35239 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ptpn9O35239 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ptpn9O35239 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ptpn9O35239 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ptpn9O35239 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ptpn9O35239 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ptpn9O35239 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ptpn9O35239 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ptpn9O35239 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ptpn9O35239 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ptpn9O35239 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ptpn9O35239 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ptpn9O35239 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ptpn9O35239 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ptpn9O35239 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ptpn9O35239 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ptpn9O35239 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ptpn9O35239 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ptpn9O35239 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ptpn9O35239 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptpn9O35239 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptpn9O35239 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptpn9O35239 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ptpn9O35239 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ptpn9O35239 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpn9O35239 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpn9O35239 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ptpn9O35239 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ptpn9O35239 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ptpn9O35239 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ptpn9O35239 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ptpn9O35239 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptpn9O35239 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptpn9O35239 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ptpn9O35239 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ptpn9O35239 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptpn9O35239 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptpn9O35239 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptpn9O35239 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ptpn9O35239 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ptpn9O35239 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptpn9O35239 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptpn9O35239 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptpn9O35239 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ptpn9O35239 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ptpn9O35239 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ptpn9O35239 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ptpn9O35239 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptpn9O35239 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ptpn9O35239 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ptpn9O35239 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ptpn9O35239 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ptpn9O35239 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ptpn9O35239 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ptpn9O35239 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ptpn9O35239 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptpn9O35239 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptpn9O35239 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ptpn9O35239 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ptpn9O35239 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ptpn9O35239 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ptpn9O35239 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ptpn9O35239 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptpn9O35239 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptpn9O35239 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ptpn9O35239 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptpn9O35239 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ptpn9O35239 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpn9O35239 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ptpn9O35239 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ptpn9O35239 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpn9O35239 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
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