Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Ptpn9O35239 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ptpn9O35239 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ptpn9O35239 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ptpn9O35239 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ptpn9O35239 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ptpn9O35239 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Ptpn9O35239 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Ptpn9O35239 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ptpn9O35239 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Ptpn9O35239 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Ptpn9O35239 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ptpn9O35239 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Ptpn9O35239 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ptpn9O35239 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ptpn9O35239 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ptpn9O35239 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Ptpn9O35239 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ptpn9O35239 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ptpn9O35239 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ptpn9O35239 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ptpn9O35239 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ptpn9O35239 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ptpn9O35239 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ptpn9O35239 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ptpn9O35239 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Ptpn9O35239 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ptpn9O35239 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ptpn9O35239 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ptpn9O35239 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ptpn9O35239 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ptpn9O35239 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ptpn9O35239 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Ptpn9O35239 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ptpn9O35239 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ptpn9O35239 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ptpn9O35239 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ptpn9O35239 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ptpn9O35239 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ptpn9O35239 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ptpn9O35239 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ptpn9O35239 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ptpn9O35239 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ptpn9O35239 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ptpn9O35239 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ptpn9O35239 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ptpn9O35239 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Ptpn9O35239 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ptpn9O35239 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ptpn9O35239 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ptpn9O35239 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ptpn9O35239 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ptpn9O35239 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ptpn9O35239 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Ptpn9O35239 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ptpn9O35239 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ptpn9O35239 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ptpn9O35239 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ptpn9O35239 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ptpn9O35239 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Ptpn9O35239 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ptpn9O35239 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ptpn9O35239 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ptpn9O35239 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ptpn9O35239 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ptpn9O35239 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ptpn9O35239 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ptpn9O35239 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ptpn9O35239 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ptpn9O35239 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ptpn9O35239 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Ptpn9O35239 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ptpn9O35239 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ptpn9O35239 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ptpn9O35239 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ptpn9O35239 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ptpn9O35239 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ptpn9O35239 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ptpn9O35239 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ptpn9O35239 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ptpn9O35239 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ptpn9O35239 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ptpn9O35239 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ptpn9O35239 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ptpn9O35239 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ptpn9O35239 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ptpn9O35239 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ptpn9O35239 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ptpn9O35239 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ptpn9O35239 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ptpn9O35239 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ptpn9O35239 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ptpn9O35239 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ptpn9O35239 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ptpn9O35239 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ptpn9O35239 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ptpn9O35239 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ptpn9O35239 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ptpn9O35239 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ptpn9O35239 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms