Protein–RNA interactions for Protein: G3X941

9130019O22Rik, MCG142067, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130019O22RikG3X941 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
9130019O22RikG3X941 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,73■■□□□ 1,23
9130019O22RikG3X941 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
9130019O22RikG3X941 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
9130019O22RikG3X941 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
9130019O22RikG3X941 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22,7■■□□□ 1,22
9130019O22RikG3X941 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
9130019O22RikG3X941 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,67■■□□□ 1,22
9130019O22RikG3X941 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
9130019O22RikG3X941 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
9130019O22RikG3X941 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
9130019O22RikG3X941 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
9130019O22RikG3X941 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22,57■■□□□ 1,2
9130019O22RikG3X941 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
9130019O22RikG3X941 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
9130019O22RikG3X941 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
9130019O22RikG3X941 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
9130019O22RikG3X941 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
9130019O22RikG3X941 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
9130019O22RikG3X941 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22,52■■□□□ 1,2
9130019O22RikG3X941 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
9130019O22RikG3X941 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,52■■□□□ 1,2
9130019O22RikG3X941 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
9130019O22RikG3X941 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
9130019O22RikG3X941 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
9130019O22RikG3X941 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
9130019O22RikG3X941 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
9130019O22RikG3X941 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,48■■□□□ 1,19
9130019O22RikG3X941 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
9130019O22RikG3X941 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
9130019O22RikG3X941 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
9130019O22RikG3X941 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22,45■■□□□ 1,18
9130019O22RikG3X941 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
9130019O22RikG3X941 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
9130019O22RikG3X941 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
9130019O22RikG3X941 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
9130019O22RikG3X941 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22,41■■□□□ 1,18
9130019O22RikG3X941 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
9130019O22RikG3X941 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
9130019O22RikG3X941 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
9130019O22RikG3X941 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
9130019O22RikG3X941 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22,37■■□□□ 1,17
9130019O22RikG3X941 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
9130019O22RikG3X941 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22,35■■□□□ 1,17
9130019O22RikG3X941 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
9130019O22RikG3X941 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,33■■□□□ 1,17
9130019O22RikG3X941 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
9130019O22RikG3X941 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
9130019O22RikG3X941 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22,33■■□□□ 1,16
9130019O22RikG3X941 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
9130019O22RikG3X941 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
9130019O22RikG3X941 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
9130019O22RikG3X941 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22,29■■□□□ 1,16
9130019O22RikG3X941 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
9130019O22RikG3X941 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
9130019O22RikG3X941 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
9130019O22RikG3X941 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
9130019O22RikG3X941 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
9130019O22RikG3X941 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
9130019O22RikG3X941 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,22■■□□□ 1,15
9130019O22RikG3X941 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,21■■□□□ 1,15
9130019O22RikG3X941 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,17■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22,16■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,16■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22,15■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
9130019O22RikG3X941 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22,12■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22,09■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
9130019O22RikG3X941 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,08■■□□□ 1,12
9130019O22RikG3X941 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
9130019O22RikG3X941 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
9130019O22RikG3X941 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
9130019O22RikG3X941 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
9130019O22RikG3X941 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
9130019O22RikG3X941 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,5 ms