Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0K6

Rsbn1l, MCG120108, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsbn1lD3Z0K6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rsbn1lD3Z0K6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rsbn1lD3Z0K6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rsbn1lD3Z0K6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rsbn1lD3Z0K6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rsbn1lD3Z0K6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rsbn1lD3Z0K6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rsbn1lD3Z0K6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rsbn1lD3Z0K6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rsbn1lD3Z0K6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rsbn1lD3Z0K6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Rsbn1lD3Z0K6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Rsbn1lD3Z0K6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rsbn1lD3Z0K6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsbn1lD3Z0K6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsbn1lD3Z0K6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsbn1lD3Z0K6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsbn1lD3Z0K6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsbn1lD3Z0K6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rsbn1lD3Z0K6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rsbn1lD3Z0K6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rsbn1lD3Z0K6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsbn1lD3Z0K6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsbn1lD3Z0K6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rsbn1lD3Z0K6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rsbn1lD3Z0K6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Rsbn1lD3Z0K6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsbn1lD3Z0K6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rsbn1lD3Z0K6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsbn1lD3Z0K6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rsbn1lD3Z0K6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Rsbn1lD3Z0K6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsbn1lD3Z0K6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rsbn1lD3Z0K6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rsbn1lD3Z0K6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rsbn1lD3Z0K6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rsbn1lD3Z0K6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsbn1lD3Z0K6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rsbn1lD3Z0K6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rsbn1lD3Z0K6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rsbn1lD3Z0K6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rsbn1lD3Z0K6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rsbn1lD3Z0K6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rsbn1lD3Z0K6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rsbn1lD3Z0K6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rsbn1lD3Z0K6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rsbn1lD3Z0K6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rsbn1lD3Z0K6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rsbn1lD3Z0K6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsbn1lD3Z0K6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsbn1lD3Z0K6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rsbn1lD3Z0K6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rsbn1lD3Z0K6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rsbn1lD3Z0K6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsbn1lD3Z0K6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsbn1lD3Z0K6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rsbn1lD3Z0K6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rsbn1lD3Z0K6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rsbn1lD3Z0K6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rsbn1lD3Z0K6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rsbn1lD3Z0K6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rsbn1lD3Z0K6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rsbn1lD3Z0K6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsbn1lD3Z0K6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsbn1lD3Z0K6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rsbn1lD3Z0K6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsbn1lD3Z0K6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsbn1lD3Z0K6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsbn1lD3Z0K6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsbn1lD3Z0K6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsbn1lD3Z0K6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsbn1lD3Z0K6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsbn1lD3Z0K6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsbn1lD3Z0K6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsbn1lD3Z0K6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsbn1lD3Z0K6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsbn1lD3Z0K6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsbn1lD3Z0K6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rsbn1lD3Z0K6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rsbn1lD3Z0K6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rsbn1lD3Z0K6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rsbn1lD3Z0K6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsbn1lD3Z0K6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsbn1lD3Z0K6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rsbn1lD3Z0K6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rsbn1lD3Z0K6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rsbn1lD3Z0K6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms