Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC048679D3YXE9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC048679D3YXE9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC048679D3YXE9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC048679D3YXE9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BC048679D3YXE9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BC048679D3YXE9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC048679D3YXE9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC048679D3YXE9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC048679D3YXE9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC048679D3YXE9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC048679D3YXE9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BC048679D3YXE9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC048679D3YXE9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BC048679D3YXE9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC048679D3YXE9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC048679D3YXE9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC048679D3YXE9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC048679D3YXE9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC048679D3YXE9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC048679D3YXE9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC048679D3YXE9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BC048679D3YXE9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC048679D3YXE9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC048679D3YXE9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BC048679D3YXE9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC048679D3YXE9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC048679D3YXE9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC048679D3YXE9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC048679D3YXE9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC048679D3YXE9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC048679D3YXE9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC048679D3YXE9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC048679D3YXE9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC048679D3YXE9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BC048679D3YXE9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC048679D3YXE9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BC048679D3YXE9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BC048679D3YXE9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BC048679D3YXE9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC048679D3YXE9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BC048679D3YXE9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BC048679D3YXE9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BC048679D3YXE9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BC048679D3YXE9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BC048679D3YXE9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BC048679D3YXE9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC048679D3YXE9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BC048679D3YXE9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC048679D3YXE9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BC048679D3YXE9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BC048679D3YXE9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BC048679D3YXE9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BC048679D3YXE9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC048679D3YXE9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC048679D3YXE9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC048679D3YXE9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BC048679D3YXE9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC048679D3YXE9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BC048679D3YXE9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BC048679D3YXE9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC048679D3YXE9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC048679D3YXE9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC048679D3YXE9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC048679D3YXE9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC048679D3YXE9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC048679D3YXE9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC048679D3YXE9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC048679D3YXE9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC048679D3YXE9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BC048679D3YXE9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC048679D3YXE9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC048679D3YXE9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BC048679D3YXE9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BC048679D3YXE9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BC048679D3YXE9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BC048679D3YXE9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BC048679D3YXE9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BC048679D3YXE9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC048679D3YXE9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BC048679D3YXE9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC048679D3YXE9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC048679D3YXE9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BC048679D3YXE9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC048679D3YXE9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC048679D3YXE9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BC048679D3YXE9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms