Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms