Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SGCZQ96LD1 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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