Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms