Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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RNF182Q8N6D2 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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RNF182Q8N6D2 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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RNF182Q8N6D2 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF182Q8N6D2 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF182Q8N6D2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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