Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms