Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DUX4L9Q6RFH8 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms