Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TAF11Q15544 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TAF11Q15544 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms