Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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