Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HERC3Q15034 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HERC3Q15034 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HERC3Q15034 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HERC3Q15034 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERC3Q15034 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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